Protein–RNA interactions for Protein: Q12946

FOXF1, Forkhead box protein F1, humanhuman

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Length 379 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF1Q12946 GTF2IP4-201ENST00000453092 2054 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
FOXF1Q12946 KCNJ16-202ENST00000392670 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
FOXF1Q12946 FRMD6-205ENST00000554167 4176 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
FOXF1Q12946 PUS10-203ENST00000407787 1820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
FOXF1Q12946 UNC5C-205ENST00000610318 9403 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
FOXF1Q12946 ROR1-204ENST00000545203 5362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
FOXF1Q12946 EMC2-201ENST00000220853 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
FOXF1Q12946 RLN1-201ENST00000223862 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
FOXF1Q12946 OR56A4-201ENST00000330728 1209 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
FOXF1Q12946 SNORA64.1-201ENST00000362600 132 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
FOXF1Q12946 RNA5SP510-201ENST00000364697 99 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
FOXF1Q12946 FETUB-203ENST00000382136 1040 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
FOXF1Q12946 KRTAP29-1-201ENST00000391353 1026 ntAPPRIS P1 BASIC5.19□□□□□ -1.58
FOXF1Q12946 RPL11P3-201ENST00000395256 523 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
FOXF1Q12946 RPS3AP2-201ENST00000407190 754 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
FOXF1Q12946 KCNJ13-202ENST00000409779 1099 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
FOXF1Q12946 OR5W1P-201ENST00000423705 938 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
FOXF1Q12946 HMGB3P24-201ENST00000433260 622 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
FOXF1Q12946 AF130359.1-201ENST00000444868 438 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
FOXF1Q12946 AL158825.2-201ENST00000455336 670 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
FOXF1Q12946 PEX5L-AS1-201ENST00000466064 827 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
FOXF1Q12946 RPSAP37-201ENST00000470913 821 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
FOXF1Q12946 AC117394.1-201ENST00000477323 567 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
FOXF1Q12946 ST13P12-201ENST00000508958 1094 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
FOXF1Q12946 LINC02432-203ENST00000511213 719 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
FOXF1Q12946 AC025524.2-206ENST00000517953 439 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
FOXF1Q12946 LINCR-0001-202ENST00000518098 524 ntTSL 4 BASIC5.19□□□□□ -1.58
FOXF1Q12946 AC109466.1-202ENST00000523648 748 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
FOXF1Q12946 AL162511.1-201ENST00000556542 879 ntTSL 4 BASIC5.19□□□□□ -1.58
FOXF1Q12946 AC009097.1-201ENST00000567077 406 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
FOXF1Q12946 AC018761.4-201ENST00000585742 272 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
FOXF1Q12946 AC003991.1-201ENST00000594469 484 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
FOXF1Q12946 AC012313.4-201ENST00000596296 495 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
FOXF1Q12946 ZNF418-210ENST00000600989 597 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
FOXF1Q12946 AC090607.5-201ENST00000615692 224 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
FOXF1Q12946 RN7SL544P-201ENST00000617232 284 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
FOXF1Q12946 RN7SL763P-201ENST00000620922 284 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
FOXF1Q12946 AL139220.2-221ENST00000628123 395 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
FOXF1Q12946 OR56A4-203ENST00000641279 1209 ntAPPRIS P1 BASIC5.19□□□□□ -1.58
FOXF1Q12946 LRRC37A3-204ENST00000400877 3273 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
FOXF1Q12946 FBXO38-218ENST00000513826 3585 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
FOXF1Q12946 ELOVL6-202ENST00000394607 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
FOXF1Q12946 KCTD4-201ENST00000379108 1865 ntAPPRIS P1 BASIC5.19□□□□□ -1.58
FOXF1Q12946 ZNF195-201ENST00000005082 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
FOXF1Q12946 PAK3-201ENST00000262836 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
FOXF1Q12946 PAK3-205ENST00000417227 2196 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
FOXF1Q12946 KBTBD3-201ENST00000526793 3751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
FOXF1Q12946 C4orf36-203ENST00000473559 2306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
FOXF1Q12946 ZNF227-208ENST00000589005 2943 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
FOXF1Q12946 ZNF107-205ENST00000613690 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
