Protein–RNA interactions for Protein: Q12772

SREBF2, Sterol regulatory element-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SREBF2Q12772 AC127164.1-201ENST00000548738 4196 ntTSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
SREBF2Q12772 GRIK1-201ENST00000327783 3179 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
SREBF2Q12772 MR1-209ENST00000617803 7584 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
SREBF2Q12772 AC107980.1-201ENST00000558671 3355 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
SREBF2Q12772 EIF4E-203ENST00000450253 11523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
SREBF2Q12772 YES1-203ENST00000577961 4554 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
SREBF2Q12772 POLR2B-202ENST00000381227 4108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
SREBF2Q12772 ADNP-202ENST00000371602 6115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
SREBF2Q12772 DNHD1-212ENST00000527990 14298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
SREBF2Q12772 MLH3-202ENST00000380968 7819 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
SREBF2Q12772 AL159987.1-201ENST00000347911 293 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
SREBF2Q12772 RN7SKP28-201ENST00000364770 305 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
SREBF2Q12772 OR2W4P-201ENST00000406496 926 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
SREBF2Q12772 MYL6P5-201ENST00000412707 459 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
SREBF2Q12772 PTCD2P2-201ENST00000415579 1095 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
SREBF2Q12772 AL445190.1-201ENST00000416448 288 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
SREBF2Q12772 AL136979.1-201ENST00000421645 1120 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
SREBF2Q12772 AC019205.1-201ENST00000421830 730 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
SREBF2Q12772 HMGB1P32-201ENST00000425971 565 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
SREBF2Q12772 AC097721.1-201ENST00000427150 1253 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
SREBF2Q12772 AP003774.4-201ENST00000447028 672 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
SREBF2Q12772 CASP12-208ENST00000448103 1071 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
SREBF2Q12772 MTND4LP12-201ENST00000448237 295 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
SREBF2Q12772 AL162427.1-201ENST00000450399 439 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
SREBF2Q12772 SDC4P-201ENST00000453285 601 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
SREBF2Q12772 CASP12-210ENST00000494737 961 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
SREBF2Q12772 CCDC11P1-201ENST00000503137 1162 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
SREBF2Q12772 AC122710.1-201ENST00000510622 553 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
SREBF2Q12772 LINC01598-206ENST00000513381 499 ntTSL 4 BASIC6.7□□□□□ -1.34
SREBF2Q12772 LINC00861-202ENST00000517869 606 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
SREBF2Q12772 SNHG1-204ENST00000537068 629 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
SREBF2Q12772 MIR3691-201ENST00000578066 90 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
SREBF2Q12772 TEX26-AS1-204ENST00000585582 853 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
SREBF2Q12772 MIR6810-201ENST00000622701 70 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
SREBF2Q12772 AC005972.4-201ENST00000636248 1131 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
SREBF2Q12772 AC013488.1-201ENST00000526618 1838 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
SREBF2Q12772 C16orf62-202ENST00000417362 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
SREBF2Q12772 ZBTB38-222ENST00000637056 6056 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
SREBF2Q12772 NOS1-201ENST00000317775 12158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
SREBF2Q12772 AC087516.1-201ENST00000561236 2428 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
SREBF2Q12772 NCOA4P3-201ENST00000513203 1877 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
SREBF2Q12772 CYLD-203ENST00000427738 8503 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
SREBF2Q12772 PIGN-220ENST00000638167 4195 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
SREBF2Q12772 NAPEPLD-203ENST00000417955 4988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
SREBF2Q12772 MGAM2-201ENST00000477922 7867 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
SREBF2Q12772 BDNF-AS-201ENST00000499008 2324 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
SREBF2Q12772 DLGAP5-202ENST00000395425 2954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
SREBF2Q12772 ZNF542P-202ENST00000467807 3209 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
SREBF2Q12772 TRPC5OS-201ENST00000371970 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
SREBF2Q12772 AP001636.3-201ENST00000533954 2810 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SREBF2Q12772 LINC01415-201ENST00000587320 4071 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SREBF2Q12772 LINC02401-201ENST00000550185 3059 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
SREBF2Q12772 PIK3C2A-201ENST00000265970 8227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
SREBF2Q12772 TEX41-210ENST00000451774 2098 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
SREBF2Q12772 TAF7L-203ENST00000372907 2341 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
SREBF2Q12772 AL353751.1-201ENST00000354541 495 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SREBF2Q12772 RNU1-77P-201ENST00000390868 162 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SREBF2Q12772 CAV1-204ENST00000393470 598 ntTSL 4 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SREBF2Q12772 CCL7-202ENST00000394627 696 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SREBF2Q12772 AL807761.1-201ENST00000417622 171 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SREBF2Q12772 AL136455.1-201ENST00000441083 1240 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SREBF2Q12772 EIF4EBP2P1-201ENST00000450009 343 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SREBF2Q12772 AL157777.1-201ENST00000468100 304 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SREBF2Q12772 RN7SL570P-201ENST00000484405 292 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SREBF2Q12772 LINC02485-202ENST00000511899 770 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SREBF2Q12772 AC131953.1-201ENST00000513127 477 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SREBF2Q12772 AC100801.1-201ENST00000517368 517 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SREBF2Q12772 AC040914.1-201ENST00000518674 318 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SREBF2Q12772 TPM3P3-201ENST00000521343 354 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SREBF2Q12772 OR5AP2-201ENST00000544374 1006 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SREBF2Q12772 OR1F2P-201ENST00000570470 933 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SREBF2Q12772 ODF4-202ENST00000584943 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
SREBF2Q12772 AC079791.1-201ENST00000605356 973 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SREBF2Q12772 WBP1LP8-201ENST00000617401 327 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SREBF2Q12772 AL731566.2-201ENST00000618971 317 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SREBF2Q12772 LINC02342-201ENST00000627910 461 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SREBF2Q12772 ZNF93-209ENST00000638737 1020 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SREBF2Q12772 TSHZ2-202ENST00000371497 12187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
SREBF2Q12772 CHRDL1-202ENST00000372045 3860 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
SREBF2Q12772 DGKB-201ENST00000399322 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SREBF2Q12772 CNOT1-202ENST00000441024 4999 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
SREBF2Q12772 PDGFRA-201ENST00000257290 6576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
SREBF2Q12772 SYNJ2BP-201ENST00000256366 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
SREBF2Q12772 DLG1-213ENST00000443183 2516 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SREBF2Q12772 SLC35F1-202ENST00000621341 4481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
SREBF2Q12772 ARHGAP20-205ENST00000529591 2623 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
SREBF2Q12772 CCDC158-201ENST00000388914 3663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
SREBF2Q12772 AC022819.1-201ENST00000563495 3910 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
SREBF2Q12772 CTNNA1P1-201ENST00000515849 2728 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
SREBF2Q12772 CSDE1-201ENST00000261443 3228 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
SREBF2Q12772 NLRP13-202ENST00000588751 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
SREBF2Q12772 LRRC36-202ENST00000435835 1765 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
SREBF2Q12772 DPCR1-202ENST00000462446 5314 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
SREBF2Q12772 GCSAML-210ENST00000536561 4063 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC6.68□□□□□ -1.34
SREBF2Q12772 TBC1D32-204ENST00000398212 3824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
SREBF2Q12772 AL390243.1-201ENST00000422038 708 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
SREBF2Q12772 AL162408.1-201ENST00000428853 433 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
SREBF2Q12772 CLEC5A-203ENST00000439991 501 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
SREBF2Q12772 AL663074.2-201ENST00000440621 479 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
SREBF2Q12772 MTCO3P17-201ENST00000443775 513 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
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