Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK5

ZNF548, Zinc finger protein 548, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548Q8NEK5 LINC00317-201ENST00000419069 612 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
ZNF548Q8NEK5 ERMN-209ENST00000420719 1246 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
ZNF548Q8NEK5 BX284632.2-201ENST00000421091 399 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
ZNF548Q8NEK5 RPL12P12-201ENST00000424633 501 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
ZNF548Q8NEK5 AC023481.1-201ENST00000435368 938 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
ZNF548Q8NEK5 PCBP2P1-201ENST00000437262 977 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
ZNF548Q8NEK5 AL512605.1-202ENST00000441919 381 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
ZNF548Q8NEK5 AL359955.2-201ENST00000445380 353 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
ZNF548Q8NEK5 RPS15AP29-201ENST00000445539 400 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
ZNF548Q8NEK5 ZNF619P1-201ENST00000446539 752 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
ZNF548Q8NEK5 TAS2R39-201ENST00000446620 1017 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
ZNF548Q8NEK5 LINC01952-202ENST00000450016 281 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
ZNF548Q8NEK5 AC113398.2-201ENST00000507630 558 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
ZNF548Q8NEK5 AC010460.2-201ENST00000509054 677 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
ZNF548Q8NEK5 SETP21-201ENST00000514799 892 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
ZNF548Q8NEK5 SCARNA1-201ENST00000517138 166 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
ZNF548Q8NEK5 RNA5SP400-201ENST00000517155 111 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
ZNF548Q8NEK5 RRM2B-206ENST00000519317 420 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
ZNF548Q8NEK5 AC090103.1-201ENST00000520386 485 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
ZNF548Q8NEK5 AP003102.1-201ENST00000525638 661 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
ZNF548Q8NEK5 AP003049.1-201ENST00000529418 457 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
ZNF548Q8NEK5 RPA2P3-201ENST00000533268 770 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
ZNF548Q8NEK5 AC011990.1-201ENST00000592809 734 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
ZNF548Q8NEK5 ZNF738-205ENST00000597810 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
ZNF548Q8NEK5 AL391834.1-201ENST00000609609 560 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
ZNF548Q8NEK5 AL138960.1-201ENST00000613838 513 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
ZNF548Q8NEK5 AC091046.2-201ENST00000620775 665 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
ZNF548Q8NEK5 Metazoa_SRP.130-201ENST00000622625 267 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
ZNF548Q8NEK5 AL139220.2-221ENST00000628123 395 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
ZNF548Q8NEK5 LINC00907-201ENST00000585627 3324 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
ZNF548Q8NEK5 EXD1-201ENST00000314992 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
ZNF548Q8NEK5 PSG1-206ENST00000595356 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
ZNF548Q8NEK5 RALGAPA1-202ENST00000382366 6328 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
ZNF548Q8NEK5 PIGA-206ENST00000542278 3626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
ZNF548Q8NEK5 ZNF546-201ENST00000347077 7987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
ZNF548Q8NEK5 AL627171.1-201ENST00000618845 1308 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
ZNF548Q8NEK5 SNW1-204ENST00000554775 1687 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
ZNF548Q8NEK5 CLVS1-203ENST00000518592 2880 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
ZNF548Q8NEK5 MTTP-203ENST00000457717 4092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
ZNF548Q8NEK5 LNX2-201ENST00000316334 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
ZNF548Q8NEK5 AC092958.1-201ENST00000467198 2569 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
ZNF548Q8NEK5 APBB2-230ENST00000543538 6992 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
ZNF548Q8NEK5 ZNF177-202ENST00000589262 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
ZNF548Q8NEK5 TXK-201ENST00000264316 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
ZNF548Q8NEK5 CRYGS-201ENST00000307944 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
ZNF548Q8NEK5 OR4K5-201ENST00000315915 1078 ntAPPRIS P1 BASIC5.98□□□□□ -1.45
ZNF548Q8NEK5 FAM66C-201ENST00000372173 678 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
ZNF548Q8NEK5 DAOA-202ENST00000375936 742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
ZNF548Q8NEK5 OR2W4P-201ENST00000406496 926 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
