Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 AL355870.1-201ENST00000448272 454 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
LAMA3Q16787 AC008517.1-201ENST00000502383 585 ntTSL 4 BASIC5.84□□□□□ -1.47
LAMA3Q16787 AC092436.4-201ENST00000510905 483 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
LAMA3Q16787 AP002336.3-201ENST00000526017 367 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
LAMA3Q16787 AC005000.1-201ENST00000536192 288 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
LAMA3Q16787 CPSF7-220ENST00000541963 549 ntTSL 4 BASIC5.84□□□□□ -1.47
LAMA3Q16787 AC011487.3-201ENST00000593607 453 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
LAMA3Q16787 AP4S1-212ENST00000622409 4113 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
LAMA3Q16787 BCORL1-201ENST00000218147 6860 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
LAMA3Q16787 MAMDC2-AS1-201ENST00000377178 1504 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
LAMA3Q16787 EXD1-202ENST00000458580 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
LAMA3Q16787 UPRT-207ENST00000530743 1636 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.48
LAMA3Q16787 MYO5A-205ENST00000399231 12225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
LAMA3Q16787 ALKBH3-AS1-201ENST00000499194 1906 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.48
LAMA3Q16787 RNA5SP332-201ENST00000391063 115 ntBASIC5.84□□□□□ -1.48
LAMA3Q16787 ARL4A-205ENST00000404894 840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.48
LAMA3Q16787 CASP12-204ENST00000433738 709 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
LAMA3Q16787 LINC02485-202ENST00000511899 770 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.48
LAMA3Q16787 IGKV1-32-201ENST00000519290 311 ntBASIC5.84□□□□□ -1.48
LAMA3Q16787 HMGB1P40-201ENST00000525121 540 ntBASIC5.84□□□□□ -1.48
LAMA3Q16787 AC084824.1-201ENST00000550917 1005 ntBASIC5.84□□□□□ -1.48
LAMA3Q16787 AC024941.1-201ENST00000612250 334 ntBASIC5.84□□□□□ -1.48
LAMA3Q16787 FAM170B-AS1-203ENST00000442525 2000 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.48
LAMA3Q16787 FAM19A2-215ENST00000551619 2718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
LAMA3Q16787 DOCK1-206ENST00000623213 5761 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
LAMA3Q16787 ZNHIT6-202ENST00000431532 6080 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
LAMA3Q16787 LRRC2-202ENST00000395905 5100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
LAMA3Q16787 MIR208A-201ENST00000362287 71 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
LAMA3Q16787 ITCH-IT1-201ENST00000418598 208 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
LAMA3Q16787 EEF1A1P1-201ENST00000447052 739 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
LAMA3Q16787 AC004052.1-201ENST00000514327 567 ntTSL 4 BASIC5.83□□□□□ -1.48
LAMA3Q16787 LINC01895-201ENST00000558690 404 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
LAMA3Q16787 AC015660.5-201ENST00000623238 564 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
LAMA3Q16787 AC012254.5-201ENST00000623573 478 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
LAMA3Q16787 NUP214-201ENST00000359428 7600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
LAMA3Q16787 DSG3-201ENST00000257189 5525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
LAMA3Q16787 RAPGEF4-203ENST00000397087 4120 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
LAMA3Q16787 TTC39C-201ENST00000304621 2304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
LAMA3Q16787 FAM72A-201ENST00000341209 1774 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
LAMA3Q16787 POGK-201ENST00000367875 6254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
LAMA3Q16787 AC012313.8-201ENST00000595059 5402 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
LAMA3Q16787 AC092807.3-203ENST00000467530 2745 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
LAMA3Q16787 RNF146-215ENST00000616343 2077 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
LAMA3Q16787 HHLA2-210ENST00000491820 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
LAMA3Q16787 RNU2-50P-201ENST00000410494 143 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
LAMA3Q16787 BBIP1-203ENST00000423273 492 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
LAMA3Q16787 AC008073.2-201ENST00000428344 792 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
LAMA3Q16787 ATP6V0E1P2-201ENST00000441771 245 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
LAMA3Q16787 DUTP1-201ENST00000493631 470 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
LAMA3Q16787 LINC02271-202ENST00000506379 596 ntTSL 4 BASIC5.83□□□□□ -1.48
LAMA3Q16787 IGKV3OR22-2-201ENST00000517943 313 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
