Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0D0

PHACTR1, Phosphatase and actin regulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHACTR1Q9C0D0 CASP12-206ENST00000446862 1196 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 AL157373.1-201ENST00000456036 276 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 AL445488.1-201ENST00000457272 706 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 RN7SL325P-201ENST00000460434 283 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 RPL5P24-201ENST00000463742 885 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 PSAT1P4-201ENST00000466500 526 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 AL031073.1-201ENST00000503029 1139 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 LINC01182-201ENST00000503532 582 ntTSL 4 BASIC7.57□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 PABPC1P1-201ENST00000506347 591 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 AC021088.1-201ENST00000506519 805 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 SUMO2P7-201ENST00000511179 285 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 RNU6-314P-201ENST00000516574 104 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 SNORA70.23-201ENST00000517218 151 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 AC105999.2-201ENST00000521363 881 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 AP000880.1-202ENST00000526487 588 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 AC127526.3-201ENST00000534291 450 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 TMEM132D-AS1-204ENST00000537367 531 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 AP002383.5-201ENST00000542623 1161 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 AC022511.1-201ENST00000544089 476 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 AC009729.1-201ENST00000548873 1133 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 APEX1-214ENST00000557054 888 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 GOLGA6L5P-203ENST00000559768 578 ntTSL 4 BASIC7.57□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 NR2F2-AS1-209ENST00000560800 549 ntTSL 4 BASIC7.57□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 AC244034.2-201ENST00000562504 509 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 SAXO2-204ENST00000565432 811 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC7.57□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 LINC02073-202ENST00000592081 535 ntTSL 4 BASIC7.57□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 AC068020.1-201ENST00000594215 661 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 AC005154.6-201ENST00000598361 687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 EDRF1-AS1-205ENST00000601363 712 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 AC130352.1-201ENST00000602979 661 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 C8orf59P2-201ENST00000603441 271 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 AC015871.2-201ENST00000603605 948 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 AL121757.2-201ENST00000611223 313 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 AC006338.1-201ENST00000618453 749 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 Metazoa_SRP.42-201ENST00000621081 348 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 AC012254.5-201ENST00000623573 478 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 AC024023.1-201ENST00000624530 922 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 STK32A-209ENST00000626951 798 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 SMARCA2-229ENST00000634781 1106 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 KIF1B-203ENST00000377083 5885 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 ERVFRD-1-201ENST00000472091 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 RNF4-214ENST00000511600 4123 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 ERBIN-205ENST00000416865 2351 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 ADAM7-203ENST00000441335 1417 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 PDZK1P1-201ENST00000401008 3498 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 KCNH7-205ENST00000621889 1893 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 NOVA1-204ENST00000465357 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 FAM135A-207ENST00000457062 5282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 RAPGEF5-201ENST00000344041 6621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 ZNF227-213ENST00000621083 3055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 PLEKHA1-204ENST00000392799 3221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 AC092828.1-201ENST00000501211 5391 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 METTL8-217ENST00000612742 8132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 PKP4-217ENST00000628904 3856 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 PRUNE1-202ENST00000368934 2214 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 OR51E2-201ENST00000396950 2781 ntAPPRIS P1 BASIC7.56□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 SORBS1-219ENST00000607232 4374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 CU638689.4-201ENST00000623047 5990 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 IPCEF1-201ENST00000265198 6689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 LINC01968-202ENST00000423318 3647 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 PRNCR1-201ENST00000635449 12727 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 ZMYND11-215ENST00000558098 1859 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 STK4-202ENST00000372806 6342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 HEPH-202ENST00000343002 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 OPALIN-201ENST00000371172 3557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 NR1I3-202ENST00000367980 1403 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 NEUROD4-201ENST00000242994 3953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 TAT-201ENST00000355962 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 INSL5-201ENST00000304526 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 OR51H1-201ENST00000322059 999 ntAPPRIS P1 BASIC7.56□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 OR2T4-201ENST00000366473 963 ntAPPRIS P1 BASIC7.56□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 OR2T4-202ENST00000366475 1047 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 OR2AK2-201ENST00000366480 1154 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 TRAV12-3-201ENST00000390442 399 ntAPPRIS P1 BASIC7.56□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 RAN-201ENST00000392367 780 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 RPL34-203ENST00000394668 853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 GRXCR1-201ENST00000399770 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 SUMO2P13-201ENST00000403109 272 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 NCSTNP1-201ENST00000406229 144 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 HMGB3P18-201ENST00000406327 590 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 PDE11A-203ENST00000409504 2102 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 RPL31-206ENST00000409650 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 AC017035.1-201ENST00000411999 1115 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 OR10U1P-201ENST00000414690 905 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 AC011753.4-201ENST00000417974 311 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 AC012498.1-201ENST00000424037 437 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 AC114752.2-201ENST00000424119 404 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 GSTA6P-201ENST00000424144 582 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 MTCO2P11-201ENST00000431069 680 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 LHFPL3-AS1-204ENST00000433514 748 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 AL354983.1-201ENST00000434580 906 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 AC092167.1-201ENST00000435466 495 ntTSL 4 BASIC7.56□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 LINC01291-203ENST00000435984 565 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 BX005266.3-201ENST00000443013 1075 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 MTATP6P30-201ENST00000443540 664 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 AL139081.1-201ENST00000452207 382 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 SPIRE1-206ENST00000453447 2107 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 AC091770.1-201ENST00000456513 373 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 AC002368.1-201ENST00000456981 388 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 UBDP1-202ENST00000457888 382 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
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