Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0D0

PHACTR1, Phosphatase and actin regulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHACTR1Q9C0D0 AC234064.1-201ENST00000436312 247 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 AC010105.1-201ENST00000437290 385 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 AC005040.1-201ENST00000437783 482 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 AC064871.1-201ENST00000444562 427 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 AC114488.2-222ENST00000445166 362 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 AC244021.2-201ENST00000445260 529 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 LIN28AP2-201ENST00000445283 458 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 COX6CP12-201ENST00000446748 202 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 RPL4P2-201ENST00000447259 1282 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 AL118496.2-201ENST00000448300 230 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 TDRG1-202ENST00000448433 1015 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 AL353615.1-201ENST00000450850 390 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 AL390728.3-201ENST00000452704 270 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 LINC00393-202ENST00000452852 485 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 MTCO3P11-201ENST00000455103 774 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 AL354872.1-201ENST00000456361 967 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 AC115223.1-201ENST00000466377 870 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 RN7SL12P-201ENST00000473849 290 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 MSMO1-203ENST00000504317 1026 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 AC113404.3-201ENST00000506621 555 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 SMIM20-202ENST00000514384 774 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 AC104211.2-201ENST00000521317 436 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 OR5AK3P-201ENST00000527486 1297 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 AC009869.1-201ENST00000530418 528 ntTSL 4 BASIC7.58□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 LRTOMT-212ENST00000536917 579 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 PRPSAP2-217ENST00000542013 1047 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 AC243972.1-201ENST00000542992 570 ntTSL 4 BASIC7.58□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 GNPTAB-203ENST00000549165 373 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 LINC02303-202ENST00000554711 531 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 AL121820.1-201ENST00000556919 461 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 BLOC1S6-206ENST00000564765 706 ntTSL 4 BASIC7.58□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 AC007496.1-201ENST00000565641 739 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 RBM22P12-201ENST00000567098 1255 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 AC096708.2-201ENST00000577676 512 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 OR4K7P-201ENST00000580232 945 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 LINC00663-205ENST00000589508 432 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 ANKRD20A19P-203ENST00000602724 295 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 AC073389.2-201ENST00000606726 571 ntTSL 4 BASIC7.58□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 AC083798.2-201ENST00000608756 1152 ntTSL 4 BASIC7.58□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 AP005329.3-201ENST00000609924 686 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 AL451054.3-201ENST00000611115 776 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 AC123788.2-201ENST00000612290 283 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 ELMO2P1-202ENST00000614283 794 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 AC023158.2-201ENST00000614876 543 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 Y_RNA.804-201ENST00000615262 101 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 AC093495.1-212ENST00000630173 1162 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 AL353572.3-201ENST00000636536 670 ntAPPRIS P1 BASIC7.58□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 AC104461.1-201ENST00000637430 817 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 LINC01739-205ENST00000641890 573 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 ADAL-202ENST00000422466 3767 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 ZNF333-203ENST00000540689 3595 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 AL354685.2-201ENST00000448218 1447 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 WNK1-220ENST00000574564 1401 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 AC124017.1-201ENST00000508112 1594 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 ZNF215-205ENST00000529903 1396 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 AC010132.4-201ENST00000569883 1368 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 ABCB5-205ENST00000443026 2247 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 AC015849.5-201ENST00000604907 5473 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 RAD54B-202ENST00000336148 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 APOOL-203ENST00000622540 6466 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 CASC19-243ENST00000641588 1546 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 FTO-206ENST00000471389 11766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 GPATCH2-202ENST00000366935 5851 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 AC022075.1-201ENST00000500682 2830 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 EPG5-201ENST00000282041 12633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 AL671511.1-201ENST00000425033 3458 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 AL161891.1-201ENST00000621575 4636 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 AP003471.1-202ENST00000319051 1988 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 CNOT1-216ENST00000569240 7660 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
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PHACTR1Q9C0D0 CDY7P-201ENST00000429883 1604 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 CHST12-201ENST00000258711 15979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 MTND5P26-201ENST00000426018 1752 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 ATXN2-214ENST00000535949 3205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 ANO4-201ENST00000392977 3509 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 SRFBP1-201ENST00000339397 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 TMPRSS11F-201ENST00000356291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 BDH2-201ENST00000296424 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 RNA5SP218-201ENST00000363188 109 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 BEND6-201ENST00000370745 579 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 AL139327.1-201ENST00000382988 348 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 SNORD115-47-201ENST00000391226 86 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 REG3G-203ENST00000409471 575 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 MIR4435-2HG-203ENST00000409569 514 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 RPS21P8-201ENST00000413365 247 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 C14orf2-202ENST00000414262 842 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 AC019050.1-201ENST00000418508 492 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 EEF1A1P34-201ENST00000419888 1267 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 AL390840.1-201ENST00000420303 988 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 RPS7P12-201ENST00000422385 582 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 SLC44A3-AS1-205ENST00000424505 612 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 TRIM60P10Y-201ENST00000425589 751 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 LINC00665-202ENST00000427868 690 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 AL162408.1-201ENST00000428853 433 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 TRIM60P8Y-201ENST00000436338 762 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 AC231532.1-201ENST00000438584 312 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 AC005487.1-201ENST00000440208 665 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 YWHAZP2-201ENST00000440317 728 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 AL662791.1-201ENST00000441992 928 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 AC016908.1-201ENST00000442571 1219 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
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