LAMA3Q16787 AC009643.1-201ENST00000532030 391 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
LAMA3Q16787 AC002563.1-201ENST00000535109 451 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
LAMA3Q16787 AC090109.1-201ENST00000548885 819 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
LAMA3Q16787 AC245389.1-201ENST00000605141 529 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
LAMA3Q16787 PDCD6IPP1-202ENST00000622242 1064 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
LAMA3Q16787 AGAP1-207ENST00000428334 10090 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
LAMA3Q16787 POLH-201ENST00000372226 3322 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
LAMA3Q16787 LINC02352-202ENST00000559292 1450 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
LAMA3Q16787 AFTPH-204ENST00000409933 2811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
LAMA3Q16787 NCOR1-204ENST00000395851 7950 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
LAMA3Q16787 TMEM178B-202ENST00000565468 10558 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
LAMA3Q16787 TMEM178B-203ENST00000610315 10552 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
LAMA3Q16787 IFNG-AS1-202ENST00000538665 1791 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
LAMA3Q16787 RNA5SP387-201ENST00000364226 106 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
LAMA3Q16787 AP000770.1-201ENST00000444123 583 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
LAMA3Q16787 AC087500.2-201ENST00000575056 498 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
LAMA3Q16787 OR52N1-202ENST00000641645 2545 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
LAMA3Q16787 ZC3H6-201ENST00000343936 11539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
LAMA3Q16787 AP002004.1-201ENST00000532510 3530 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
LAMA3Q16787 RASSF2-202ENST00000379400 5427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
LAMA3Q16787 AC003973.3-201ENST00000624863 2822 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
LAMA3Q16787 AL078621.3-201ENST00000623707 2042 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
LAMA3Q16787 ATF7IP2-203ENST00000396559 3641 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
LAMA3Q16787 MXRA5-201ENST00000217939 9793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
LAMA3Q16787 CEP120-203ENST00000328236 4710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
LAMA3Q16787 AC092821.3-202ENST00000641304 2767 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
LAMA3Q16787 AC007161.1-204ENST00000423039 460 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
LAMA3Q16787 TRIM60P9Y-201ENST00000438459 816 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
LAMA3Q16787 RPL34P20-201ENST00000442771 351 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
LAMA3Q16787 TRIM60P11Y-201ENST00000445313 801 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
LAMA3Q16787 AL359073.1-201ENST00000448036 403 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
LAMA3Q16787 AC112187.1-201ENST00000455837 479 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
LAMA3Q16787 RPL23AP40-201ENST00000487630 390 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
LAMA3Q16787 AC119150.1-201ENST00000507143 563 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
LAMA3Q16787 DPPA3P2-202ENST00000557188 1219 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
LAMA3Q16787 MIR4298-201ENST00000584380 73 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
LAMA3Q16787 SSX9-202ENST00000608568 580 ntTSL 4 BASIC5.82□□□□□ -1.48
LAMA3Q16787 AC006338.2-201ENST00000616864 791 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
LAMA3Q16787 RSL1D1-204ENST00000571133 5483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
LAMA3Q16787 AL122126.1-201ENST00000546905 1318 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
LAMA3Q16787 AC013268.3-201ENST00000262716 2324 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
LAMA3Q16787 PDE4DIP-219ENST00000524974 8305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
LAMA3Q16787 AC009948.3-201ENST00000603415 1798 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
LAMA3Q16787 TEX26-201ENST00000380473 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
LAMA3Q16787 RNASE9-201ENST00000338904 1049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
LAMA3Q16787 CFAP126-201ENST00000367974 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
LAMA3Q16787 PRIM2-202ENST00000370687 909 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
LAMA3Q16787 RNU6ATAC34P-201ENST00000408879 121 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
LAMA3Q16787 GPS2P1-201ENST00000411761 986 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
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