Protein–RNA interactions for Protein: Q9P232

CNTN3, Contactin-3, humanhuman

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Length 1,028 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN3Q9P232 TIMM9-208ENST00000556007 746 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
CNTN3Q9P232 AP005530.1-201ENST00000572608 567 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
CNTN3Q9P232 AC138207.5-201ENST00000579561 409 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
CNTN3Q9P232 IGLJCOR18-201ENST00000584002 424 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
CNTN3Q9P232 AC022146.1-201ENST00000595307 847 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
CNTN3Q9P232 AC016727.1-205ENST00000605437 569 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
CNTN3Q9P232 WDR11-AS1-204ENST00000608667 522 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
CNTN3Q9P232 RSU1P2-204ENST00000619977 1240 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
CNTN3Q9P232 AC010435.1-201ENST00000623353 1177 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
CNTN3Q9P232 AC099654.15-201ENST00000639802 509 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
CNTN3Q9P232 AC092111.1-201ENST00000618256 3358 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
CNTN3Q9P232 YOD1-202ENST00000367084 6291 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
CNTN3Q9P232 LINC01204-202ENST00000435394 2214 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
CNTN3Q9P232 UGT2B17-201ENST00000317746 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
CNTN3Q9P232 SYNPO2-203ENST00000434046 3588 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
CNTN3Q9P232 IRAK4-203ENST00000448290 1381 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
CNTN3Q9P232 TMEM246-203ENST00000374851 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
CNTN3Q9P232 MYO1B-203ENST00000392316 4764 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
CNTN3Q9P232 POGK-201ENST00000367875 6254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
CNTN3Q9P232 PIGN-238ENST00000639758 4239 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
CNTN3Q9P232 THADA-204ENST00000403856 6939 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
CNTN3Q9P232 RNASE13-201ENST00000382951 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
CNTN3Q9P232 ZDBF2-201ENST00000374423 10286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
CNTN3Q9P232 PTPRR-202ENST00000342084 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
CNTN3Q9P232 CDH18-205ENST00000506372 2432 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
CNTN3Q9P232 ENSA-201ENST00000271690 2818 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
CNTN3Q9P232 CSNK1A1-205ENST00000515435 1856 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
CNTN3Q9P232 ZFY-207ENST00000625061 2273 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
CNTN3Q9P232 ENTPD5-207ENST00000557325 3096 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
CNTN3Q9P232 ZC3H14-206ENST00000406216 1341 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
CNTN3Q9P232 FAM83B-201ENST00000306858 3167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
CNTN3Q9P232 USPL1-201ENST00000255304 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
CNTN3Q9P232 ARHGAP32-202ENST00000392657 6556 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
CNTN3Q9P232 PEAK1-202ENST00000558305 4644 ntTSL 4 BASIC7.55□□□□□ -1.2
CNTN3Q9P232 TLR1-201ENST00000308979 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
CNTN3Q9P232 HMGCS2-204ENST00000544913 1925 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
CNTN3Q9P232 FGF9-201ENST00000382353 4220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
CNTN3Q9P232 STT3A-214ENST00000531491 2160 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
CNTN3Q9P232 Y_RNA.192-201ENST00000363977 102 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
CNTN3Q9P232 FIG4-202ENST00000368941 791 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
CNTN3Q9P232 LINC00474-201ENST00000374014 769 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
CNTN3Q9P232 PLIN2-203ENST00000380465 631 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
CNTN3Q9P232 ZNF603P-201ENST00000405613 487 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
CNTN3Q9P232 RNU6-920P-201ENST00000410926 92 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
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CNTN3Q9P232 AC084030.1-202ENST00000413385 880 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
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CNTN3Q9P232 HSFX3-201ENST00000431993 1264 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
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CNTN3Q9P232 FOXP1-AS1-201ENST00000465742 700 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
CNTN3Q9P232 RPL9P33-201ENST00000484311 566 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
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CNTN3Q9P232 MRPL42-203ENST00000547098 701 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
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CNTN3Q9P232 AC245505.1-201ENST00000556398 224 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
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CNTN3Q9P232 CT45A7-201ENST00000610598 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
CNTN3Q9P232 ANKRD36C-207ENST00000612359 650 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
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CNTN3Q9P232 INPP4B-223ENST00000630044 354 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
CNTN3Q9P232 AC011471.4-201ENST00000638271 216 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
CNTN3Q9P232 AL596275.2-203ENST00000641951 371 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
CNTN3Q9P232 PSG10P-201ENST00000501199 1500 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
CNTN3Q9P232 B3GNT5-206ENST00000465010 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
CNTN3Q9P232 AC009220.2-201ENST00000489759 1751 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
CNTN3Q9P232 VTI1A-201ENST00000393077 4131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
CNTN3Q9P232 OFD1P6Y-201ENST00000432335 1637 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
CNTN3Q9P232 TTTY9B-201ENST00000433794 1637 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
CNTN3Q9P232 AC017007.4-201ENST00000503353 1352 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
CNTN3Q9P232 STAG2-201ENST00000218089 5218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
CNTN3Q9P232 HHIP-201ENST00000296575 10072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
CNTN3Q9P232 AC096582.3-201ENST00000636578 3716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
CNTN3Q9P232 RAB6C-AS1-201ENST00000412425 2454 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
CNTN3Q9P232 TMC5-206ENST00000561503 2487 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
CNTN3Q9P232 AP002800.1-201ENST00000624982 2225 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
CNTN3Q9P232 BRDT-202ENST00000362005 3409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
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