Protein–RNA interactions for Protein: Q16656

NRF1, Nuclear respiratory factor 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRF1Q16656 SEPT7P9-201ENST00000475691 413 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
NRF1Q16656 AC090568.1-201ENST00000509499 856 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
NRF1Q16656 LINC02506-201ENST00000513211 734 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
NRF1Q16656 AC025366.1-201ENST00000523264 202 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
NRF1Q16656 AL133481.2-201ENST00000538322 367 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
NRF1Q16656 AC022523.1-201ENST00000560360 364 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
NRF1Q16656 ZNF174-204ENST00000572544 1002 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
NRF1Q16656 AP005136.2-201ENST00000583253 1049 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
NRF1Q16656 AC010503.3-201ENST00000594355 540 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
NRF1Q16656 ZNF682-208ENST00000596019 552 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
NRF1Q16656 RPSAP75-201ENST00000605848 301 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
NRF1Q16656 AC026786.2-201ENST00000606110 392 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
NRF1Q16656 AC096861.1-201ENST00000616652 240 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
NRF1Q16656 MIR6133-201ENST00000617057 108 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
NRF1Q16656 DARS-AS1-227ENST00000627442 633 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
NRF1Q16656 AL357140.4-201ENST00000636827 412 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
NRF1Q16656 AC099329.2-203ENST00000471537 3605 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
NRF1Q16656 LINC02355-201ENST00000503100 2520 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
NRF1Q16656 MTND5P12-201ENST00000502851 1449 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
NRF1Q16656 RAPH1-204ENST00000418114 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
NRF1Q16656 RAPH1-205ENST00000419464 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
NRF1Q16656 AC008695.1-201ENST00000514667 6393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
NRF1Q16656 DNAH5-201ENST00000265104 15633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
NRF1Q16656 KLHL5-202ENST00000261426 3300 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
NRF1Q16656 TEX9-209ENST00000561221 2297 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
NRF1Q16656 TRPC4-201ENST00000338947 2912 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
NRF1Q16656 SCN2A-207ENST00000631182 8430 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
NRF1Q16656 AC119674.1-202ENST00000641333 1860 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
NRF1Q16656 ATXN7-208ENST00000484332 2741 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
NRF1Q16656 GPX8-201ENST00000296734 3245 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
NRF1Q16656 SGO1-202ENST00000306698 1531 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
NRF1Q16656 AASDH-202ENST00000451613 3182 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
NRF1Q16656 PTBP3-207ENST00000458258 7995 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
NRF1Q16656 HUWE1-214ENST00000612484 14311 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
NRF1Q16656 AC002525.1-201ENST00000624392 1622 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
NRF1Q16656 NOL8-214ENST00000535387 3390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
NRF1Q16656 STX19-201ENST00000315099 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
NRF1Q16656 XAGE5-201ENST00000351072 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
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NRF1Q16656 CLEC1A-204ENST00000457018 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
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NRF1Q16656 TCF4-290ENST00000638154 7801 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
NRF1Q16656 WDPCP-203ENST00000409120 5408 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
NRF1Q16656 AP001605.1-201ENST00000420186 2603 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
NRF1Q16656 PHLDB2-214ENST00000495180 4159 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
NRF1Q16656 KIAA0391-209ENST00000604948 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
NRF1Q16656 USP15-201ENST00000280377 4748 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
NRF1Q16656 LINC01541-202ENST00000568095 3105 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
NRF1Q16656 TSLP-201ENST00000344895 736 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
NRF1Q16656 FAS-203ENST00000355279 983 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
NRF1Q16656 SNORA21-201ENST00000362423 132 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
NRF1Q16656 RNA5SP211-201ENST00000365516 117 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
NRF1Q16656 FETUB-203ENST00000382136 1040 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
NRF1Q16656 MIR323B-201ENST00000385269 82 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
NRF1Q16656 TRAV8-4-201ENST00000390438 469 ntAPPRIS P1 BASIC5.52□□□□□ -1.53
NRF1Q16656 AC092642.1-201ENST00000392417 425 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
NRF1Q16656 OR7E156P-201ENST00000400303 464 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
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