Protein–RNA interactions for Protein: E9PL57

NEDD8-MDP1, NEDD8-MDP1 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1E9PL57 BTLA-201ENST00000334529 3213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
NEDD8-MDP1E9PL57 MFSD8-219ENST00000641228 2559 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
NEDD8-MDP1E9PL57 AC007159.1-201ENST00000566529 4706 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC01504-201ENST00000436054 2078 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
NEDD8-MDP1E9PL57 SSH2-201ENST00000269033 9327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
NEDD8-MDP1E9PL57 SNORA70H-201ENST00000383910 135 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
NEDD8-MDP1E9PL57 SNORA70J-201ENST00000384182 135 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
NEDD8-MDP1E9PL57 RNASE9-202ENST00000404716 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
NEDD8-MDP1E9PL57 RMRPP5-201ENST00000411156 267 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
NEDD8-MDP1E9PL57 SMC4P1-201ENST00000414479 527 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
NEDD8-MDP1E9PL57 GPC5-AS2-201ENST00000417589 401 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
NEDD8-MDP1E9PL57 AC073909.1-201ENST00000447112 999 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
NEDD8-MDP1E9PL57 SRGAP3-AS4-201ENST00000449023 377 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
NEDD8-MDP1E9PL57 AL157371.1-201ENST00000451910 394 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
NEDD8-MDP1E9PL57 AC013549.1-201ENST00000454086 566 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
NEDD8-MDP1E9PL57 RNU1-88P-201ENST00000459274 128 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
NEDD8-MDP1E9PL57 RPL32P33-201ENST00000487023 394 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
NEDD8-MDP1E9PL57 RN7SL466P-201ENST00000497546 295 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
NEDD8-MDP1E9PL57 AC074087.1-201ENST00000512059 724 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
NEDD8-MDP1E9PL57 IGHVIII-67-4-201ENST00000524281 296 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC02327-205ENST00000550990 472 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
NEDD8-MDP1E9PL57 RNASE9-205ENST00000553706 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
NEDD8-MDP1E9PL57 AC020704.1-201ENST00000559394 454 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
NEDD8-MDP1E9PL57 AC022031.2-203ENST00000587346 565 ntTSL 4 BASIC5.96□□□□□ -1.46
NEDD8-MDP1E9PL57 AC025278.1-201ENST00000593558 515 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
NEDD8-MDP1E9PL57 AL512624.1-201ENST00000613638 469 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
NEDD8-MDP1E9PL57 IMMTP1-201ENST00000435590 2219 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
NEDD8-MDP1E9PL57 Z95114.1-201ENST00000624264 14574 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
NEDD8-MDP1E9PL57 UGT2A1-206ENST00000514019 2376 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
NEDD8-MDP1E9PL57 HCFC2P1-201ENST00000392864 1592 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
NEDD8-MDP1E9PL57 AC068769.1-201ENST00000474767 2426 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
NEDD8-MDP1E9PL57 CIR1P2-201ENST00000514821 1342 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
NEDD8-MDP1E9PL57 POGZ-213ENST00000491586 4130 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
NEDD8-MDP1E9PL57 MTCO1P46-201ENST00000451639 1491 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
NEDD8-MDP1E9PL57 AHNAK2-201ENST00000333244 18254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
NEDD8-MDP1E9PL57 CASC11-201ENST00000502463 3301 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
NEDD8-MDP1E9PL57 NFAT5-212ENST00000627621 5875 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
NEDD8-MDP1E9PL57 ASAH2-203ENST00000443575 1942 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
NEDD8-MDP1E9PL57 AIG1-208ENST00000494282 3393 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
NEDD8-MDP1E9PL57 MCM10-202ENST00000378714 4547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
NEDD8-MDP1E9PL57 AC130304.1-201ENST00000622942 2385 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF271P-205ENST00000639248 4573 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
NEDD8-MDP1E9PL57 SPATA31D5P-202ENST00000527857 4863 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
NEDD8-MDP1E9PL57 MRE11P1-201ENST00000464884 2127 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
NEDD8-MDP1E9PL57 C17orf105-201ENST00000449302 3753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
NEDD8-MDP1E9PL57 BDNF-205ENST00000395981 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
NEDD8-MDP1E9PL57 MMRN1-201ENST00000264790 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
NEDD8-MDP1E9PL57 WDR12-201ENST00000261015 8100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
NEDD8-MDP1E9PL57 RLN1-201ENST00000223862 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
