Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 701 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 AL445523.1-201ENST00000451184 1362 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
SH3BP1Q9Y3L3 SRSF3-202ENST00000373715 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
SH3BP1Q9Y3L3 CPNE4-214ENST00000617767 3556 ntTSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
SH3BP1Q9Y3L3 MYBPC1-223ENST00000553190 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
SH3BP1Q9Y3L3 TOPORSLP1-201ENST00000467693 2102 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
SH3BP1Q9Y3L3 MPHOSPH9-220ENST00000606320 6351 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
SH3BP1Q9Y3L3 SP110-204ENST00000392048 1937 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
SH3BP1Q9Y3L3 HSPA8P14-201ENST00000552265 1805 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
SH3BP1Q9Y3L3 ASNSP6-201ENST00000592770 1618 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
SH3BP1Q9Y3L3 NEK2P4-201ENST00000425793 1329 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
SH3BP1Q9Y3L3 AL512310.3-201ENST00000547023 1335 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
SH3BP1Q9Y3L3 HPS5-205ENST00000438420 4147 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
SH3BP1Q9Y3L3 FMO4-201ENST00000367749 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
SH3BP1Q9Y3L3 DCX-207ENST00000635795 9163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
SH3BP1Q9Y3L3 IL23R-201ENST00000347310 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
SH3BP1Q9Y3L3 LMO3-202ENST00000320122 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
SH3BP1Q9Y3L3 UNC79-203ENST00000553484 9100 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
SH3BP1Q9Y3L3 IL20-202ENST00000367098 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
SH3BP1Q9Y3L3 CSNK2A1-204ENST00000400227 1499 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
SH3BP1Q9Y3L3 OR1D2-201ENST00000331459 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.75□□□□□ -1.33
SH3BP1Q9Y3L3 CTNNAL1-203ENST00000374594 824 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
SH3BP1Q9Y3L3 ADPRM-201ENST00000379774 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
SH3BP1Q9Y3L3 LINC00396-201ENST00000411690 439 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
SH3BP1Q9Y3L3 LUZP4P1-201ENST00000415420 344 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
SH3BP1Q9Y3L3 LINC01762-201ENST00000423907 454 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
SH3BP1Q9Y3L3 RPL6-202ENST00000424576 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
SH3BP1Q9Y3L3 AC002069.1-201ENST00000429649 1159 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
SH3BP1Q9Y3L3 AL138899.2-201ENST00000439139 499 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
SH3BP1Q9Y3L3 AC017006.2-201ENST00000444077 464 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
SH3BP1Q9Y3L3 HRAT17-202ENST00000451962 687 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
SH3BP1Q9Y3L3 AL158069.1-201ENST00000454131 455 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
SH3BP1Q9Y3L3 CCNJP2-201ENST00000457810 1163 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
SH3BP1Q9Y3L3 RN7SL170P-201ENST00000487098 295 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
SH3BP1Q9Y3L3 GM2AP2-201ENST00000491764 562 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
SH3BP1Q9Y3L3 RN7SL362P-201ENST00000494228 267 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
SH3BP1Q9Y3L3 RNA5SP418-201ENST00000515951 117 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
SH3BP1Q9Y3L3 RNA5SP441-201ENST00000516809 88 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
SH3BP1Q9Y3L3 AC011853.1-201ENST00000518911 454 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
SH3BP1Q9Y3L3 INTS9-AS1-201ENST00000520055 548 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
SH3BP1Q9Y3L3 AC090103.1-201ENST00000520386 485 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
SH3BP1Q9Y3L3 AP000873.2-207ENST00000529607 452 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
SH3BP1Q9Y3L3 AC022509.1-202ENST00000537525 494 ntTSL 4 BASIC6.75□□□□□ -1.33
SH3BP1Q9Y3L3 AC007688.2-201ENST00000545158 369 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
SH3BP1Q9Y3L3 AL135838.1-201ENST00000556080 235 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
SH3BP1Q9Y3L3 AL132989.1-201ENST00000557322 576 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
SH3BP1Q9Y3L3 AL161757.4-202ENST00000557467 737 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
SH3BP1Q9Y3L3 AC013444.2-201ENST00000603317 787 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
SH3BP1Q9Y3L3 IGKV2OR2-1-201ENST00000605129 304 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
SH3BP1Q9Y3L3 AC025171.4-201ENST00000607250 1047 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
