Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C6

CIPC, CLOCK-interacting pacemaker, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIPCQ9C0C6 AL022237.1-201ENST00000446663 358 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
CIPCQ9C0C6 THAP12P8-201ENST00000447914 2115 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
CIPCQ9C0C6 AC016027.4-201ENST00000450866 277 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
CIPCQ9C0C6 Z99916.1-201ENST00000454253 482 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
CIPCQ9C0C6 AL136982.3-201ENST00000454709 688 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
CIPCQ9C0C6 AC103563.5-201ENST00000455643 364 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
CIPCQ9C0C6 OR2A1-AS1-202ENST00000467944 422 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
CIPCQ9C0C6 AC109361.2-202ENST00000512514 483 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
CIPCQ9C0C6 SETP21-201ENST00000514799 892 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
CIPCQ9C0C6 AC062004.1-202ENST00000524014 246 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
CIPCQ9C0C6 AP003501.1-201ENST00000524453 744 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
CIPCQ9C0C6 AC026894.1-201ENST00000532930 850 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
CIPCQ9C0C6 AC009803.1-202ENST00000551940 544 ntTSL 4 BASIC6.21□□□□□ -1.42
CIPCQ9C0C6 AL132800.1-201ENST00000555109 698 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
CIPCQ9C0C6 INO80-AS1-201ENST00000558967 312 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
CIPCQ9C0C6 AP000842.3-201ENST00000564354 808 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
CIPCQ9C0C6 THCAT158-201ENST00000575039 535 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
CIPCQ9C0C6 MIR3189-201ENST00000578735 73 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
CIPCQ9C0C6 AC005288.1-201ENST00000582842 860 ntTSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
CIPCQ9C0C6 AC096947.1-201ENST00000603233 470 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
CIPCQ9C0C6 AC068313.1-201ENST00000604028 1008 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
CIPCQ9C0C6 AC063944.3-201ENST00000609969 533 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
CIPCQ9C0C6 MIR6793-201ENST00000612376 63 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
CIPCQ9C0C6 OR8S1-202ENST00000641651 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.21□□□□□ -1.42
CIPCQ9C0C6 CASC8-203ENST00000502082 1420 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
CIPCQ9C0C6 KANTR-203ENST00000604062 4251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
CIPCQ9C0C6 FAM13C-219ENST00000621119 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
CIPCQ9C0C6 AF287957.1-201ENST00000607368 1595 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
CIPCQ9C0C6 DAB2-209ENST00000509337 2740 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
CIPCQ9C0C6 GTF3C3-202ENST00000409364 1736 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
CIPCQ9C0C6 GRAMD1C-208ENST00000472026 1876 ntTSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
CIPCQ9C0C6 PSD3-202ENST00000327040 11689 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
CIPCQ9C0C6 CDC42BPA-201ENST00000334218 10134 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
CIPCQ9C0C6 OR2M3-202ENST00000641626 9913 ntAPPRIS P1 BASIC6.21□□□□□ -1.42
CIPCQ9C0C6 MOB1B-201ENST00000309395 6963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
CIPCQ9C0C6 PTPRR-204ENST00000440835 2818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
CIPCQ9C0C6 CNOT4-205ENST00000423368 3297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
CIPCQ9C0C6 ADAM5-208ENST00000505455 1998 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
CIPCQ9C0C6 SERPINB11-205ENST00000544088 1846 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
CIPCQ9C0C6 GABRA3-204ENST00000535043 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
CIPCQ9C0C6 ODF2-205ENST00000393527 3653 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
CIPCQ9C0C6 NLRP13-202ENST00000588751 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
CIPCQ9C0C6 FMN1-212ENST00000616417 13529 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
CIPCQ9C0C6 SLC16A4-201ENST00000369779 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
CIPCQ9C0C6 CERS3-203ENST00000538112 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
CIPCQ9C0C6 AL359091.1-201ENST00000449048 1734 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
CIPCQ9C0C6 OSBPL9-206ENST00000453295 2842 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
CIPCQ9C0C6 OR2AT4-202ENST00000641504 8661 ntAPPRIS P1 BASIC6.2□□□□□ -1.42
CIPCQ9C0C6 ZSCAN26-201ENST00000316606 2362 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
