Protein–RNA interactions for Protein: Q16595

FXN, Frataxin, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXNQ16595 RN7SL775P-201ENST00000498361 336 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
FXNQ16595 LINC02465-201ENST00000507099 532 ntTSL 4 BASIC6.65□□□□□ -1.34
FXNQ16595 AC116049.2-201ENST00000508572 754 ntTSL 4 BASIC6.65□□□□□ -1.34
FXNQ16595 AC025176.1-201ENST00000510261 365 ntTSL 4 BASIC6.65□□□□□ -1.34
FXNQ16595 AC092436.4-201ENST00000510905 483 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
FXNQ16595 AP002004.1-202ENST00000528437 586 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
FXNQ16595 AP000880.1-201ENST00000529416 743 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
FXNQ16595 RPL27A-211ENST00000532359 406 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
FXNQ16595 SDHAF2-205ENST00000537782 559 ntTSL 4 BASIC6.65□□□□□ -1.34
FXNQ16595 AC090673.2-201ENST00000544279 454 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
FXNQ16595 AP000619.2-201ENST00000546014 969 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
FXNQ16595 AL157871.4-201ENST00000557226 385 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
FXNQ16595 OR4F28P-201ENST00000559128 938 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
FXNQ16595 AC023813.3-201ENST00000561876 539 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
FXNQ16595 LINC2194-202ENST00000567624 506 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
FXNQ16595 AC010547.3-201ENST00000569271 440 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
FXNQ16595 AC130456.5-201ENST00000569345 510 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
FXNQ16595 DPRXP4-201ENST00000578053 568 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
FXNQ16595 RN7SL786P-201ENST00000579130 298 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
FXNQ16595 LINC01476-202ENST00000584262 635 ntTSL 4 BASIC6.65□□□□□ -1.34
FXNQ16595 OR4F8P-201ENST00000589943 937 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
FXNQ16595 AC015802.4-202ENST00000591967 474 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
FXNQ16595 MIR663AHG-213ENST00000596767 837 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
FXNQ16595 AL050403.2-203ENST00000603180 558 ntTSL 4 BASIC6.65□□□□□ -1.34
FXNQ16595 AL050403.2-202ENST00000603462 492 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
FXNQ16595 AL163642.2-201ENST00000604722 1019 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
FXNQ16595 AC016582.3-206ENST00000636547 207 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
FXNQ16595 GRPR-201ENST00000380289 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
FXNQ16595 KAT6B-203ENST00000372714 5892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
FXNQ16595 OR6C3-202ENST00000641364 1341 ntAPPRIS P1 BASIC6.65□□□□□ -1.35
FXNQ16595 FAM49A-201ENST00000381323 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
FXNQ16595 LINC00690-201ENST00000429949 1365 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
FXNQ16595 COPS3-203ENST00000439936 1394 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
FXNQ16595 TBX15-201ENST00000207157 3492 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
FXNQ16595 AC010894.3-202ENST00000412835 1405 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.35
FXNQ16595 ADAM18-206ENST00000520772 1429 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
FXNQ16595 LINC01152-201ENST00000472655 3578 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
FXNQ16595 PCDH18-202ENST00000412923 5102 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
FXNQ16595 CNTNAP4-209ENST00000622250 3783 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
FXNQ16595 BRWD1-203ENST00000342449 12929 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
FXNQ16595 VEZF1P1-201ENST00000423931 1541 ntBASIC6.65□□□□□ -1.35
FXNQ16595 IFT80-225ENST00000496589 3073 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.35
FXNQ16595 ART3-203ENST00000355810 1561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
FXNQ16595 DDX50P1-201ENST00000438163 2400 ntBASIC6.65□□□□□ -1.35
FXNQ16595 CUL4B-204ENST00000404115 3264 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
FXNQ16595 PDE4DIP-204ENST00000369351 4922 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
FXNQ16595 ADGRL3-206ENST00000507164 4982 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
FXNQ16595 BRCA1-210ENST00000471181 5936 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
FXNQ16595 ALG11-202ENST00000521508 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
FXNQ16595 AC013562.1-201ENST00000519427 1722 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
