Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 LINC02495-203ENST00000636704 242 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
SP140Q13342 LINC02341-202ENST00000637462 1295 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
SP140Q13342 TMEM200A-202ENST00000392429 5017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
SP140Q13342 HTR2A-202ENST00000542664 5429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
SP140Q13342 SCN2A-209ENST00000636071 8881 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
SP140Q13342 SCN2A-214ENST00000636985 8856 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
SP140Q13342 ANKRD26P1-204ENST00000571006 4741 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
SP140Q13342 CCAR1-217ENST00000543719 3521 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
SP140Q13342 KCNJ2-201ENST00000243457 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
SP140Q13342 AC097063.1-201ENST00000426714 1797 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
SP140Q13342 TRAF5-201ENST00000261464 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
SP140Q13342 AC007744.1-201ENST00000607540 2289 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
SP140Q13342 IFIT1-201ENST00000371804 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
SP140Q13342 TBC1D23-202ENST00000394144 3677 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
SP140Q13342 BICRAL-202ENST00000394168 6515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
SP140Q13342 ZNF92-201ENST00000328747 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
SP140Q13342 IPO8-209ENST00000544829 3212 ntTSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
SP140Q13342 AC011369.2-201ENST00000624423 1567 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
SP140Q13342 MYPN-204ENST00000540630 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
SP140Q13342 ITCH-201ENST00000262650 3089 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
SP140Q13342 GCSAML-201ENST00000366488 3820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
SP140Q13342 GRIA3-207ENST00000620443 4943 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
SP140Q13342 SPHKAP-201ENST00000344657 6804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
SP140Q13342 ENTPD1-AS1-202ENST00000416301 4241 ntTSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
SP140Q13342 DICER1-202ENST00000393063 10220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
SP140Q13342 RAPH1-204ENST00000418114 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
SP140Q13342 RAPH1-205ENST00000419464 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
SP140Q13342 VPS35-201ENST00000299138 6790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
SP140Q13342 LDHC-201ENST00000280704 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
SP140Q13342 FDCSP-201ENST00000317987 566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
SP140Q13342 RNU6-481P-201ENST00000384194 107 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
SP140Q13342 AP003170.5-201ENST00000397185 335 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
SP140Q13342 AL033519.1-201ENST00000407266 307 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
SP140Q13342 AL359636.2-201ENST00000412262 259 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
SP140Q13342 AL391645.1-201ENST00000417409 506 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
SP140Q13342 C7orf69-201ENST00000418326 675 ntTSL 4 BASIC6.27□□□□□ -1.41
SP140Q13342 LINC02246-202ENST00000418954 717 ntTSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
SP140Q13342 AC074035.1-201ENST00000420725 1184 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
SP140Q13342 GLUD1P9-201ENST00000420997 1173 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
SP140Q13342 AL157884.1-201ENST00000424561 454 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
SP140Q13342 AC104463.2-201ENST00000428573 314 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
SP140Q13342 LHFPL3-AS1-204ENST00000433514 748 ntTSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
SP140Q13342 AFF2-IT1-201ENST00000435346 443 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
SP140Q13342 LINC01967-202ENST00000437506 515 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
SP140Q13342 AL353768.1-201ENST00000439872 487 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
SP140Q13342 AL590652.1-201ENST00000453790 850 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
SP140Q13342 AC093166.2-201ENST00000455969 1017 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
SP140Q13342 CEP70-205ENST00000464035 1054 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
SP140Q13342 LINC01214-201ENST00000471222 335 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
SP140Q13342 CBX1P5-201ENST00000475330 559 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
SP140Q13342 LINC02025-201ENST00000488348 360 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
SP140Q13342 AC078785.1-205ENST00000491578 482 ntTSL 4 BASIC6.27□□□□□ -1.41
SP140Q13342 RPL5P23-201ENST00000496040 868 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
SP140Q13342 AC093607.1-202ENST00000499715 559 ntTSL 4 BASIC6.27□□□□□ -1.41
SP140Q13342 AC010374.1-201ENST00000503762 1237 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
SP140Q13342 AC018645.1-201ENST00000505003 109 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
SP140Q13342 AK6-204ENST00000512561 587 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
SP140Q13342 MYBL1-206ENST00000524176 2148 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
SP140Q13342 CASP1P2-201ENST00000526830 1258 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
SP140Q13342 AL133399.1-201ENST00000527476 298 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
SP140Q13342 AC010735.1-201ENST00000567305 1026 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
SP140Q13342 AP001357.1-201ENST00000586304 1053 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
SP140Q13342 AC006305.2-201ENST00000589617 552 ntTSL 4 BASIC6.27□□□□□ -1.41
SP140Q13342 BNIP3P24-201ENST00000593398 557 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
SP140Q13342 SNX6P1-201ENST00000601728 1224 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
SP140Q13342 AC024589.2-201ENST00000605642 1294 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
SP140Q13342 FAM72A-208ENST00000607379 1139 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
SP140Q13342 AC106052.1-201ENST00000608029 497 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
SP140Q13342 AL589743.6-201ENST00000611025 117 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
SP140Q13342 AL133370.2-201ENST00000619934 439 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
SP140Q13342 N4BP2L1-209ENST00000530622 1897 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
SP140Q13342 PSG5-210ENST00000599812 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
SP140Q13342 DAOA-AS1-201ENST00000448407 2482 ntTSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
SP140Q13342 AC011346.1-201ENST00000638059 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
SP140Q13342 IBTK-210ENST00000610980 5195 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
SP140Q13342 OR51E1-201ENST00000396952 3612 ntAPPRIS P1 BASIC6.27□□□□□ -1.41
SP140Q13342 LINC02227-201ENST00000619068 3748 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
SP140Q13342 GRIA2-204ENST00000393815 5260 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
SP140Q13342 BANK1-206ENST00000504592 3544 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
SP140Q13342 AC125336.1-201ENST00000508893 2827 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
SP140Q13342 SCML2-202ENST00000398048 1334 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
SP140Q13342 AC007342.5-201ENST00000571340 2142 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
SP140Q13342 FLG-201ENST00000368799 12747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
SP140Q13342 AC010894.3-202ENST00000412835 1405 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
SP140Q13342 GIGYF2-246ENST00000629305 7878 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
SP140Q13342 TCF7L2-222ENST00000627217 3680 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
SP140Q13342 AL133284.1-201ENST00000423715 4996 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
SP140Q13342 CEACAM1-203ENST00000352591 3170 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
SP140Q13342 CCDC26-201ENST00000446592 1721 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
SP140Q13342 CAMSAP2-201ENST00000236925 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
SP140Q13342 CCDC169-202ENST00000239860 716 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
SP140Q13342 CSN3-201ENST00000304954 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
SP140Q13342 OR5P2-201ENST00000329434 1069 ntAPPRIS P1 BASIC6.26□□□□□ -1.41
SP140Q13342 TERB2-201ENST00000340827 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
SP140Q13342 MT-ND2-201ENST00000361453 1042 ntAPPRIS P1 BASIC6.26□□□□□ -1.41
SP140Q13342 RNU5B-4P-201ENST00000363508 111 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
SP140Q13342 SNORD8-201ENST00000363915 110 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
SP140Q13342 RNU6-1251P-201ENST00000364502 107 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
SP140Q13342 GSTA12P-201ENST00000402398 508 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
SP140Q13342 RN7SKP281-201ENST00000410472 352 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.2 ms