CIPCQ9C0C6 RPL6-201ENST00000202773 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
CIPCQ9C0C6 PAGE2-202ENST00000374968 551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
CIPCQ9C0C6 UQCRFS1P3-201ENST00000407697 385 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
CIPCQ9C0C6 PTGES3P2-201ENST00000407942 482 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
CIPCQ9C0C6 AC116036.1-201ENST00000412199 367 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
CIPCQ9C0C6 AL355300.1-201ENST00000412439 187 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
CIPCQ9C0C6 AC068286.1-201ENST00000416173 467 ntTSL 4 BASIC6.2□□□□□ -1.42
CIPCQ9C0C6 AC017019.1-201ENST00000426129 261 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
CIPCQ9C0C6 CCNB1IP1P1-201ENST00000428976 839 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
CIPCQ9C0C6 AC060234.3-201ENST00000430438 559 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
CIPCQ9C0C6 AC023481.1-201ENST00000435368 938 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
CIPCQ9C0C6 AC108488.1-202ENST00000439547 482 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
CIPCQ9C0C6 C1DP3-201ENST00000455013 423 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
CIPCQ9C0C6 AC018638.3-201ENST00000461273 132 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
CIPCQ9C0C6 DEFB109A-201ENST00000482450 265 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
CIPCQ9C0C6 RPL7P51-201ENST00000490532 749 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
CIPCQ9C0C6 RN7SL193P-201ENST00000491708 276 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
CIPCQ9C0C6 LINC00483-204ENST00000502517 940 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
CIPCQ9C0C6 AC093801.2-201ENST00000503966 1050 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
CIPCQ9C0C6 AC093763.2-201ENST00000505334 1223 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
CIPCQ9C0C6 AC093730.1-201ENST00000508825 448 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
CIPCQ9C0C6 MOCS2-205ENST00000508922 1210 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
CIPCQ9C0C6 LINC00967-201ENST00000517689 792 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
CIPCQ9C0C6 OR56A7P-201ENST00000524865 941 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
CIPCQ9C0C6 C11orf65-206ENST00000529391 973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
CIPCQ9C0C6 OTX2-203ENST00000554559 715 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
CIPCQ9C0C6 RPL26-204ENST00000578812 1002 ntTSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
CIPCQ9C0C6 AC005244.1-201ENST00000582566 339 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
CIPCQ9C0C6 AC011476.3-202ENST00000586845 553 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
CIPCQ9C0C6 OR7A8P-201ENST00000595427 913 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
CIPCQ9C0C6 AL137246.2-201ENST00000613439 662 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
CIPCQ9C0C6 UOX-205ENST00000640983 544 ntTSL 4 BASIC6.2□□□□□ -1.42
CIPCQ9C0C6 AC087269.2-201ENST00000641764 975 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
CIPCQ9C0C6 AC241584.2-201ENST00000637142 2090 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
CIPCQ9C0C6 TRMT13-202ENST00000370141 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
CIPCQ9C0C6 AJ009632.2-208ENST00000635525 4123 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
CIPCQ9C0C6 SNW1-204ENST00000554775 1687 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
CIPCQ9C0C6 OR2T5-201ENST00000641363 2525 ntAPPRIS P1 BASIC6.2□□□□□ -1.42
CIPCQ9C0C6 RIPK1-202ENST00000380409 3864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
CIPCQ9C0C6 CTNNA2-202ENST00000361291 3071 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
CIPCQ9C0C6 HDAC1P2-201ENST00000453661 1398 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
CIPCQ9C0C6 ICE2-201ENST00000261520 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
CIPCQ9C0C6 ERI2-206ENST00000563117 2903 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
CIPCQ9C0C6 CNTN1-204ENST00000547849 3125 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
CIPCQ9C0C6 AL731532.1-201ENST00000623972 4236 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
CIPCQ9C0C6 ASTN2-AS1-201ENST00000418250 1756 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
CIPCQ9C0C6 ING3-204ENST00000431467 1447 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
CIPCQ9C0C6 ZC3H14-201ENST00000251038 18281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
CIPCQ9C0C6 DCX-211ENST00000637570 6162 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
CIPCQ9C0C6 CLEC4A-203ENST00000352620 615 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
CIPCQ9C0C6 CLEC4A-204ENST00000360500 597 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
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