Protein–RNA interactions for Protein: B2RPK0

HMGB1P1, Putative high mobility group protein B1-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB1P1B2RPK0 ZNF322P1-201ENST00000568013 1209 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
HMGB1P1B2RPK0 AC090312.1-201ENST00000580637 348 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
HMGB1P1B2RPK0 MIR3689C-201ENST00000581239 72 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
HMGB1P1B2RPK0 AC090227.1-201ENST00000590532 936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
HMGB1P1B2RPK0 AL589863.1-201ENST00000595383 631 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
HMGB1P1B2RPK0 MTCO3P22-201ENST00000603219 784 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
HMGB1P1B2RPK0 TATDN1-220ENST00000605953 726 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
HMGB1P1B2RPK0 AL356056.3-201ENST00000605984 551 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
HMGB1P1B2RPK0 AL139407.1-201ENST00000613826 1175 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
HMGB1P1B2RPK0 AC020658.4-201ENST00000613987 684 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
HMGB1P1B2RPK0 5_8S_rRNA.1-201ENST00000614365 152 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
HMGB1P1B2RPK0 ZNF248-209ENST00000615949 518 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
HMGB1P1B2RPK0 AC015726.3-201ENST00000624501 418 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
HMGB1P1B2RPK0 AC009303.2-205ENST00000627670 1091 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
HMGB1P1B2RPK0 AP2B1-222ENST00000628168 192 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
HMGB1P1B2RPK0 OR2AK2-202ENST00000641852 1008 ntAPPRIS P2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
HMGB1P1B2RPK0 PALMD-201ENST00000263174 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
HMGB1P1B2RPK0 SH2D1B-201ENST00000367929 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
HMGB1P1B2RPK0 NOL4-202ENST00000535384 1853 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
HMGB1P1B2RPK0 GPX8-201ENST00000296734 3245 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
HMGB1P1B2RPK0 NT5C2-201ENST00000343289 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
HMGB1P1B2RPK0 STYX-202ENST00000442123 4554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
HMGB1P1B2RPK0 AC017002.4-201ENST00000604721 1525 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
HMGB1P1B2RPK0 SLC10A7-204ENST00000502607 1638 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
HMGB1P1B2RPK0 ZNF93-201ENST00000343769 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
HMGB1P1B2RPK0 ABCA13-204ENST00000435803 17184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
HMGB1P1B2RPK0 CRYBA1-201ENST00000225387 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
HMGB1P1B2RPK0 PSMA6-201ENST00000261479 1029 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
HMGB1P1B2RPK0 RPL7-201ENST00000352983 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
HMGB1P1B2RPK0 RNA5SP382-201ENST00000363355 112 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
HMGB1P1B2RPK0 S100A7-202ENST00000368723 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
HMGB1P1B2RPK0 RNU6-146P-201ENST00000384602 108 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
HMGB1P1B2RPK0 TRAV38-1-201ENST00000390464 353 ntAPPRIS P1 BASIC6.25□□□□□ -1.41
HMGB1P1B2RPK0 OR2H1-204ENST00000396792 1294 ntAPPRIS P1 BASIC6.25□□□□□ -1.41
HMGB1P1B2RPK0 ATP6V1E1-203ENST00000399798 994 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
HMGB1P1B2RPK0 RN7SKP281-201ENST00000410472 352 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
HMGB1P1B2RPK0 RN7SKP247-201ENST00000411094 308 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
HMGB1P1B2RPK0 AC023141.1-201ENST00000419418 379 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
HMGB1P1B2RPK0 HNRNPA1P57-201ENST00000431359 530 ntTSL 4 BASIC6.25□□□□□ -1.41
HMGB1P1B2RPK0 NIP7P1-201ENST00000433227 512 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
HMGB1P1B2RPK0 GNA14-AS1-201ENST00000439145 605 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
HMGB1P1B2RPK0 OSBPL10-AS1-205ENST00000444503 526 ntTSL 4 BASIC6.25□□□□□ -1.41
HMGB1P1B2RPK0 AL355390.2-201ENST00000446691 880 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
HMGB1P1B2RPK0 LINC01825-201ENST00000452381 850 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
HMGB1P1B2RPK0 NDUFB4P1-201ENST00000462398 381 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
HMGB1P1B2RPK0 RN7SL647P-201ENST00000485429 300 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
HMGB1P1B2RPK0 NPM1P28-201ENST00000492269 840 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
HMGB1P1B2RPK0 AC080013.1-206ENST00000496842 712 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
HMGB1P1B2RPK0 AC108157.1-201ENST00000510511 539 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
