Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 RPL35AP19-201ENST00000469425 329 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 SEPT7P9-201ENST00000475691 413 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 RN7SL259P-201ENST00000478499 253 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 LINC01323-201ENST00000486767 576 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 RN7SL776P-201ENST00000493390 268 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 AC122714.1-201ENST00000502510 459 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 AC095057.1-201ENST00000507583 168 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 CFI-204ENST00000510800 667 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 AC013724.1-201ENST00000511962 783 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 AC097460.1-204ENST00000515026 764 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 RN7SKP98-201ENST00000517070 156 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 SMG1P4-203ENST00000517529 1589 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 AC087855.1-201ENST00000518178 430 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 LINC01603-202ENST00000519557 712 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 AC093331.2-201ENST00000520459 677 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 AC087379.1-201ENST00000524613 993 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 AC087783.1-201ENST00000527135 564 ntTSL 4 BASIC5.95□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 NPIPB14P-203ENST00000532298 987 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 OR4A21P-201ENST00000532759 944 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 AC130360.2-201ENST00000533477 1556 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 LINC01493-203ENST00000534756 509 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 ERP27-202ENST00000540097 993 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 AC010198.2-201ENST00000550612 259 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 OVCH1-AS1-202ENST00000550906 654 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 AC021979.2-201ENST00000553644 209 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 PCLAF-203ENST00000558008 766 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 SRP14-AS1-203ENST00000560341 669 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 AL031846.1-201ENST00000560933 314 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 AADACP1-206ENST00000561502 1193 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 OR4C49P-201ENST00000563891 900 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 AP001122.1-201ENST00000572256 541 ntTSL 4 BASIC5.95□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 AP005230.1-204ENST00000579097 779 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 AC023394.2-201ENST00000581987 792 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 AC018521.2-202ENST00000582142 473 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 AC005208.1-202ENST00000587325 725 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 AL021368.3-201ENST00000607119 578 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 AP003392.5-201ENST00000607857 415 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 LINC02019-202ENST00000609204 845 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 AL121782.1-201ENST00000611242 413 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 AL450489.1-201ENST00000612071 468 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 AL161931.1-201ENST00000612768 246 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 ZNF227-213ENST00000621083 3055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 AL132796.3-201ENST00000624703 900 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 AC103706.2-201ENST00000638080 240 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 OR7E161P-202ENST00000641994 1033 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 OR7C1-205ENST00000642030 11778 ntAPPRIS P1 BASIC5.95□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 KAT6A-202ENST00000396930 9285 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 GDA-209ENST00000545168 5362 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 NBPF14-209ENST00000620240 2656 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 AQP4-201ENST00000383168 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 ZNF254-207ENST00000613065 4244 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 VPS8-201ENST00000287546 5047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 AP005139.1-201ENST00000580702 1647 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 AC121761.1-201ENST00000547326 1482 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 CLCN3-211ENST00000613795 5874 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 ZNF438-201ENST00000331737 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 ST7-204ENST00000393444 2113 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 AKAP6-213ENST00000557354 5259 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 DMD-202ENST00000343523 5623 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 DLEU7-AS1-201ENST00000413510 1806 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 ZNF410-211ENST00000555044 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 CYP4Z2P-201ENST00000423332 1512 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 OR11G2-203ENST00000641879 4415 ntAPPRIS P1 BASIC5.94□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 EEF1A1P20-201ENST00000514852 1386 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 MAP4K4-221ENST00000634702 3800 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 AC107980.1-201ENST00000558671 3355 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 PLEKHA1-204ENST00000392799 3221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 ZNF490-201ENST00000311437 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 GTDC1-212ENST00000463875 1563 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 ERVW-1-202ENST00000603053 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 VTCN1-201ENST00000328189 2289 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 CEP152-201ENST00000325747 4986 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 RNU4-81P-201ENST00000363561 144 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 RNU6-1017P-201ENST00000363613 106 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 snoZ40.1-201ENST00000364540 72 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 SNORA62.2-201ENST00000364672 152 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 BMS1P3-201ENST00000372011 932 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 OR10A4-201ENST00000379829 995 ntAPPRIS P1 BASIC5.94□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 SNORD116-1-201ENST00000384335 95 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 MIR138-2-201ENST00000384916 84 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 TRAV5-201ENST00000390427 352 ntAPPRIS P1 BASIC5.94□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 CFAP70-204ENST00000394865 1222 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 LYPLA1P3-201ENST00000402650 695 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 RNU4ATAC2P-201ENST00000408674 126 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 LSM5-205ENST00000409952 687 ntTSL 4 BASIC5.94□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 AL365203.2-201ENST00000423444 196 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 UQCRHP1-204ENST00000424609 274 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 OR52S1P-201ENST00000427016 937 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 NANOGP4-201ENST00000427230 913 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 FAM96AP1-201ENST00000430879 482 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 CDY14P-201ENST00000431260 1014 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 HNRNPA1P57-201ENST00000431359 530 ntTSL 4 BASIC5.94□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 BBIP1-205ENST00000436562 383 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 AL592114.2-201ENST00000440142 532 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 RPL29P7-201ENST00000440227 457 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 CDY12P-201ENST00000440679 1015 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 AC009237.4-201ENST00000441078 238 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 CDY13P-201ENST00000445813 1015 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 CEACAMP5-201ENST00000448037 961 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 CDY23P-201ENST00000451661 1014 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.9 ms