Protein–RNA interactions for Protein: P31271

HOXA13, Homeobox protein Hox-A13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 388 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA13P31271 OR52B5P-204ENST00000641744 3467 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
HOXA13P31271 HBG1-201ENST00000330597 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
HOXA13P31271 AC022826.2-201ENST00000358757 776 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.56□□□□□ -1.36
HOXA13P31271 LEMD1-203ENST00000367152 741 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
HOXA13P31271 FAIM-204ENST00000393035 946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
HOXA13P31271 RN7SKP293-201ENST00000411389 296 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
HOXA13P31271 AL596448.1-201ENST00000415024 392 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
HOXA13P31271 BMS1P17-202ENST00000416720 316 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
HOXA13P31271 NIFKP3-201ENST00000417799 865 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
HOXA13P31271 FMO7P-201ENST00000436045 768 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
HOXA13P31271 AC073909.1-201ENST00000447112 999 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
HOXA13P31271 AL358176.1-201ENST00000457477 357 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
HOXA13P31271 PHC3-208ENST00000481639 1075 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
HOXA13P31271 GCSAM-204ENST00000484193 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
HOXA13P31271 AC073610.1-201ENST00000489971 396 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
HOXA13P31271 SEMA6A-AS1-202ENST00000508424 862 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
HOXA13P31271 AC122710.1-201ENST00000510622 553 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
HOXA13P31271 KLRC1-204ENST00000536188 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
HOXA13P31271 GPRC5D-AS1-205ENST00000540198 404 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
HOXA13P31271 HSPE1P2-201ENST00000554777 306 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
HOXA13P31271 MTATP6P25-201ENST00000574491 261 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
HOXA13P31271 AP000897.2-201ENST00000579509 1057 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
HOXA13P31271 AC090953.1-201ENST00000604305 1092 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
HOXA13P31271 MIR6768-201ENST00000610734 72 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
HOXA13P31271 AC008115.3-201ENST00000614874 549 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
HOXA13P31271 AC002429.2-202ENST00000637269 394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
HOXA13P31271 LRRN3-201ENST00000308478 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
HOXA13P31271 ADAM18-202ENST00000379866 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
HOXA13P31271 AC114786.1-201ENST00000512892 1415 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
HOXA13P31271 ANKRD49-208ENST00000544253 3002 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
HOXA13P31271 SEC31A-226ENST00000508479 3397 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
HOXA13P31271 MUC4-215ENST00000475231 16273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
HOXA13P31271 WASHC4-202ENST00000332180 5812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
HOXA13P31271 AXDND1-201ENST00000367618 3642 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
HOXA13P31271 CEACAMP10-201ENST00000489959 1721 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
HOXA13P31271 ATXN7-208ENST00000484332 2741 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
HOXA13P31271 MYBPC1-209ENST00000547509 3749 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
HOXA13P31271 RABGEF1-202ENST00000380828 3864 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
HOXA13P31271 HHLA2-211ENST00000619531 2548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
HOXA13P31271 ZNF721-201ENST00000338977 4492 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
HOXA13P31271 AC117409.1-201ENST00000470499 1310 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
HOXA13P31271 PTPRB-210ENST00000551525 5291 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
HOXA13P31271 AL022323.4-201ENST00000623980 13120 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
HOXA13P31271 AC011933.2-201ENST00000578539 2790 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
HOXA13P31271 YES1P1-201ENST00000418510 1628 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
HOXA13P31271 NAT1-203ENST00000517492 2280 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
HOXA13P31271 SLC4A8-202ENST00000358657 11731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
HOXA13P31271 AL451046.1-201ENST00000406097 534 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
HOXA13P31271 RNA5SP251-201ENST00000410614 137 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
HOXA13P31271 LINC01203-201ENST00000419566 580 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
HOXA13P31271 NME1P1-201ENST00000420914 382 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
HOXA13P31271 AC244035.2-201ENST00000425896 630 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
HOXA13P31271 UBE2V2P3-201ENST00000433562 437 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
HOXA13P31271 AC096775.1-201ENST00000437724 448 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
HOXA13P31271 AC105021.1-201ENST00000455347 590 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
HOXA13P31271 AC105384.2-201ENST00000508433 640 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
HOXA13P31271 AC006296.1-201ENST00000514401 591 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
HOXA13P31271 LINC00535-202ENST00000517785 264 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
HOXA13P31271 WASHC5-AS1-201ENST00000519140 587 ntTSL 4 BASIC6.55□□□□□ -1.36
HOXA13P31271 AC078899.1-201ENST00000521432 1185 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
HOXA13P31271 AC111149.1-201ENST00000522560 343 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
HOXA13P31271 MINCR-206ENST00000524335 499 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
HOXA13P31271 AC091544.7-201ENST00000554000 240 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
HOXA13P31271 AC087286.2-201ENST00000558980 660 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
HOXA13P31271 AC090519.2-201ENST00000559034 655 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
HOXA13P31271 ULK4P1-201ENST00000564495 875 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
HOXA13P31271 ULK4P2-204ENST00000569682 798 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
HOXA13P31271 AC010615.3-201ENST00000597319 394 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
HOXA13P31271 AP000894.4-201ENST00000610185 483 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
HOXA13P31271 AC109309.2-201ENST00000612597 332 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
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HOXA13P31271 AL596275.2-208ENST00000641192 594 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
HOXA13P31271 KIAA0232-202ENST00000425103 7771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
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HOXA13P31271 LRRC49-201ENST00000260382 2784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
HOXA13P31271 LINC02019-201ENST00000608605 2060 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
HOXA13P31271 TMED10-201ENST00000303575 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
HOXA13P31271 AP4S1-212ENST00000622409 4113 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
HOXA13P31271 NLN-202ENST00000502464 8354 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
HOXA13P31271 MTTP-203ENST00000457717 4092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
HOXA13P31271 MTHFD2L-201ENST00000325278 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
HOXA13P31271 PPIL1-201ENST00000373699 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
HOXA13P31271 RNASEL-202ENST00000539397 4046 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
HOXA13P31271 PCLO-201ENST00000333891 20329 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
HOXA13P31271 NOSTRIN-201ENST00000317647 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
HOXA13P31271 TCF7L2-217ENST00000536810 3953 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
HOXA13P31271 RXFP1-203ENST00000343542 2130 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
HOXA13P31271 AL139095.4-201ENST00000379928 500 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
HOXA13P31271 TRAV8-7-201ENST00000390456 341 ntAPPRIS P1 BASIC6.54□□□□□ -1.36
HOXA13P31271 AC005323.2-201ENST00000399342 583 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
HOXA13P31271 KCNJ13-202ENST00000409779 1099 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
HOXA13P31271 Z98742.1-201ENST00000419801 632 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
HOXA13P31271 AC012368.2-201ENST00000423539 560 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
HOXA13P31271 AC008164.1-201ENST00000423925 564 ntTSL 4 BASIC6.54□□□□□ -1.36
HOXA13P31271 YY1P1-201ENST00000427625 668 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
HOXA13P31271 AL139280.1-201ENST00000436340 463 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
HOXA13P31271 CYCSP51-201ENST00000443545 318 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
HOXA13P31271 OR7E116P-201ENST00000448529 957 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
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