Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 C5orf64-204ENST00000507461 535 ntTSL 4 BASIC5.08□□□□□ -1.6
PTPN13Q12923 AC096577.1-202ENST00000515649 448 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
PTPN13Q12923 AC091979.1-201ENST00000517595 706 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
PTPN13Q12923 UQCRB-209ENST00000523920 695 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
PTPN13Q12923 TRAV30-201ENST00000557168 337 ntAPPRIS P1 BASIC5.08□□□□□ -1.6
PTPN13Q12923 AC015912.1-201ENST00000574826 538 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
PTPN13Q12923 MIR4675-201ENST00000577898 77 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PTPN13Q12923 AC104118.1-201ENST00000607625 1589 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PTPN13Q12923 PPP3CB-AS1-213ENST00000620302 501 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
PTPN13Q12923 PFKM-232ENST00000629846 381 ntTSL 4 BASIC5.08□□□□□ -1.6
PTPN13Q12923 LINC02246-206ENST00000630211 712 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
PTPN13Q12923 MAPK10-287ENST00000641217 3037 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PTPN13Q12923 GTF2IP4-201ENST00000453092 2054 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PTPN13Q12923 FAM13C-219ENST00000621119 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
PTPN13Q12923 TIA1-201ENST00000282574 3823 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
PTPN13Q12923 OSBPL9-206ENST00000453295 2842 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
PTPN13Q12923 FCF1-201ENST00000341162 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
PTPN13Q12923 OR7D2-202ENST00000641288 3248 ntAPPRIS P1 BASIC5.08□□□□□ -1.6
PTPN13Q12923 ASPH-209ENST00000517903 2658 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
PTPN13Q12923 DSPP-201ENST00000282478 4281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
PTPN13Q12923 RNA5SP131-201ENST00000365452 119 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PTPN13Q12923 CAV1-204ENST00000393470 598 ntTSL 4 BASIC5.07□□□□□ -1.6
PTPN13Q12923 AL592402.1-201ENST00000417161 440 ntTSL 4 BASIC5.07□□□□□ -1.6
PTPN13Q12923 AC078960.1-201ENST00000422160 177 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
PTPN13Q12923 AL157400.1-201ENST00000428166 368 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
PTPN13Q12923 AL049650.1-201ENST00000461548 823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
PTPN13Q12923 RSRC1-207ENST00000475278 1195 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
PTPN13Q12923 AC091965.3-201ENST00000506236 208 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PTPN13Q12923 LINC02231-201ENST00000510459 447 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
PTPN13Q12923 LINC02441-201ENST00000543651 552 ntTSL 4 BASIC5.07□□□□□ -1.6
PTPN13Q12923 AL121989.1-201ENST00000585888 746 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
PTPN13Q12923 WBP1LP8-201ENST00000617401 327 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PTPN13Q12923 GTF2IRD2P1-201ENST00000449689 2749 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PTPN13Q12923 AL023495.1-201ENST00000413005 1923 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
PTPN13Q12923 PTPN2-212ENST00000591497 3390 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
PTPN13Q12923 OSBPL9-205ENST00000447887 2940 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
PTPN13Q12923 PIGW-206ENST00000620233 2264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
PTPN13Q12923 CNOT4-205ENST00000423368 3297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
PTPN13Q12923 FIGN-201ENST00000333129 9536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
PTPN13Q12923 UGGT1-201ENST00000259253 10650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
PTPN13Q12923 MDM4-215ENST00000614459 9782 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
PTPN13Q12923 HOMEZ-203ENST00000561013 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
PTPN13Q12923 C16orf62-202ENST00000417362 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
PTPN13Q12923 DSC1-202ENST00000257198 4225 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
PTPN13Q12923 MITF-201ENST00000314557 1798 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
PTPN13Q12923 CPS1-212ENST00000619804 1542 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
PTPN13Q12923 C1orf140-202ENST00000439004 4340 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
PTPN13Q12923 AL442071.1-201ENST00000289890 558 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
PTPN13Q12923 AP003170.5-201ENST00000397185 335 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PTPN13Q12923 AC084816.1-201ENST00000413794 565 ntTSL 4 BASIC5.07□□□□□ -1.6
