Protein–RNA interactions for Protein: B1AMM8

LINC00587, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00587, humanhuman

Predictions only

Length 73 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00587B1AMM8 IFNA7-201ENST00000239347 737 ntAPPRIS P1 BASIC4.26□□□□□ -1.73
LINC00587B1AMM8 ADK-201ENST00000286621 1169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
LINC00587B1AMM8 OR52A1-201ENST00000328942 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.26□□□□□ -1.73
LINC00587B1AMM8 ENSA-207ENST00000362052 703 ntTSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
LINC00587B1AMM8 RNA5SP513-201ENST00000364648 118 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
LINC00587B1AMM8 RN7SKP189-201ENST00000365042 330 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
LINC00587B1AMM8 TCTE3-201ENST00000366774 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
LINC00587B1AMM8 TRAV6-201ENST00000390428 404 ntAPPRIS P1 BASIC4.26□□□□□ -1.73
LINC00587B1AMM8 AC090114.1-201ENST00000393266 448 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
LINC00587B1AMM8 PSG11-203ENST00000403486 1163 ntTSL 2 BASIC4.26□□□□□ -1.73
LINC00587B1AMM8 AL139039.2-201ENST00000407436 479 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
LINC00587B1AMM8 AC009237.9-201ENST00000414800 347 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
LINC00587B1AMM8 AL157698.1-201ENST00000415190 1011 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
LINC00587B1AMM8 AC069213.1-202ENST00000417011 810 ntTSL 2 BASIC4.26□□□□□ -1.73
LINC00587B1AMM8 IFNA4-201ENST00000421715 978 ntAPPRIS P1 BASIC4.26□□□□□ -1.73
LINC00587B1AMM8 AL357632.1-201ENST00000426688 643 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
LINC00587B1AMM8 RNASE9-203ENST00000429244 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
LINC00587B1AMM8 RPS26P4-201ENST00000431743 355 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
LINC00587B1AMM8 LINC01827-201ENST00000432711 555 ntTSL 2 BASIC4.26□□□□□ -1.73
LINC00587B1AMM8 ANXA2P2-201ENST00000435128 1020 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
LINC00587B1AMM8 AL049820.1-201ENST00000442936 423 ntTSL 2 BASIC4.26□□□□□ -1.73
LINC00587B1AMM8 LINC01781-202ENST00000443104 591 ntTSL 2 BASIC4.26□□□□□ -1.73
LINC00587B1AMM8 LINC02210-201ENST00000444561 288 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
LINC00587B1AMM8 BTF3P6-201ENST00000448054 499 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
LINC00587B1AMM8 AC211433.1-201ENST00000450426 686 ntTSL 4 BASIC4.26□□□□□ -1.73
LINC00587B1AMM8 CYP4F62P-203ENST00000455215 552 ntTSL 4 BASIC4.26□□□□□ -1.73
LINC00587B1AMM8 PPP1R2P6-201ENST00000478565 588 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
LINC00587B1AMM8 DEFB109F-201ENST00000491870 277 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
LINC00587B1AMM8 RPS6P4-201ENST00000494693 758 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
LINC00587B1AMM8 PFN2-213ENST00000494827 793 ntTSL 4 BASIC4.26□□□□□ -1.73
LINC00587B1AMM8 AC091868.2-201ENST00000506717 556 ntTSL 3 BASIC4.26□□□□□ -1.73
LINC00587B1AMM8 AC106774.2-201ENST00000510266 406 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
LINC00587B1AMM8 EIF3KP3-201ENST00000514461 639 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
LINC00587B1AMM8 LINC00967-204ENST00000518412 271 ntTSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
LINC00587B1AMM8 RPL26L1-203ENST00000519239 679 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.26□□□□□ -1.73
LINC00587B1AMM8 GRPEL2-AS1-201ENST00000521295 401 ntTSL 3 BASIC4.26□□□□□ -1.73
LINC00587B1AMM8 AC007991.4-201ENST00000522970 605 ntTSL 3 BASIC4.26□□□□□ -1.73
LINC00587B1AMM8 AC090281.1-201ENST00000523019 276 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
LINC00587B1AMM8 AC008429.2-201ENST00000523057 864 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
LINC00587B1AMM8 AC021269.1-201ENST00000526860 705 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
LINC00587B1AMM8 AC068205.2-201ENST00000532864 771 ntTSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
LINC00587B1AMM8 RPA2P3-201ENST00000533268 770 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
LINC00587B1AMM8 CRADD-211ENST00000552983 839 ntTSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
LINC00587B1AMM8 LINC02296-201ENST00000557070 544 ntTSL 4 BASIC4.26□□□□□ -1.73
LINC00587B1AMM8 AC092078.1-201ENST00000558370 325 ntTSL 3 BASIC4.26□□□□□ -1.73
LINC00587B1AMM8 PCAT29-202ENST00000558941 545 ntTSL 4 BASIC4.26□□□□□ -1.73
LINC00587B1AMM8 NR2F2-AS1-205ENST00000559505 1005 ntTSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
LINC00587B1AMM8 C15orf41-205ENST00000563167 772 ntTSL 3 BASIC4.26□□□□□ -1.73
LINC00587B1AMM8 AC124283.2-201ENST00000575085 318 ntTSL 3 BASIC4.26□□□□□ -1.73
LINC00587B1AMM8 AP000919.3-201ENST00000582591 568 ntTSL 3 BASIC4.26□□□□□ -1.73