NEDD8-MDP1E9PL57 OR2G3-201ENST00000320002 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.95□□□□□ -1.46
NEDD8-MDP1E9PL57 GKN1-201ENST00000377938 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
NEDD8-MDP1E9PL57 MIR143-201ENST00000385300 106 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
NEDD8-MDP1E9PL57 AL360271.1-201ENST00000395679 510 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
NEDD8-MDP1E9PL57 TANK-203ENST00000402568 878 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC02518-201ENST00000421737 524 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
NEDD8-MDP1E9PL57 AC004990.1-201ENST00000431722 564 ntTSL 4 BASIC5.95□□□□□ -1.46
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC00704-203ENST00000449712 703 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
NEDD8-MDP1E9PL57 AKR1C2-203ENST00000455190 1098 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
NEDD8-MDP1E9PL57 AP006216.2-201ENST00000457746 333 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
NEDD8-MDP1E9PL57 RN7SL72P-201ENST00000460697 269 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
NEDD8-MDP1E9PL57 CEACAMP10-201ENST00000489959 1721 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
NEDD8-MDP1E9PL57 CEP170-216ENST00000490813 1070 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
NEDD8-MDP1E9PL57 AC068672.3-203ENST00000505166 311 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
NEDD8-MDP1E9PL57 AC113349.1-201ENST00000512105 583 ntTSL 4 BASIC5.95□□□□□ -1.46
NEDD8-MDP1E9PL57 AC034238.3-201ENST00000512349 591 ntTSL 4 BASIC5.95□□□□□ -1.46
NEDD8-MDP1E9PL57 ATP5LP3-201ENST00000514223 304 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
NEDD8-MDP1E9PL57 MINCR-206ENST00000524335 499 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
NEDD8-MDP1E9PL57 RARSP1-201ENST00000542842 1418 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
NEDD8-MDP1E9PL57 AC125612.1-201ENST00000547580 377 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
NEDD8-MDP1E9PL57 AL049872.1-201ENST00000556323 322 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
NEDD8-MDP1E9PL57 AC007225.2-201ENST00000562529 256 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
NEDD8-MDP1E9PL57 DPPA2P4-201ENST00000563717 878 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
NEDD8-MDP1E9PL57 ULK4P1-201ENST00000564495 875 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
NEDD8-MDP1E9PL57 ULK4P2-204ENST00000569682 798 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
NEDD8-MDP1E9PL57 AC007842.1-201ENST00000597336 2039 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
NEDD8-MDP1E9PL57 DARS-AS1-217ENST00000599279 544 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
NEDD8-MDP1E9PL57 Metazoa_SRP.207-201ENST00000612254 285 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
NEDD8-MDP1E9PL57 AL138960.1-201ENST00000613838 513 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
NEDD8-MDP1E9PL57 Metazoa_SRP.43-201ENST00000616394 271 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
NEDD8-MDP1E9PL57 AL157762.1-201ENST00000619612 415 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
NEDD8-MDP1E9PL57 AC021422.1-201ENST00000621212 473 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
NEDD8-MDP1E9PL57 TLR10-208ENST00000622002 3673 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
NEDD8-MDP1E9PL57 NBPF20-205ENST00000622803 3689 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC01620-204ENST00000623295 700 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
NEDD8-MDP1E9PL57 AL390318.1-201ENST00000624564 687 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
NEDD8-MDP1E9PL57 CHD8-202ENST00000430710 7420 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
NEDD8-MDP1E9PL57 AP004607.3-201ENST00000530354 3915 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC00907-201ENST00000585627 3324 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
NEDD8-MDP1E9PL57 WDR72-203ENST00000557913 5900 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
NEDD8-MDP1E9PL57 TRRAP-204ENST00000446306 12492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
NEDD8-MDP1E9PL57 DYNC1I2-202ENST00000397119 2604 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
NEDD8-MDP1E9PL57 LYRM2-208ENST00000523377 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
NEDD8-MDP1E9PL57 AC123912.3-201ENST00000600907 1367 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
NEDD8-MDP1E9PL57 PCLO-201ENST00000333891 20329 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
NEDD8-MDP1E9PL57 PSG7-201ENST00000406070 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
NEDD8-MDP1E9PL57 LZTFL1-215ENST00000536047 4342 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
NEDD8-MDP1E9PL57 TTC21B-201ENST00000243344 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
NEDD8-MDP1E9PL57 CLSPN-202ENST00000318121 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
NEDD8-MDP1E9PL57 WDR63-202ENST00000326813 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
NEDD8-MDP1E9PL57 AL355306.2-206ENST00000635233 1903 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.1 ms