Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPL8

TIMMDC1, Complex I assembly factor TIMMDC1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 285 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMMDC1Q9NPL8 AC011468.3-201ENST00000597886 332 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
TIMMDC1Q9NPL8 AC013553.2-201ENST00000604244 589 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
TIMMDC1Q9NPL8 AC104117.5-201ENST00000606195 547 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
TIMMDC1Q9NPL8 CSNK1A1-210ENST00000606719 835 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
TIMMDC1Q9NPL8 AL359535.1-201ENST00000612100 1087 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
TIMMDC1Q9NPL8 BRCC3-209ENST00000620502 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
TIMMDC1Q9NPL8 AL359880.1-201ENST00000621879 266 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
TIMMDC1Q9NPL8 AC005609.2-201ENST00000623320 592 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
TIMMDC1Q9NPL8 MIR3120-201ENST00000636555 81 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
TIMMDC1Q9NPL8 GCSAML-211ENST00000623578 3959 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC7.49□□□□□ -1.21
TIMMDC1Q9NPL8 XRCC6P2-201ENST00000457831 1822 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
TIMMDC1Q9NPL8 AL591543.1-202ENST00000642095 4149 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
TIMMDC1Q9NPL8 CXADR-205ENST00000400169 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
TIMMDC1Q9NPL8 ENTPD5-207ENST00000557325 3096 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
TIMMDC1Q9NPL8 NCKAP5-203ENST00000405974 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
TIMMDC1Q9NPL8 KIAA0753-207ENST00000572370 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
TIMMDC1Q9NPL8 AMPD3-204ENST00000444303 3994 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
TIMMDC1Q9NPL8 CNKSR3-205ENST00000607772 21063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
TIMMDC1Q9NPL8 KLHL2-204ENST00000506761 2169 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
TIMMDC1Q9NPL8 GPR63-201ENST00000229955 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
TIMMDC1Q9NPL8 ODF2-209ENST00000434106 3890 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
TIMMDC1Q9NPL8 LRP2BP-202ENST00000505916 2302 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
TIMMDC1Q9NPL8 AC139491.2-201ENST00000515403 3632 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
TIMMDC1Q9NPL8 SLC4A4-203ENST00000351898 3771 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
TIMMDC1Q9NPL8 ZNFX1-202ENST00000371752 7212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
TIMMDC1Q9NPL8 SAMD3-204ENST00000439090 2093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
TIMMDC1Q9NPL8 ZKSCAN8-202ENST00000457389 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
TIMMDC1Q9NPL8 TMEM132B-206ENST00000613307 9659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
TIMMDC1Q9NPL8 AC005614.1-201ENST00000598952 3653 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
TIMMDC1Q9NPL8 MAP4K4-221ENST00000634702 3800 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
TIMMDC1Q9NPL8 RUNX1T1-205ENST00000436581 7454 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF682-209ENST00000597972 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
TIMMDC1Q9NPL8 DDX47-201ENST00000352940 1698 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
TIMMDC1Q9NPL8 KIF18A-201ENST00000263181 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
TIMMDC1Q9NPL8 NFAT5-201ENST00000349945 13362 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
TIMMDC1Q9NPL8 CYP19A1-216ENST00000559878 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
TIMMDC1Q9NPL8 LINC00662-203ENST00000586954 2254 ntTSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
TIMMDC1Q9NPL8 FCGR3B-208ENST00000613418 2251 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
TIMMDC1Q9NPL8 AC090673.1-202ENST00000356215 4617 ntTSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
TIMMDC1Q9NPL8 AC022819.1-201ENST00000563495 3910 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
TIMMDC1Q9NPL8 NNT-201ENST00000264663 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
TIMMDC1Q9NPL8 IFNK-201ENST00000276943 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
TIMMDC1Q9NPL8 TMBIM4-201ENST00000286424 989 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
TIMMDC1Q9NPL8 OR4K15-201ENST00000305051 1216 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
TIMMDC1Q9NPL8 CRYGS-201ENST00000307944 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
TIMMDC1Q9NPL8 IMPA1-202ENST00000311489 1106 ntTSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
TIMMDC1Q9NPL8 NT5C2-203ENST00000404739 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
TIMMDC1Q9NPL8 PLGLB1-202ENST00000409310 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
TIMMDC1Q9NPL8 AC068533.2-201ENST00000411872 306 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
TIMMDC1Q9NPL8 ROR1-AS1-201ENST00000412349 1574 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