LINC00587B1AMM8 AC009303.2-206ENST00000588042 786 ntTSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
LINC00587B1AMM8 ELOCP28-201ENST00000590044 317 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
LINC00587B1AMM8 AC006116.6-201ENST00000593258 1103 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
LINC00587B1AMM8 AC092032.1-201ENST00000603090 165 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
LINC00587B1AMM8 AL024498.1-201ENST00000606522 1100 ntTSL 3 BASIC4.26□□□□□ -1.73
LINC00587B1AMM8 OR8H1-202ENST00000610894 927 ntAPPRIS ALT1 BASIC4.26□□□□□ -1.73
LINC00587B1AMM8 Metazoa_SRP.189-201ENST00000614219 303 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
LINC00587B1AMM8 MIR8069-1-201ENST00000616627 86 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
LINC00587B1AMM8 RMST_9.1-201ENST00000619945 193 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
LINC00587B1AMM8 MIR8069-2-201ENST00000621412 86 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
LINC00587B1AMM8 Metazoa_SRP.130-201ENST00000622625 267 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
LINC00587B1AMM8 ZRANB2-AS2-220ENST00000623721 1133 ntTSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
LINC00587B1AMM8 AC106782.7-201ENST00000624024 418 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
LINC00587B1AMM8 AC133555.5-201ENST00000624430 418 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
LINC00587B1AMM8 ZCCHC7-202ENST00000336755 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.26□□□□□ -1.73
LINC00587B1AMM8 AP002001.1-201ENST00000526101 1759 ntTSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
LINC00587B1AMM8 SUPT16HP1-201ENST00000537175 3133 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
LINC00587B1AMM8 SUN3-201ENST00000297325 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
LINC00587B1AMM8 CASC19-238ENST00000641523 1558 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
LINC00587B1AMM8 PLS3-209ENST00000539310 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
LINC00587B1AMM8 AC074029.4-201ENST00000624796 1859 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
LINC00587B1AMM8 SLCO1C1-207ENST00000540354 2529 ntTSL 2 BASIC4.26□□□□□ -1.73
LINC00587B1AMM8 FAM111B-202ENST00000411426 3344 ntTSL 4 BASIC4.26□□□□□ -1.73
LINC00587B1AMM8 PRG4-203ENST00000367485 4765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
LINC00587B1AMM8 IRAK1BP1-204ENST00000607739 1387 ntTSL 2 BASIC4.26□□□□□ -1.73
LINC00587B1AMM8 MAP2-202ENST00000360351 9711 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
LINC00587B1AMM8 ZNF763-202ENST00000358987 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
LINC00587B1AMM8 AP004607.3-201ENST00000530354 3915 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
LINC00587B1AMM8 COPS4-209ENST00000511653 1695 ntTSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
LINC00587B1AMM8 AC090971.4-201ENST00000560291 1800 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
LINC00587B1AMM8 DDX4-211ENST00000511853 1984 ntTSL 2 BASIC4.25□□□□□ -1.73
LINC00587B1AMM8 GPR33-201ENST00000399285 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
LINC00587B1AMM8 KATNAL1-201ENST00000380615 7551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
LINC00587B1AMM8 INTU-201ENST00000335251 13233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
LINC00587B1AMM8 SLC38A2-209ENST00000551374 2802 ntTSL 2 BASIC4.25□□□□□ -1.73
LINC00587B1AMM8 ZNF705E-201ENST00000525199 3442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.25□□□□□ -1.73
LINC00587B1AMM8 AC092681.1-201ENST00000297369 291 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
LINC00587B1AMM8 AL353751.1-201ENST00000354541 495 ntTSL 3 BASIC4.25□□□□□ -1.73
LINC00587B1AMM8 CNTRL-202ENST00000373844 713 ntTSL 3 BASIC4.25□□□□□ -1.73
LINC00587B1AMM8 SERPINB12-202ENST00000382768 1278 ntTSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
LINC00587B1AMM8 TRAV38-1-201ENST00000390464 353 ntAPPRIS P1 BASIC4.25□□□□□ -1.73
LINC00587B1AMM8 STXBP4-202ENST00000398391 2160 ntTSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
LINC00587B1AMM8 RBPJP6-201ENST00000411556 1431 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
LINC00587B1AMM8 OR6E1P-201ENST00000414424 923 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
LINC00587B1AMM8 AC023347.1-202ENST00000419223 440 ntTSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
LINC00587B1AMM8 EIF4A1P1-201ENST00000420241 934 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
LINC00587B1AMM8 AC093107.1-201ENST00000422772 609 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
LINC00587B1AMM8 LINC01762-201ENST00000423907 454 ntTSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
LINC00587B1AMM8 AL669841.1-201ENST00000425723 558 ntTSL 2 BASIC4.25□□□□□ -1.73
LINC00587B1AMM8 PRKACB-213ENST00000446538 1112 ntTSL 2 BASIC4.25□□□□□ -1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 189.8 ms