FXNQ16595 AC015689.2-201ENST00000528172 1738 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
FXNQ16595 UG0898H09-202ENST00000623646 7040 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
FXNQ16595 FYB1-209ENST00000512982 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
FXNQ16595 DDX18-201ENST00000263239 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
FXNQ16595 ABRAXAS2-201ENST00000298492 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
FXNQ16595 DNM1L-201ENST00000266481 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
FXNQ16595 IGF2BP3-201ENST00000258729 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
FXNQ16595 AC011455.2-201ENST00000599320 3336 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
FXNQ16595 LINC01492-201ENST00000411575 3738 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
FXNQ16595 OR4M1-201ENST00000315957 1116 ntAPPRIS P1 BASIC6.64□□□□□ -1.35
FXNQ16595 AC008549.2-201ENST00000333482 706 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
FXNQ16595 CREM-201ENST00000337656 900 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
FXNQ16595 RNA5SP512-201ENST00000364550 120 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
FXNQ16595 RNA5SP172-201ENST00000365061 118 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
FXNQ16595 IGKV6D-41-201ENST00000390271 371 ntAPPRIS P1 BASIC6.64□□□□□ -1.35
FXNQ16595 RNU6-1320P-201ENST00000390838 107 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
FXNQ16595 RNU6-1269P-201ENST00000391139 107 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
FXNQ16595 AC093719.1-202ENST00000392735 373 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
FXNQ16595 BTF3L4P1-201ENST00000413813 468 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
FXNQ16595 VNN3-205ENST00000417437 1117 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
FXNQ16595 AL390840.1-201ENST00000420303 988 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
FXNQ16595 AC009299.3-201ENST00000421122 1072 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
FXNQ16595 AC007679.2-201ENST00000422116 781 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
FXNQ16595 TBX18-AS1-201ENST00000423086 421 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
FXNQ16595 OR13C7-201ENST00000424348 959 ntAPPRIS P1 BASIC6.64□□□□□ -1.35
FXNQ16595 AL035407.1-201ENST00000429211 571 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
FXNQ16595 MTCO1P3-201ENST00000429327 192 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
FXNQ16595 AL109807.1-201ENST00000438222 569 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
FXNQ16595 RPSAP49-201ENST00000445182 886 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
FXNQ16595 AC009299.3-202ENST00000445372 538 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
FXNQ16595 AC044781.1-201ENST00000446193 570 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
FXNQ16595 LINC01831-201ENST00000449772 493 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
FXNQ16595 AC008080.2-201ENST00000455149 577 ntTSL 4 BASIC6.64□□□□□ -1.35
FXNQ16595 AL109741.2-201ENST00000455561 343 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
FXNQ16595 AC010789.1-201ENST00000458489 291 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
FXNQ16595 RNU6-599P-201ENST00000459383 107 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
FXNQ16595 RNU6-1193P-201ENST00000459461 107 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
FXNQ16595 AC007849.1-201ENST00000469794 513 ntTSL 4 BASIC6.64□□□□□ -1.35
FXNQ16595 BZW1P2-201ENST00000473537 826 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
FXNQ16595 RN7SL314P-201ENST00000490735 292 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
FXNQ16595 AC112206.2-201ENST00000503106 557 ntTSL 4 BASIC6.64□□□□□ -1.35
FXNQ16595 OR7E163P-201ENST00000505943 894 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
FXNQ16595 FGB-207ENST00000509493 1164 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
FXNQ16595 AC026700.1-201ENST00000512074 544 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
FXNQ16595 AC023200.1-201ENST00000519660 651 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
FXNQ16595 AC011632.2-201ENST00000520696 738 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
FXNQ16595 AC090692.1-202ENST00000525363 607 ntTSL 4 BASIC6.64□□□□□ -1.35
FXNQ16595 FAXC-204ENST00000538471 941 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
FXNQ16595 AC092747.2-201ENST00000545069 983 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
FXNQ16595 RPL3P13-201ENST00000550415 216 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82 ms