TIMMDC1Q9NPL8 AC007091.1-201ENST00000412563 566 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
TIMMDC1Q9NPL8 CTSLP8-201ENST00000413075 967 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
TIMMDC1Q9NPL8 RPL17P12-201ENST00000413391 526 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
TIMMDC1Q9NPL8 AC079760.2-203ENST00000418395 489 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
TIMMDC1Q9NPL8 RBMY2FP-202ENST00000420346 1263 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
TIMMDC1Q9NPL8 KCNMB2-202ENST00000420517 1563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
TIMMDC1Q9NPL8 AL158166.2-201ENST00000420845 748 ntTSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
TIMMDC1Q9NPL8 AC016710.1-201ENST00000421326 466 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
TIMMDC1Q9NPL8 YBX1P8-201ENST00000421881 943 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
TIMMDC1Q9NPL8 GAPDHP55-201ENST00000423136 803 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
TIMMDC1Q9NPL8 LINC00665-202ENST00000427868 690 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
TIMMDC1Q9NPL8 MIR181A2HG-201ENST00000429139 662 ntTSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
TIMMDC1Q9NPL8 AL022163.1-201ENST00000430261 1569 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
TIMMDC1Q9NPL8 AC069154.1-201ENST00000432914 542 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
TIMMDC1Q9NPL8 AL359636.1-201ENST00000433572 522 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
TIMMDC1Q9NPL8 LINC00460-201ENST00000435024 631 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
TIMMDC1Q9NPL8 AC234064.1-201ENST00000436312 247 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
TIMMDC1Q9NPL8 AC016734.1-201ENST00000436998 654 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
TIMMDC1Q9NPL8 AC007790.1-201ENST00000439081 782 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
TIMMDC1Q9NPL8 RPL29P7-201ENST00000440227 457 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
TIMMDC1Q9NPL8 HMGB1P16-201ENST00000447155 540 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
TIMMDC1Q9NPL8 AC098828.2-201ENST00000452342 573 ntTSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
TIMMDC1Q9NPL8 AP003774.3-201ENST00000457725 985 ntTSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
TIMMDC1Q9NPL8 NUTF2P4-201ENST00000458353 381 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
TIMMDC1Q9NPL8 RPL23AP37-201ENST00000479658 549 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
TIMMDC1Q9NPL8 AC092979.1-201ENST00000488190 1414 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
TIMMDC1Q9NPL8 RPSAP52-201ENST00000489520 1144 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
TIMMDC1Q9NPL8 ATP6V1G3-204ENST00000489986 449 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
TIMMDC1Q9NPL8 AC116345.3-201ENST00000508255 449 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
TIMMDC1Q9NPL8 ATG10-208ENST00000513634 618 ntTSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
TIMMDC1Q9NPL8 PANCR-202ENST00000513690 448 ntTSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
TIMMDC1Q9NPL8 CHCHD7-215ENST00000523061 557 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
TIMMDC1Q9NPL8 AC022639.1-201ENST00000523191 573 ntTSL 4 BASIC7.48□□□□□ -1.21
TIMMDC1Q9NPL8 AP000435.1-201ENST00000528539 496 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
TIMMDC1Q9NPL8 AP003721.2-201ENST00000536495 452 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
TIMMDC1Q9NPL8 AC130462.1-201ENST00000548144 549 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
TIMMDC1Q9NPL8 AC008127.2-201ENST00000549925 1075 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
TIMMDC1Q9NPL8 UQCRC2-202ENST00000561553 1415 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
TIMMDC1Q9NPL8 AC090699.1-201ENST00000586264 321 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
TIMMDC1Q9NPL8 AC003991.1-201ENST00000594469 484 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
TIMMDC1Q9NPL8 OR7A8P-201ENST00000595427 913 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
TIMMDC1Q9NPL8 SETSIP-202ENST00000596516 909 ntAPPRIS P2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
TIMMDC1Q9NPL8 AP001429.1-201ENST00000602568 530 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
TIMMDC1Q9NPL8 VDAC1P5-201ENST00000603132 844 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
TIMMDC1Q9NPL8 AC019080.4-201ENST00000606200 564 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
TIMMDC1Q9NPL8 AL360267.1-201ENST00000607309 666 ntTSL 4 BASIC7.48□□□□□ -1.21
TIMMDC1Q9NPL8 AC024560.3-201ENST00000608482 349 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
TIMMDC1Q9NPL8 NPPA-AS1_1.1-201ENST00000622391 173 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
TIMMDC1Q9NPL8 AC108724.2-201ENST00000634593 290 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
TIMMDC1Q9NPL8 AL359834.1-201ENST00000635660 638 ntTSL 4 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.8 ms