Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 ATP13A5-205ENST00000620313 709 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
CCDC142Q17RM4 AP001962.1-201ENST00000624114 559 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
CCDC142Q17RM4 LINC01955-201ENST00000626392 792 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
CCDC142Q17RM4 LINC02342-201ENST00000627910 461 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
CCDC142Q17RM4 AC009951.2-201ENST00000634873 644 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
CCDC142Q17RM4 ASXL2-203ENST00000435504 12878 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
CCDC142Q17RM4 ZRANB3-211ENST00000619650 2494 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
CCDC142Q17RM4 ESRRG-203ENST00000361395 5216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
CCDC142Q17RM4 ESRRG-209ENST00000408911 5216 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
CCDC142Q17RM4 AC005480.1-202ENST00000555916 3548 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
CCDC142Q17RM4 RPE65-201ENST00000262340 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
CCDC142Q17RM4 PCDH15-202ENST00000361849 7017 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
CCDC142Q17RM4 PCDH15-205ENST00000373957 7032 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
CCDC142Q17RM4 AC096656.1-201ENST00000623826 1364 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
CCDC142Q17RM4 AC020743.2-201ENST00000639870 1370 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
CCDC142Q17RM4 ELAVL4-202ENST00000371819 2467 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
CCDC142Q17RM4 PUS3-203ENST00000530811 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
CCDC142Q17RM4 RFX3-212ENST00000617270 9253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
CCDC142Q17RM4 TRMT13-202ENST00000370141 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
CCDC142Q17RM4 AC092958.1-201ENST00000467198 2569 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
CCDC142Q17RM4 RPL23AP82-206ENST00000480246 2987 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
CCDC142Q17RM4 TTC21B-201ENST00000243344 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
CCDC142Q17RM4 NBPF11-204ENST00000614785 4343 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
CCDC142Q17RM4 PDC-201ENST00000391997 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
CCDC142Q17RM4 RPL35AP3-201ENST00000414680 288 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
CCDC142Q17RM4 CASP5-203ENST00000418434 1023 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
CCDC142Q17RM4 RPS15AP30-201ENST00000420976 390 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
CCDC142Q17RM4 RPS3P2-201ENST00000421346 701 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
CCDC142Q17RM4 AC096669.1-201ENST00000422203 648 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
CCDC142Q17RM4 GAPDHP75-201ENST00000433910 943 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
CCDC142Q17RM4 AC108051.1-201ENST00000435291 549 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
CCDC142Q17RM4 NDUFS5P5-201ENST00000437256 321 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
CCDC142Q17RM4 DMD-AS3-201ENST00000439592 293 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
CCDC142Q17RM4 LARGE-IT1-201ENST00000445391 558 ntTSL 4 BASIC6.44□□□□□ -1.38
CCDC142Q17RM4 AC092685.1-201ENST00000447960 1243 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
CCDC142Q17RM4 NDUFA5P8-201ENST00000449019 346 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
CCDC142Q17RM4 AC132807.1-201ENST00000449613 458 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
CCDC142Q17RM4 AL513343.1-201ENST00000451818 792 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
CCDC142Q17RM4 AC094085.1-201ENST00000468914 584 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
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CCDC142Q17RM4 HGNC:24955-208ENST00000521585 1260 ntTSL 4 BASIC6.44□□□□□ -1.38
CCDC142Q17RM4 AC138701.1-201ENST00000524329 714 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
CCDC142Q17RM4 OR6M2P-201ENST00000529831 871 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
CCDC142Q17RM4 AC011611.4-201ENST00000547721 779 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
CCDC142Q17RM4 AC025031.1-201ENST00000552634 562 ntTSL 4 BASIC6.44□□□□□ -1.38
CCDC142Q17RM4 AL136298.1-202ENST00000556520 518 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
CCDC142Q17RM4 MTATP6P24-201ENST00000576835 677 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
CCDC142Q17RM4 AC119868.1-202ENST00000584741 347 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
CCDC142Q17RM4 CXXC1P1-203ENST00000589302 746 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
CCDC142Q17RM4 ZNF43-209ENST00000598288 560 ntTSL 4 BASIC6.44□□□□□ -1.38