FOXF1Q12946 RNF150-202ENST00000420921 3673 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
FOXF1Q12946 LINC01958-201ENST00000637749 1941 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
FOXF1Q12946 CHMP1B2P-202ENST00000614414 6813 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
FOXF1Q12946 LYVE1-201ENST00000256178 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
FOXF1Q12946 KCNJ1-204ENST00000392665 4074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
FOXF1Q12946 PTPRD-214ENST00000540109 6210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
FOXF1Q12946 DOPEY1-201ENST00000237163 7995 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
FOXF1Q12946 IGSF6-201ENST00000268389 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
FOXF1Q12946 MRE11-203ENST00000393241 2604 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
FOXF1Q12946 ZNF615-201ENST00000376716 4048 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
FOXF1Q12946 ATXN2-215ENST00000542287 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
FOXF1Q12946 LINC00630-201ENST00000416381 2012 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
FOXF1Q12946 ZNF345-215ENST00000614069 3103 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
FOXF1Q12946 SETDB2-205ENST00000611815 5313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
FOXF1Q12946 C4orf33-202ENST00000425929 1588 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
FOXF1Q12946 AL022344.1-201ENST00000439913 3965 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
FOXF1Q12946 RNA5SP284-201ENST00000384547 118 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
FOXF1Q12946 IGLV3-10-201ENST00000390315 382 ntAPPRIS P1 BASIC5.18□□□□□ -1.58
FOXF1Q12946 HMGB1P20-201ENST00000402555 677 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
FOXF1Q12946 SYCE3-202ENST00000406915 448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
FOXF1Q12946 AC099654.1-202ENST00000415836 564 ntTSL 4 BASIC5.18□□□□□ -1.58
FOXF1Q12946 AL022331.1-201ENST00000429025 477 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
FOXF1Q12946 AC092168.2-201ENST00000430586 717 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
FOXF1Q12946 RPS29P14-201ENST00000431518 171 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
FOXF1Q12946 GAPDHP34-201ENST00000432112 823 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
FOXF1Q12946 AC242426.1-201ENST00000435270 960 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
FOXF1Q12946 AC017074.2-201ENST00000439382 607 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
FOXF1Q12946 AC073109.1-201ENST00000445066 978 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
FOXF1Q12946 AL445665.1-202ENST00000452436 324 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
FOXF1Q12946 AC093719.1-201ENST00000480427 441 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
FOXF1Q12946 RN7SL570P-201ENST00000484405 292 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
FOXF1Q12946 AC073610.1-201ENST00000489971 396 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
FOXF1Q12946 LINC00518-204ENST00000491317 1228 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
FOXF1Q12946 OR7E157P-201ENST00000494376 911 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
FOXF1Q12946 AC090204.1-202ENST00000500843 737 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
FOXF1Q12946 LINC00483-204ENST00000502517 940 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
FOXF1Q12946 AC023136.1-201ENST00000513093 1105 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
FOXF1Q12946 SNORD46.2-201ENST00000516021 102 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
FOXF1Q12946 LINC00967-201ENST00000517689 792 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
FOXF1Q12946 AC021678.3-201ENST00000517893 476 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
FOXF1Q12946 AC107884.2-201ENST00000530963 550 ntTSL 4 BASIC5.18□□□□□ -1.58
FOXF1Q12946 HMGB1P42-201ENST00000532126 553 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
FOXF1Q12946 GPRC5D-AS1-205ENST00000540198 404 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
FOXF1Q12946 AP000842.3-201ENST00000564354 808 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
FOXF1Q12946 PWRN1-207ENST00000565893 818 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
FOXF1Q12946 AC114488.3-201ENST00000581333 480 ntTSL 4 BASIC5.18□□□□□ -1.58
FOXF1Q12946 AC060780.2-201ENST00000589047 198 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
FOXF1Q12946 HIRAP1-201ENST00000605318 787 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
FOXF1Q12946 OBSCN-201ENST00000284548 20432 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
FOXF1Q12946 DTNA-230ENST00000598334 3201 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
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