SH3BP1Q9Y3L3 MIR6721-201ENST00000617181 87 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
SH3BP1Q9Y3L3 OR1N1-202ENST00000619659 939 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
SH3BP1Q9Y3L3 AP000676.4-201ENST00000624659 623 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
SH3BP1Q9Y3L3 AC244205.1-201ENST00000624935 705 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
SH3BP1Q9Y3L3 AC111152.1-202ENST00000635848 339 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
SH3BP1Q9Y3L3 LINC02495-203ENST00000636704 242 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
SH3BP1Q9Y3L3 ATF7IP2-203ENST00000396559 3641 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
SH3BP1Q9Y3L3 HIPK1-204ENST00000369555 3966 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
SH3BP1Q9Y3L3 FLG-201ENST00000368799 12747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
SH3BP1Q9Y3L3 RFTN2-201ENST00000295049 5827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
SH3BP1Q9Y3L3 FBXL13-207ENST00000455112 2274 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
SH3BP1Q9Y3L3 PLS1-211ENST00000497002 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
SH3BP1Q9Y3L3 OR56A4-204ENST00000641835 3613 ntAPPRIS P1 BASIC6.75□□□□□ -1.33
SH3BP1Q9Y3L3 AC005480.1-202ENST00000555916 3548 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
SH3BP1Q9Y3L3 N4BP2L1-209ENST00000530622 1897 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
SH3BP1Q9Y3L3 EEF1A1P12-201ENST00000443590 1346 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
SH3BP1Q9Y3L3 SERPINI2-206ENST00000471111 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
SH3BP1Q9Y3L3 MTRNR2L8-201ENST00000536684 1303 ntAPPRIS P1 BASIC6.75□□□□□ -1.33
SH3BP1Q9Y3L3 AC124312.1-201ENST00000551312 1325 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
SH3BP1Q9Y3L3 DPYD-202ENST00000370192 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
SH3BP1Q9Y3L3 FASTKD2-203ENST00000403094 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
SH3BP1Q9Y3L3 RNF217-201ENST00000359704 1784 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
SH3BP1Q9Y3L3 AC093909.5-201ENST00000621839 1799 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
SH3BP1Q9Y3L3 MAK-204ENST00000536370 3767 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
SH3BP1Q9Y3L3 RBM41-201ENST00000372479 1662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
SH3BP1Q9Y3L3 TMEM200A-202ENST00000392429 5017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
SH3BP1Q9Y3L3 CASC19-228ENST00000641414 1684 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF711-202ENST00000360700 4844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
SH3BP1Q9Y3L3 RALYL-206ENST00000521376 1457 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
SH3BP1Q9Y3L3 RTN4-203ENST00000357376 4110 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
SH3BP1Q9Y3L3 PMS2-203ENST00000382321 1386 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
SH3BP1Q9Y3L3 OR56B1-201ENST00000317121 2075 ntAPPRIS P1 BASIC6.74□□□□□ -1.33
SH3BP1Q9Y3L3 FYB2-201ENST00000343433 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-670P-201ENST00000364312 104 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
SH3BP1Q9Y3L3 RN7SKP237-201ENST00000364663 301 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
SH3BP1Q9Y3L3 AC099566.1-204ENST00000413825 943 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
SH3BP1Q9Y3L3 AC074035.1-201ENST00000420725 1184 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
SH3BP1Q9Y3L3 AL121882.1-201ENST00000422893 417 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
SH3BP1Q9Y3L3 AC017019.1-201ENST00000426129 261 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
SH3BP1Q9Y3L3 AC091390.2-201ENST00000432573 374 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
SH3BP1Q9Y3L3 FAM53B-AS1-201ENST00000432699 558 ntTSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
SH3BP1Q9Y3L3 AC003989.1-201ENST00000434569 565 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
SH3BP1Q9Y3L3 SMIM30-204ENST00000441359 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
SH3BP1Q9Y3L3 AC007179.2-204ENST00000444001 765 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
SH3BP1Q9Y3L3 AC025947.1-201ENST00000447943 299 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
SH3BP1Q9Y3L3 MORF4L1P4-201ENST00000450245 976 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
SH3BP1Q9Y3L3 SATB1-AS1-204ENST00000453361 726 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
SH3BP1Q9Y3L3 LINC01072-201ENST00000455848 431 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
SH3BP1Q9Y3L3 AC022415.1-202ENST00000486612 523 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
SH3BP1Q9Y3L3 WDR78-207ENST00000488333 613 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
SH3BP1Q9Y3L3 AC021006.1-201ENST00000489849 553 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.7 ms