Protein–RNA interactions for Protein: P45954

ACADSB, Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSBP45954 RDM1-226ENST00000619828 687 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
ACADSBP45954 AC022400.9-201ENST00000623633 273 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
ACADSBP45954 MIR1910-201ENST00000636955 80 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
ACADSBP45954 OR8G3P-202ENST00000641572 1255 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
ACADSBP45954 PSD3-204ENST00000440756 11690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
ACADSBP45954 GTF2IRD2P1-202ENST00000618962 3055 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
ACADSBP45954 AC015799.1-201ENST00000622996 3122 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
ACADSBP45954 VNN3-203ENST00000392393 1603 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
ACADSBP45954 KRT222-202ENST00000394052 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
ACADSBP45954 CPS1-IT1-201ENST00000628368 2306 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
ACADSBP45954 SMAP1-206ENST00000619054 3150 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
ACADSBP45954 VPS13B-203ENST00000358544 14094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
ACADSBP45954 NAT2-201ENST00000286479 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
ACADSBP45954 BACH1-201ENST00000286800 5669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
ACADSBP45954 NOSTRIN-201ENST00000317647 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
ACADSBP45954 CAPN6-201ENST00000324068 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
ACADSBP45954 TAF13-201ENST00000338366 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
ACADSBP45954 RMDN2-202ENST00000354545 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
ACADSBP45954 OR6K2-201ENST00000359610 975 ntAPPRIS P1 BASIC6.12□□□□□ -1.43
ACADSBP45954 RN7SKP78-201ENST00000364711 318 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
ACADSBP45954 PKIB-203ENST00000368446 556 ntTSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
ACADSBP45954 APOOL-201ENST00000373173 1279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
ACADSBP45954 MCM10-202ENST00000378714 4547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
ACADSBP45954 RAB5CP1-201ENST00000395972 580 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
ACADSBP45954 SLC17A4-202ENST00000397076 2331 ntTSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
ACADSBP45954 HMGN1P20-201ENST00000411849 300 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
ACADSBP45954 CHD2-202ENST00000420239 2221 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
ACADSBP45954 CDY8P-201ENST00000428380 1279 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
ACADSBP45954 AC108066.1-201ENST00000437261 596 ntTSL 4 BASIC6.12□□□□□ -1.43
ACADSBP45954 KRT8P51-201ENST00000438938 274 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
ACADSBP45954 AL354793.1-201ENST00000446028 713 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
ACADSBP45954 CDY20P-201ENST00000447528 1279 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
ACADSBP45954 AC004129.2-201ENST00000457229 287 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
ACADSBP45954 AC093166.4-201ENST00000457867 318 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
ACADSBP45954 AC094085.1-201ENST00000468914 584 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
ACADSBP45954 AC117386.2-203ENST00000489690 557 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
ACADSBP45954 AC111000.5-201ENST00000506559 1178 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
ACADSBP45954 AC105384.2-201ENST00000508433 640 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
ACADSBP45954 AC074255.1-201ENST00000511259 501 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
ACADSBP45954 AC114781.3-201ENST00000512083 142 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
ACADSBP45954 IGHVII-60-1-201ENST00000519079 256 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
ACADSBP45954 AC134511.1-201ENST00000535721 192 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
ACADSBP45954 NANOGNBP2-201ENST00000544753 553 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
ACADSBP45954 LINC02411-203ENST00000546180 959 ntTSL 4 BASIC6.12□□□□□ -1.43
ACADSBP45954 AC073964.1-201ENST00000558938 308 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
ACADSBP45954 KIAA1328-202ENST00000586135 1863 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
ACADSBP45954 AC092070.2-203ENST00000598377 3644 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
ACADSBP45954 ZNF208-204ENST00000599916 740 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
ACADSBP45954 AL049840.6-201ENST00000604583 345 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
ACADSBP45954 NANOGP3-201ENST00000605855 286 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
