Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

Predictions only

Length 768 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 RN7SKP288-201ENST00000516227 268 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CUL3Q13618 AC040970.1-202ENST00000517908 505 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CUL3Q13618 AP001000.1-201ENST00000526843 742 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CUL3Q13618 AC130364.2-201ENST00000528639 604 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CUL3Q13618 AP001893.3-201ENST00000532357 569 ntTSL 4 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CUL3Q13618 AC078922.1-201ENST00000547547 434 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CUL3Q13618 TSSK4-207ENST00000556621 896 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
CUL3Q13618 AC087477.5-202ENST00000560242 389 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CUL3Q13618 ARGFXP2-201ENST00000579304 949 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CUL3Q13618 AC011476.3-202ENST00000586845 553 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CUL3Q13618 ZNF682-208ENST00000596019 552 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CUL3Q13618 AC138473.1-201ENST00000605717 526 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CUL3Q13618 AC073389.3-201ENST00000609434 935 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CUL3Q13618 Metazoa_SRP.35-201ENST00000611402 288 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CUL3Q13618 AC022106.1-201ENST00000612834 766 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CUL3Q13618 RN7SL261P-201ENST00000613441 282 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CUL3Q13618 AC241377.1-201ENST00000619797 406 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CUL3Q13618 AC024884.1-201ENST00000620583 399 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CUL3Q13618 ZNF415-203ENST00000500065 2496 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CUL3Q13618 MTERF1-203ENST00000419292 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
CUL3Q13618 KCNC4-201ENST00000369787 18750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
CUL3Q13618 LRRN3-204ENST00000451085 3725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CUL3Q13618 LINC02010-202ENST00000471638 1829 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
CUL3Q13618 AP002004.1-203ENST00000531091 1768 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
CUL3Q13618 LARP4-203ENST00000398473 6427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
CUL3Q13618 TRPC4-202ENST00000355779 2784 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
CUL3Q13618 RNF19BPY-201ENST00000458209 1550 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CUL3Q13618 SUCLG1-201ENST00000393868 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
CUL3Q13618 AC006288.1-201ENST00000565320 1463 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CUL3Q13618 EXPH5-201ENST00000265843 10187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
CUL3Q13618 ZNF891-201ENST00000537226 15455 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CUL3Q13618 ASB14-201ENST00000389601 3175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CUL3Q13618 ZNF761-203ENST00000454407 3967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CUL3Q13618 PCAT14-202ENST00000627127 3935 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CUL3Q13618 OR8H3-201ENST00000313472 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CUL3Q13618 ZCCHC6-202ENST00000375947 611 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CUL3Q13618 MIR188-201ENST00000385034 86 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CUL3Q13618 F9-202ENST00000394090 1272 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
CUL3Q13618 AL451081.1-201ENST00000413159 245 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CUL3Q13618 AC000058.1-201ENST00000415249 536 ntTSL 4 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CUL3Q13618 RPL7AP51-201ENST00000422016 760 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CUL3Q13618 AL451047.1-201ENST00000424451 814 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CUL3Q13618 AC138761.5-201ENST00000433967 325 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CUL3Q13618 AC108051.1-201ENST00000435291 549 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CUL3Q13618 AC073072.2-201ENST00000447425 348 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CUL3Q13618 AC011752.1-201ENST00000451476 494 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CUL3Q13618 AC013549.1-201ENST00000454086 566 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CUL3Q13618 AC078785.2-201ENST00000462010 1253 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CUL3Q13618 MTND3P6-201ENST00000485242 339 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CUL3Q13618 RPS27P20-201ENST00000492051 246 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CUL3Q13618 OR52A4P-203ENST00000498233 1014 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CUL3Q13618 AC090150.1-201ENST00000521408 585 ntTSL 4 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CUL3Q13618 AC103843.1-201ENST00000527318 682 ntTSL 4 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CUL3Q13618 NAV2-IT1-201ENST00000528204 506 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
CUL3Q13618 LSM3P2-201ENST00000551246 273 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CUL3Q13618 CNEP1R1-204ENST00000562576 656 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CUL3Q13618 MIR744-201ENST00000578242 98 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CUL3Q13618 RN7SL230P-201ENST00000580835 303 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CUL3Q13618 AP005136.2-201ENST00000583253 1049 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CUL3Q13618 LINC01198-207ENST00000598084 881 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CUL3Q13618 RPSAP75-201ENST00000605848 301 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CUL3Q13618 AC020658.4-201ENST00000613987 684 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CUL3Q13618 TEK-205ENST00000615002 4666 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CUL3Q13618 AC002429.2-202ENST00000637269 394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CUL3Q13618 LINC01091-203ENST00000514823 5262 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
CUL3Q13618 EPC2-201ENST00000258484 3649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
CUL3Q13618 AC016705.1-201ENST00000548231 1891 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CUL3Q13618 VEPH1-202ENST00000392832 3044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CUL3Q13618 C9orf57-201ENST00000377024 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
CUL3Q13618 USP8-201ENST00000307179 4243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
CUL3Q13618 NOSTRIN-206ENST00000444448 2537 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CUL3Q13618 AC087473.1-201ENST00000561320 2471 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
CUL3Q13618 AC104260.2-201ENST00000623551 3497 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CUL3Q13618 H3F3A-201ENST00000366813 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
CUL3Q13618 TCF12-214ENST00000559710 1314 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CUL3Q13618 ZNF431-201ENST00000311048 13894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
CUL3Q13618 LINC01699-201ENST00000319701 259 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CUL3Q13618 UQCR10-201ENST00000330029 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
CUL3Q13618 RNA5SP375-201ENST00000362975 119 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CUL3Q13618 RNU105B-201ENST00000364478 208 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CUL3Q13618 C6orf48-208ENST00000395788 815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CUL3Q13618 RNA5SP156-201ENST00000410250 110 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CUL3Q13618 METTL15P3-201ENST00000415522 1221 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CUL3Q13618 LINC00317-201ENST00000419069 612 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
CUL3Q13618 LINC00310-202ENST00000419881 910 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CUL3Q13618 FAM183DP-201ENST00000421987 399 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CUL3Q13618 Z99289.1-206ENST00000425503 393 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CUL3Q13618 HSPE1P16-201ENST00000426640 348 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CUL3Q13618 LCE6A-201ENST00000431011 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
CUL3Q13618 AL353751.1-203ENST00000437032 603 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CUL3Q13618 AC010086.1-201ENST00000437359 1052 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CUL3Q13618 RPS10P18-201ENST00000442662 495 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CUL3Q13618 AL583839.2-201ENST00000443716 641 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CUL3Q13618 OSBPL10-AS1-205ENST00000444503 526 ntTSL 4 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CUL3Q13618 LINC02096-201ENST00000445035 953 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CUL3Q13618 AP000402.1-201ENST00000446404 540 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CUL3Q13618 AC096639.1-201ENST00000456240 347 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CUL3Q13618 AC000061.1-201ENST00000456270 376 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CUL3Q13618 AL035443.1-201ENST00000456631 304 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CUL3Q13618 RPL23AP40-201ENST00000487630 390 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.2 ms