HMGB1P1B2RPK0 AC111000.6-201ENST00000514471 709 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
HMGB1P1B2RPK0 RNU6-941P-201ENST00000516346 108 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
HMGB1P1B2RPK0 IGKV2D-38-201ENST00000518423 240 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
HMGB1P1B2RPK0 AC018953.1-201ENST00000523265 730 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
HMGB1P1B2RPK0 CASP5-209ENST00000531367 879 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
HMGB1P1B2RPK0 AC022796.1-202ENST00000531882 477 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
HMGB1P1B2RPK0 APAF1-211ENST00000552268 1143 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
HMGB1P1B2RPK0 FRG2IP-201ENST00000563581 781 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
HMGB1P1B2RPK0 AC009962.1-201ENST00000567327 3813 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
HMGB1P1B2RPK0 AC090617.5-201ENST00000571815 528 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
HMGB1P1B2RPK0 CCL2-202ENST00000580907 736 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
HMGB1P1B2RPK0 AC110743.1-201ENST00000584870 478 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
HMGB1P1B2RPK0 AL050403.2-203ENST00000603180 558 ntTSL 4 BASIC6.25□□□□□ -1.41
HMGB1P1B2RPK0 SNORD96A-201ENST00000606577 79 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
HMGB1P1B2RPK0 LINC02098-201ENST00000608492 475 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
HMGB1P1B2RPK0 BMS1P14-201ENST00000615056 606 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
HMGB1P1B2RPK0 RN7SL820P-201ENST00000616437 299 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
HMGB1P1B2RPK0 AL513314.2-206ENST00000617276 434 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
HMGB1P1B2RPK0 AC017002.5-201ENST00000630717 871 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
HMGB1P1B2RPK0 MIR665-201ENST00000635949 72 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
HMGB1P1B2RPK0 OR10G8-202ENST00000641224 1033 ntAPPRIS P1 BASIC6.25□□□□□ -1.41
HMGB1P1B2RPK0 LINC01581-202ENST00000558874 3173 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
HMGB1P1B2RPK0 NLRC4-202ENST00000360906 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
HMGB1P1B2RPK0 AKAP7-201ENST00000263050 2238 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
HMGB1P1B2RPK0 CASC19-246ENST00000641625 1606 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
HMGB1P1B2RPK0 RBPJP6-201ENST00000411556 1431 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
HMGB1P1B2RPK0 PLCH1-AS1-201ENST00000475196 1308 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
HMGB1P1B2RPK0 C17orf105-201ENST00000449302 3753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
HMGB1P1B2RPK0 C5-201ENST00000223642 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
HMGB1P1B2RPK0 NAT1-203ENST00000517492 2280 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
HMGB1P1B2RPK0 RGPD1-206ENST00000641458 5271 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
HMGB1P1B2RPK0 MAPK10-297ENST00000641287 3725 ntAPPRIS P2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
HMGB1P1B2RPK0 AF121898.1-201ENST00000440763 1860 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
HMGB1P1B2RPK0 G3BP1-202ENST00000394123 10240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
HMGB1P1B2RPK0 ALB-202ENST00000401494 1659 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
HMGB1P1B2RPK0 MYBPC1-207ENST00000545503 3569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
HMGB1P1B2RPK0 BCORP1-202ENST00000441139 3461 ntTSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
HMGB1P1B2RPK0 SPINK7-201ENST00000274565 557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
HMGB1P1B2RPK0 OR4F16-201ENST00000332831 995 ntAPPRIS P1 BASIC6.24□□□□□ -1.41
HMGB1P1B2RPK0 C4orf47-201ENST00000378850 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
HMGB1P1B2RPK0 MRPS6P2-201ENST00000381143 370 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
HMGB1P1B2RPK0 RNU6-40P-201ENST00000384254 107 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
HMGB1P1B2RPK0 PCNAP3-201ENST00000397222 778 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
HMGB1P1B2RPK0 AL136116.2-201ENST00000404020 785 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
HMGB1P1B2RPK0 AC245096.1-201ENST00000413104 546 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
HMGB1P1B2RPK0 AF178030.1-201ENST00000415088 402 ntTSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
HMGB1P1B2RPK0 AC073115.2-201ENST00000416708 555 ntTSL 4 BASIC6.24□□□□□ -1.41
HMGB1P1B2RPK0 ACAP2-IT1-201ENST00000419899 690 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
HMGB1P1B2RPK0 AL451047.1-201ENST00000424451 814 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
HMGB1P1B2RPK0 LINC00266-1-202ENST00000425473 629 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
HMGB1P1B2RPK0 OR4F29-201ENST00000426406 995 ntAPPRIS P1 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108.3 ms