Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q05

TRAPPC9, Trafficking protein particle complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC9Q96Q05 AL121977.1-201ENST00000401636 979 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 RNA5SP198-201ENST00000410376 127 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 C9orf147-201ENST00000412934 584 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 LINC01393-201ENST00000419905 746 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 AC073508.1-201ENST00000428866 656 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 FTO-202ENST00000431610 707 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 GYPE-202ENST00000437468 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 AL353768.1-201ENST00000439872 487 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 GTF2IP14-201ENST00000441415 586 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 AL136982.3-201ENST00000454709 688 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 AC096639.1-201ENST00000456240 347 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 AC073288.1-201ENST00000466291 469 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 AC245041.2-201ENST00000479781 376 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 AC093719.1-201ENST00000480427 441 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 AC069439.2-201ENST00000496403 789 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 LINC01596-201ENST00000503609 592 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 MTND3P3-201ENST00000505004 126 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 AC116345.3-201ENST00000508255 449 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 LINC01598-206ENST00000513381 499 ntTSL 4 BASIC6.19□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 OR4A46P-201ENST00000527255 933 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 C11orf65-206ENST00000529391 973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 LINC02406-201ENST00000553029 546 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 AL132989.1-201ENST00000557322 576 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 TPRX1P1-201ENST00000557620 319 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 ZNF675-208ENST00000601010 669 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-84P-201ENST00000607737 102 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 AC084824.5-201ENST00000612009 413 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 OSTC-205ENST00000613215 876 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 MIR6861-201ENST00000618657 64 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 ZNHIT3-208ENST00000619730 926 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 AL139220.2-221ENST00000628123 395 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 DRG1-207ENST00000629688 309 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 ZSCAN26-201ENST00000316606 2362 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 PPIAL4G-201ENST00000419275 3856 ntAPPRIS P1 BASIC6.19□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 THAP6-201ENST00000311638 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 NEGR1-202ENST00000357731 12811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 DMD-228ENST00000541735 7080 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 ZNF566-202ENST00000424129 2644 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 NEK2P2-201ENST00000438441 1338 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 PLCH1-AS1-201ENST00000475196 1308 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 DAOA-AS1-201ENST00000448407 2482 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 ARCN1-202ENST00000359415 4038 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 RAD17-220ENST00000616683 3057 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 NOS1-201ENST00000317775 12158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 ATXN7-208ENST00000484332 2741 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 ACPP-202ENST00000351273 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 LRRC7-202ENST00000310961 6507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 OR2AT4-204ENST00000641593 8733 ntAPPRIS P1 BASIC6.18□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 RNASEL-202ENST00000539397 4046 ntTSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 AC007744.1-201ENST00000607540 2289 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 AC003985.2-201ENST00000562268 1669 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 DGKB-203ENST00000403951 6917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 GYPA-212ENST00000616983 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 SPATA31D5P-202ENST00000527857 4863 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 ZEB2-244ENST00000638007 9140 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 AL050335.1-201ENST00000396909 869 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 CAPSL-201ENST00000397366 969 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.18□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 ADAM24P-201ENST00000398655 2101 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 AL023284.3-201ENST00000407767 334 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 LINC00701-201ENST00000418295 742 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 LINC00308-201ENST00000419431 727 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 AL157834.1-201ENST00000422744 420 ntTSL 3 BASIC6.18□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 AL034379.1-201ENST00000423216 253 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 MTND4P24-201ENST00000424002 397 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 AC092162.2-201ENST00000438143 532 ntTSL 4 BASIC6.18□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 AC003991.1-202ENST00000447058 777 ntTSL 3 BASIC6.18□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 ZNF736P6Y-201ENST00000447526 1213 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 AL445687.2-201ENST00000458156 728 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 AC096746.1-201ENST00000501965 1042 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 AC113367.2-201ENST00000505749 160 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 AC105389.1-201ENST00000510602 561 ntTSL 4 BASIC6.18□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 AC025524.2-206ENST00000517953 439 ntTSL 3 BASIC6.18□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 AC027117.1-201ENST00000520646 667 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 OR4A40P-201ENST00000533878 948 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 AC073916.1-201ENST00000545095 130 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 CTNNA3-205ENST00000545309 555 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 LINC02451-202ENST00000548764 579 ntTSL 4 BASIC6.18□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 RNASE9-204ENST00000553541 1136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 AC005774.1-201ENST00000565247 567 ntTSL 4 BASIC6.18□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 OR1E3-201ENST00000575608 948 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 AC011824.3-201ENST00000585093 563 ntTSL 4 BASIC6.18□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 LINC00663-202ENST00000586816 306 ntTSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 AP2S1-210ENST00000601649 315 ntTSL 3 BASIC6.18□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 AC112491.1-201ENST00000602890 248 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 AP001172.1-201ENST00000602921 581 ntTSL 3 BASIC6.18□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 LINC00635-219ENST00000608506 482 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 AL133370.2-201ENST00000619934 439 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 LINC01002-237ENST00000634025 555 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 AC111152.1-202ENST00000635848 339 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 PEX5L-202ENST00000392649 8540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 LINC01422-201ENST00000434868 6043 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 ZNF33B-208ENST00000613419 5843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 SV2B-201ENST00000330276 11202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 TCF4-284ENST00000637169 7553 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 MUC12-206ENST00000536621 16321 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 RACGAP1-203ENST00000454520 3080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 AQP4-201ENST00000383168 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 MLH1-206ENST00000435176 2428 ntTSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 ZNF208-201ENST00000397126 3992 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.18□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 TLR6-201ENST00000381950 2938 ntAPPRIS P1 BASIC6.18□□□□□ -1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.9 ms