ACADSBP45954 AL133481.2-203ENST00000607558 139 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
ACADSBP45954 NADK2-211ENST00000617628 744 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
ACADSBP45954 5S_rRNA.28-201ENST00000638107 119 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
ACADSBP45954 CDC42BPA-201ENST00000334218 10134 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
ACADSBP45954 FILIP1L-201ENST00000331335 4219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
ACADSBP45954 DTNA-230ENST00000598334 3201 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
ACADSBP45954 ZEB2-241ENST00000637304 9158 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
ACADSBP45954 SLC39A12-201ENST00000377369 2808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
ACADSBP45954 AC068870.3-201ENST00000625077 2536 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
ACADSBP45954 ZNF506-201ENST00000443905 4095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
ACADSBP45954 AP004607.3-201ENST00000530354 3915 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
ACADSBP45954 RGSL1-201ENST00000294854 3696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
ACADSBP45954 DCDC1-207ENST00000452803 1706 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
ACADSBP45954 AC109811.1-201ENST00000512833 2807 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
ACADSBP45954 CLEC2D-201ENST00000261339 465 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
ACADSBP45954 RPS3AP2-201ENST00000407190 754 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
ACADSBP45954 MRPL53P1-201ENST00000414323 319 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
ACADSBP45954 DPYD-IT1-201ENST00000424982 401 ntTSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
ACADSBP45954 BX323845.3-201ENST00000428215 527 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
ACADSBP45954 MAJIN-202ENST00000432175 838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
ACADSBP45954 AL162385.2-201ENST00000437864 285 ntTSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
ACADSBP45954 AL138899.2-201ENST00000439139 499 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
ACADSBP45954 AL512637.1-201ENST00000439523 1231 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
ACADSBP45954 AL121917.1-201ENST00000441270 893 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
ACADSBP45954 FRG2FP-204ENST00000453982 852 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
ACADSBP45954 HLA-DPA3-207ENST00000454398 229 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
ACADSBP45954 AC011476.1-201ENST00000466725 307 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
ACADSBP45954 LINC02339-201ENST00000472649 752 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
ACADSBP45954 RPS17P15-201ENST00000475609 349 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
ACADSBP45954 ST20-201ENST00000478497 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
ACADSBP45954 LINC00518-204ENST00000491317 1228 ntTSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
ACADSBP45954 NENFP3-201ENST00000503735 313 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
ACADSBP45954 LINC02432-203ENST00000511213 719 ntTSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
ACADSBP45954 LINCR-0001-202ENST00000518098 524 ntTSL 4 BASIC6.11□□□□□ -1.43
ACADSBP45954 AP000873.2-204ENST00000530825 375 ntTSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
ACADSBP45954 MITF-217ENST00000531774 1074 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
ACADSBP45954 AC007569.1-202ENST00000547282 303 ntTSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
ACADSBP45954 C15orf41-204ENST00000562877 764 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
ACADSBP45954 AC074050.3-201ENST00000569175 441 ntTSL 4 BASIC6.11□□□□□ -1.43
ACADSBP45954 AL513327.3-201ENST00000602618 469 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
ACADSBP45954 CDH18-210ENST00000511273 2318 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
ACADSBP45954 AQP9-201ENST00000219919 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
ACADSBP45954 MCF2L2-202ENST00000414362 3031 ntTSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
ACADSBP45954 CRB1-203ENST00000367400 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
ACADSBP45954 AC239868.2-201ENST00000564237 4527 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
ACADSBP45954 ZNF701-202ENST00000391785 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
ACADSBP45954 YPEL5-202ENST00000379519 2499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.1□□□□□ -1.43
ACADSBP45954 HCFC2P1-201ENST00000392864 1592 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
ACADSBP45954 AC099654.3-201ENST00000447087 1546 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
ACADSBP45954 AP000473.2-201ENST00000602659 1537 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82 ms