Protein–RNA interactions for Protein: Q16619

CTF1, Cardiotrophin-1, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTF1Q16619 CCNB1IP1P1-201ENST00000428976 839 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CTF1Q16619 OR5AC1-201ENST00000429239 925 ntAPPRIS P1 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CTF1Q16619 AL606490.7-201ENST00000433136 191 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CTF1Q16619 LMO7DN-IT1-201ENST00000436872 321 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CTF1Q16619 AC079763.1-201ENST00000441295 738 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CTF1Q16619 GTF2IP14-201ENST00000441415 586 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CTF1Q16619 RPL12P24-201ENST00000474907 486 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CTF1Q16619 RPS16P9-201ENST00000477220 427 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CTF1Q16619 AC006539.1-201ENST00000481419 501 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CTF1Q16619 AC087071.2-201ENST00000483283 575 ntTSL 4 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CTF1Q16619 RN7SL239P-201ENST00000490061 300 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CTF1Q16619 ENPP7P11-201ENST00000505915 627 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CTF1Q16619 AC106799.2-201ENST00000507435 721 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CTF1Q16619 AC119751.4-201ENST00000507498 357 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CTF1Q16619 LINC01017-201ENST00000508823 768 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CTF1Q16619 OCIAD1-216ENST00000509122 1204 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CTF1Q16619 Y_RNA.710-201ENST00000516975 110 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CTF1Q16619 IGHV7-34-1-201ENST00000519200 350 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CTF1Q16619 BAALC-AS1-208ENST00000523614 582 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CTF1Q16619 OR4A17P-201ENST00000526032 904 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CTF1Q16619 LINC00678-202ENST00000534757 798 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CTF1Q16619 AC073862.1-201ENST00000537998 409 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CTF1Q16619 CLEC2B-202ENST00000538152 745 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CTF1Q16619 UBE2N-204ENST00000549833 960 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CTF1Q16619 LINC2194-201ENST00000567127 454 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CTF1Q16619 SNURF-202ENST00000577949 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CTF1Q16619 AC011476.3-202ENST00000586845 553 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CTF1Q16619 AC006363.1-201ENST00000603806 463 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CTF1Q16619 LINC02343-201ENST00000605909 573 ntTSL 4 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CTF1Q16619 AC004921.1-201ENST00000608884 733 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CTF1Q16619 AL592494.3-201ENST00000609485 464 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CTF1Q16619 ZNHIT3-208ENST00000619730 926 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
CTF1Q16619 SNHG5-214ENST00000623001 598 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CTF1Q16619 PCDHB2-203ENST00000624874 565 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CTF1Q16619 AL049541.1-201ENST00000630976 642 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CTF1Q16619 AC073488.6-201ENST00000632293 754 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CTF1Q16619 FRG1EP-201ENST00000634469 770 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CTF1Q16619 AC027559.1-201ENST00000636288 271 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CTF1Q16619 AP000550.3-201ENST00000637734 379 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CTF1Q16619 ZNF33A-202ENST00000374618 6122 ntTSL 4 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CTF1Q16619 SCRG1-201ENST00000296506 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
CTF1Q16619 FSHB-202ENST00000417547 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CTF1Q16619 ZNF143-201ENST00000299606 2562 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CTF1Q16619 AFF2-201ENST00000286437 12280 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CTF1Q16619 RGS6-204ENST00000404301 1497 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
CTF1Q16619 RGS6-206ENST00000407322 1497 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
CTF1Q16619 DYNC1I2-207ENST00000410079 2159 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CTF1Q16619 IFI16-202ENST00000340979 2732 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CTF1Q16619 IFI16-204ENST00000368131 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
CTF1Q16619 SUPT3H-203ENST00000371460 2389 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
CTF1Q16619 MUC17-201ENST00000306151 14247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
CTF1Q16619 CSMD1-215ENST00000537824 13512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
CTF1Q16619 TEX11-202ENST00000374320 2224 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
CTF1Q16619 CEP162-207ENST00000617909 5095 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
CTF1Q16619 PREPL-216ENST00000541738 6049 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
CTF1Q16619 AL121839.2-201ENST00000565058 6943 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
CTF1Q16619 ZNF440-201ENST00000304060 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
CTF1Q16619 USP15-201ENST00000280377 4748 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
CTF1Q16619 THAP12P5-201ENST00000405864 2275 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
CTF1Q16619 OR52H1-201ENST00000322653 1057 ntAPPRIS P1 BASIC5.24□□□□□ -1.57
CTF1Q16619 WFDC11-202ENST00000356562 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
CTF1Q16619 RNU6-792P-201ENST00000363490 107 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
CTF1Q16619 AL035405.1-201ENST00000400795 710 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
CTF1Q16619 UQCRFS1P3-201ENST00000407697 385 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
CTF1Q16619 AL049649.1-202ENST00000412405 414 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
CTF1Q16619 AC104777.1-202ENST00000413247 774 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
CTF1Q16619 RANP4-201ENST00000413361 655 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
CTF1Q16619 LINC01393-201ENST00000419905 746 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
CTF1Q16619 AL139008.2-201ENST00000420315 395 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
CTF1Q16619 APCDD1L-AS1-204ENST00000427794 461 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
CTF1Q16619 RPL12P18-201ENST00000437175 325 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
CTF1Q16619 GNA14-AS1-201ENST00000439145 605 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
CTF1Q16619 TCEA1P3-201ENST00000443005 880 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
CTF1Q16619 MTND6P5-201ENST00000448266 512 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
CTF1Q16619 AL157884.3-201ENST00000448273 1184 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
CTF1Q16619 LINC01376-204ENST00000449124 626 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
CTF1Q16619 BUD31P2-201ENST00000449374 300 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
CTF1Q16619 AL450344.2-201ENST00000455229 614 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
CTF1Q16619 RN7SL145P-201ENST00000469955 296 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
CTF1Q16619 PFN1P6-201ENST00000476786 399 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
CTF1Q16619 OR9N1P-202ENST00000494289 481 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
CTF1Q16619 SOX2-OT-216ENST00000497122 578 ntTSL 4 BASIC5.24□□□□□ -1.57
CTF1Q16619 EPPIN-WFDC6-201ENST00000504988 1156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
CTF1Q16619 AC093870.1-201ENST00000506837 213 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
CTF1Q16619 AC239584.1-201ENST00000510419 732 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
CTF1Q16619 AC093770.1-201ENST00000511559 571 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
CTF1Q16619 LINC02196-201ENST00000512838 568 ntTSL 4 BASIC5.24□□□□□ -1.57
CTF1Q16619 MIR2117-201ENST00000516780 80 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
CTF1Q16619 AC008632.1-202ENST00000518605 452 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
CTF1Q16619 HMGB1P46-201ENST00000520062 610 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
CTF1Q16619 AC025871.2-201ENST00000522589 511 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
CTF1Q16619 PDCL3P1-201ENST00000534575 734 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
CTF1Q16619 AC005906.2-204ENST00000541095 481 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
CTF1Q16619 AC124784.1-201ENST00000552426 571 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
CTF1Q16619 AL591770.1-201ENST00000554475 1131 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
CTF1Q16619 AC040918.1-201ENST00000560056 632 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
CTF1Q16619 AC104072.1-201ENST00000568817 668 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
CTF1Q16619 LINC02520-201ENST00000570443 537 ntTSL 4 BASIC5.24□□□□□ -1.57
CTF1Q16619 AC008109.1-201ENST00000583163 826 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
CTF1Q16619 OR1AB1P-201ENST00000585564 761 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 120 ms