CCDC142Q17RM4 ZNF649-AS1-201ENST00000600329 579 ntTSL 4 BASIC6.44□□□□□ -1.38
CCDC142Q17RM4 BNIP3P38-201ENST00000601117 544 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
CCDC142Q17RM4 AC027334.1-201ENST00000603257 310 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
CCDC142Q17RM4 AC012557.2-201ENST00000605919 418 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
CCDC142Q17RM4 AC009974.1-201ENST00000608881 455 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
CCDC142Q17RM4 uc_338.26-201ENST00000612659 160 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
CCDC142Q17RM4 AC139792.2-201ENST00000624218 587 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
CCDC142Q17RM4 SATB1-AS1-243ENST00000627546 589 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
CCDC142Q17RM4 AC129915.3-201ENST00000634128 948 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
CCDC142Q17RM4 AC099654.9-201ENST00000637055 678 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
CCDC142Q17RM4 ANKS1B-216ENST00000549558 2268 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
CCDC142Q17RM4 RBM48-202ENST00000481551 4093 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
CCDC142Q17RM4 PLCE1-201ENST00000371375 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
CCDC142Q17RM4 SLAMF6-203ENST00000368059 2743 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
CCDC142Q17RM4 KLHL13-206ENST00000469946 2353 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
CCDC142Q17RM4 ZNF682-201ENST00000358523 2161 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
CCDC142Q17RM4 LINC01787-201ENST00000435311 1994 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
CCDC142Q17RM4 AC137056.2-201ENST00000624055 1958 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
CCDC142Q17RM4 TTF2-201ENST00000369466 9462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
CCDC142Q17RM4 MATR3-215ENST00000510056 3040 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
CCDC142Q17RM4 RAPH1-204ENST00000418114 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
CCDC142Q17RM4 RAPH1-205ENST00000419464 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
CCDC142Q17RM4 HCFC2P1-201ENST00000392864 1592 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
CCDC142Q17RM4 TMEM161B-210ENST00000511218 1351 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
CCDC142Q17RM4 CHD8-202ENST00000430710 7420 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
CCDC142Q17RM4 LINC02153-202ENST00000522604 1644 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
CCDC142Q17RM4 SEPT7-203ENST00000399035 4066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
CCDC142Q17RM4 LINGO2-204ENST00000613945 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
CCDC142Q17RM4 FAM197Y8-201ENST00000426661 2340 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
CCDC142Q17RM4 FAM197Y6-202ENST00000442145 2340 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
CCDC142Q17RM4 CBLB-205ENST00000407712 1493 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
CCDC142Q17RM4 AC120036.2-201ENST00000509729 1474 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
CCDC142Q17RM4 TBC1D15-201ENST00000319106 2159 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
CCDC142Q17RM4 TAF13-201ENST00000338366 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
CCDC142Q17RM4 CRP-204ENST00000368112 787 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
CCDC142Q17RM4 ZRANB2-AS2-201ENST00000411721 518 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
CCDC142Q17RM4 RPS7P8-201ENST00000418311 581 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
CCDC142Q17RM4 C5orf58-201ENST00000421269 406 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
CCDC142Q17RM4 AL391069.1-201ENST00000422153 358 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
CCDC142Q17RM4 TAB2-AS1-201ENST00000424421 730 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
CCDC142Q17RM4 AC021876.1-201ENST00000425959 359 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
CCDC142Q17RM4 AL389925.1-201ENST00000432257 728 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
CCDC142Q17RM4 TRGC2-201ENST00000436911 1013 ntAPPRIS P1 BASIC6.43□□□□□ -1.38
CCDC142Q17RM4 AC108066.1-201ENST00000437261 596 ntTSL 4 BASIC6.43□□□□□ -1.38
CCDC142Q17RM4 PCBP2P1-201ENST00000437262 977 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
CCDC142Q17RM4 MIR4435-2HG-209ENST00000441075 704 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
CCDC142Q17RM4 MTND2P22-201ENST00000444325 1033 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
CCDC142Q17RM4 LINC00971-203ENST00000491849 452 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
CCDC142Q17RM4 AC113349.1-201ENST00000512105 583 ntTSL 4 BASIC6.43□□□□□ -1.38
CCDC142Q17RM4 CYP4F27P-201ENST00000514557 494 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
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