ZNF548Q8NEK5 MIR1203-201ENST00000408812 85 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
ZNF548Q8NEK5 RNA5SP178-201ENST00000410380 128 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
ZNF548Q8NEK5 AC092634.4-201ENST00000419937 423 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
ZNF548Q8NEK5 NPM1P25-201ENST00000429734 854 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
ZNF548Q8NEK5 UBE2V1P6-201ENST00000430840 422 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
ZNF548Q8NEK5 HNRNPA1P18-201ENST00000433537 927 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
ZNF548Q8NEK5 GAPDHP75-201ENST00000433910 943 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
ZNF548Q8NEK5 CCDC17-203ENST00000445048 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
ZNF548Q8NEK5 AL161636.2-201ENST00000445179 927 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
ZNF548Q8NEK5 AC104457.2-201ENST00000446055 467 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
ZNF548Q8NEK5 LINC01880-201ENST00000446593 561 ntTSL 4 BASIC5.98□□□□□ -1.45
ZNF548Q8NEK5 AC132807.1-201ENST00000449613 458 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
ZNF548Q8NEK5 AL136982.3-201ENST00000454709 688 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
ZNF548Q8NEK5 AL445687.2-201ENST00000458156 728 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
ZNF548Q8NEK5 AC093719.1-201ENST00000480427 441 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
ZNF548Q8NEK5 VPS26A-206ENST00000489794 928 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
ZNF548Q8NEK5 AP001960.1-201ENST00000506494 658 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
ZNF548Q8NEK5 AC010374.2-201ENST00000512933 535 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
ZNF548Q8NEK5 AC023158.1-201ENST00000561632 1025 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
ZNF548Q8NEK5 LINC2194-201ENST00000567127 454 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
ZNF548Q8NEK5 AP005121.1-202ENST00000584414 555 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
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ZNF548Q8NEK5 AC245884.10-201ENST00000597355 337 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
ZNF548Q8NEK5 LINC01125-220ENST00000599501 965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
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ZNF548Q8NEK5 AC010894.2-203ENST00000606406 499 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
ZNF548Q8NEK5 LINC01125-249ENST00000627399 1067 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
ZNF548Q8NEK5 RGPD1-206ENST00000641458 5271 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
ZNF548Q8NEK5 CAPRIN2-202ENST00000395805 4156 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
ZNF548Q8NEK5 LINC00326-202ENST00000457339 2515 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
ZNF548Q8NEK5 AL449283.1-201ENST00000602631 3403 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
ZNF548Q8NEK5 AC113146.2-201ENST00000560743 1961 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
ZNF548Q8NEK5 AMN1-208ENST00000537562 1538 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
ZNF548Q8NEK5 AJ009632.2-208ENST00000635525 4123 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
ZNF548Q8NEK5 OR52N5-202ENST00000641181 2778 ntAPPRIS P1 BASIC5.98□□□□□ -1.45
ZNF548Q8NEK5 RIC3-202ENST00000335425 5223 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
ZNF548Q8NEK5 ELAVL4-202ENST00000371819 2467 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
ZNF548Q8NEK5 MAPK10-341ENST00000641657 3860 ntAPPRIS P2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
ZNF548Q8NEK5 ZNF26-202ENST00000534834 4853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
ZNF548Q8NEK5 AC024587.1-201ENST00000505925 2157 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
ZNF548Q8NEK5 LINC02086-202ENST00000492522 2091 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
ZNF548Q8NEK5 CWF19L2-201ENST00000282251 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
ZNF548Q8NEK5 SLC17A4-202ENST00000397076 2331 ntTSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
ZNF548Q8NEK5 AC109811.1-201ENST00000512833 2807 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
ZNF548Q8NEK5 MELK-211ENST00000545008 2236 ntTSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
ZNF548Q8NEK5 TTC21B-201ENST00000243344 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
ZNF548Q8NEK5 CLEC2D-201ENST00000261339 465 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
ZNF548Q8NEK5 SCGB3A2-201ENST00000296694 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
ZNF548Q8NEK5 SNORA51.1-201ENST00000363243 140 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
ZNF548Q8NEK5 AC087752.1-201ENST00000391360 558 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
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