PTPN13Q12923 DNAJC19P7-201ENST00000428811 344 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PTPN13Q12923 AC090589.1-201ENST00000473109 362 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PTPN13Q12923 AC022215.1-201ENST00000481770 362 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PTPN13Q12923 AC092824.1-201ENST00000483524 576 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PTPN13Q12923 AC013701.1-201ENST00000522657 465 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PTPN13Q12923 AP000851.1-202ENST00000542119 743 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
PTPN13Q12923 LINC02451-201ENST00000546982 565 ntTSL 4 BASIC5.07□□□□□ -1.6
PTPN13Q12923 LINC02394-201ENST00000549140 543 ntTSL 4 BASIC5.07□□□□□ -1.6
PTPN13Q12923 TVP23B-209ENST00000581733 1258 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
PTPN13Q12923 AL353662.3-201ENST00000625131 237 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PTPN13Q12923 KLHL2-204ENST00000506761 2169 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
PTPN13Q12923 TYW3-203ENST00000457880 3335 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
PTPN13Q12923 DHX32-201ENST00000284690 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
PTPN13Q12923 MAPK10-251ENST00000640858 3052 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
PTPN13Q12923 PIK3CB-201ENST00000289153 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
PTPN13Q12923 ERC2-214ENST00000612797 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
PTPN13Q12923 SBNO1-201ENST00000267176 11121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
PTPN13Q12923 ZNF91-202ENST00000397082 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
PTPN13Q12923 TTI1-202ENST00000373448 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
PTPN13Q12923 MGAM2-201ENST00000477922 7867 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PTPN13Q12923 BRCA1-221ENST00000493795 5732 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PTPN13Q12923 IKZF3-202ENST00000346243 1296 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PTPN13Q12923 AL353625.1-202ENST00000366273 571 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PTPN13Q12923 U3.30-201ENST00000391308 210 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PTPN13Q12923 AL023284.3-201ENST00000407767 334 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PTPN13Q12923 RPS15AP30-201ENST00000420976 390 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PTPN13Q12923 ALG13-AS1-201ENST00000430794 195 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PTPN13Q12923 IKZF3-212ENST00000439016 1246 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PTPN13Q12923 AC109462.1-201ENST00000491087 368 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PTPN13Q12923 NECTIN3-AS1-205ENST00000491709 792 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PTPN13Q12923 AC106732.1-201ENST00000512458 550 ntTSL 4 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PTPN13Q12923 LINC02429-202ENST00000513836 694 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PTPN13Q12923 AP001267.3-204ENST00000528578 423 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PTPN13Q12923 OR11H7-201ENST00000553765 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PTPN13Q12923 RPL27-207ENST00000590864 569 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PTPN13Q12923 AC135068.12-201ENST00000637370 931 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PTPN13Q12923 AC009166.2-201ENST00000624410 2833 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PTPN13Q12923 OR5A2-202ENST00000641361 6655 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PTPN13Q12923 PSG1-204ENST00000436291 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
PTPN13Q12923 RXFP2-201ENST00000298386 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
PTPN13Q12923 LNPK-212ENST00000544803 7647 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
PTPN13Q12923 DGKB-202ENST00000402815 5595 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PTPN13Q12923 POGZ-204ENST00000392723 6152 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
PTPN13Q12923 SMC1A-202ENST00000375340 9930 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
PTPN13Q12923 AC005332.9-201ENST00000620266 2921 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PTPN13Q12923 NPVF-201ENST00000222674 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
PTPN13Q12923 AL354771.1-201ENST00000452178 602 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PTPN13Q12923 INTS9-AS1-201ENST00000520055 548 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PTPN13Q12923 AL583808.2-201ENST00000418078 1382 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PTPN13Q12923 WDPCP-204ENST00000409199 2466 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
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