Protein–RNA interactions for Protein: Q13951

CBFB, Core-binding factor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBFBQ13951 AADAT-202ENST00000353187 2101 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
CBFBQ13951 NFX1-201ENST00000318524 3513 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
CBFBQ13951 AL645568.2-201ENST00000432815 1337 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
CBFBQ13951 RUNX1T1-234ENST00000521553 1346 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
CBFBQ13951 RBMS2-202ENST00000542360 1484 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
CBFBQ13951 RABGAP1L-208ENST00000392064 6282 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
CBFBQ13951 RXFP1-211ENST00000613319 3771 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
CBFBQ13951 IMMTP1-201ENST00000435590 2219 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
CBFBQ13951 PUM2-202ENST00000338086 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
CBFBQ13951 CLEC2D-202ENST00000261340 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
CBFBQ13951 SPATA9-201ENST00000274432 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
CBFBQ13951 AC010132.2-201ENST00000295493 1043 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
CBFBQ13951 THAP6-201ENST00000311638 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
CBFBQ13951 FSCB-201ENST00000340446 2938 ntAPPRIS P1 BASIC5.78□□□□□ -1.48
CBFBQ13951 MIR16-2-201ENST00000362117 81 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
CBFBQ13951 SLC16A4-201ENST00000369779 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
CBFBQ13951 YWHAZP4-201ENST00000392459 708 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
CBFBQ13951 DEFB133-201ENST00000398721 186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
CBFBQ13951 AL034417.1-201ENST00000399343 800 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
CBFBQ13951 RPL10P10-201ENST00000403509 664 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
CBFBQ13951 PRELID1P1-201ENST00000403549 660 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
CBFBQ13951 RN7SKP161-201ENST00000411110 305 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
CBFBQ13951 AC105275.1-201ENST00000417794 491 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
CBFBQ13951 NIFKP3-201ENST00000417799 865 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
CBFBQ13951 AL359976.1-201ENST00000418655 3528 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
CBFBQ13951 GNS-202ENST00000418919 4877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
CBFBQ13951 AL158013.1-202ENST00000419666 520 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
CBFBQ13951 AL360093.1-201ENST00000420237 1126 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
CBFBQ13951 AC009404.1-201ENST00000420330 3090 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
CBFBQ13951 AL031846.1-202ENST00000424436 592 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
CBFBQ13951 QKI-206ENST00000424802 954 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
CBFBQ13951 LINC01611-201ENST00000428896 477 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
CBFBQ13951 AC046176.1-201ENST00000435260 1170 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
CBFBQ13951 AL513348.1-201ENST00000435554 440 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
CBFBQ13951 AC016908.1-201ENST00000442571 1219 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
CBFBQ13951 AL357052.1-201ENST00000443504 381 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
CBFBQ13951 AL139120.1-201ENST00000443652 358 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
CBFBQ13951 AL731661.2-201ENST00000448824 806 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
CBFBQ13951 AC099670.1-201ENST00000455141 783 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
CBFBQ13951 CFHR2-203ENST00000476712 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
CBFBQ13951 RN7SL369P-201ENST00000477138 299 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
CBFBQ13951 AADACP1-204ENST00000483636 1285 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
CBFBQ13951 AC008410.1-201ENST00000483777 339 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
CBFBQ13951 GM2AP2-201ENST00000491764 562 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
CBFBQ13951 AC087667.1-201ENST00000500180 1422 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
CBFBQ13951 AC023794.2-201ENST00000504891 528 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
CBFBQ13951 LINC01217-201ENST00000514427 562 ntTSL 4 BASIC5.78□□□□□ -1.48
CBFBQ13951 RNA5SP400-201ENST00000517155 111 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
CBFBQ13951 RAD21-203ENST00000517749 1003 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
CBFBQ13951 AP003469.1-202ENST00000521884 478 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
CBFBQ13951 AP001372.4-201ENST00000524889 472 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
CBFBQ13951 AP002336.3-201ENST00000526017 367 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
CBFBQ13951 AP001804.1-201ENST00000526868 919 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
CBFBQ13951 AC090791.1-201ENST00000530960 492 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
CBFBQ13951 KBTBD3-204ENST00000531482 874 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
CBFBQ13951 OR4A40P-201ENST00000533878 948 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
CBFBQ13951 AC137590.1-201ENST00000542422 495 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
CBFBQ13951 PARPBP-212ENST00000543784 992 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
CBFBQ13951 CTNNA3-205ENST00000545309 555 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
CBFBQ13951 AC008055.1-201ENST00000547032 609 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
CBFBQ13951 COPZ1-205ENST00000548753 778 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
CBFBQ13951 COPZ1-218ENST00000553231 551 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
CBFBQ13951 RPGRIP1L-208ENST00000566096 893 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
CBFBQ13951 MIR744-201ENST00000578242 98 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
CBFBQ13951 AC015849.2-201ENST00000605738 409 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
CBFBQ13951 AC018754.1-201ENST00000607486 925 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
CBFBQ13951 LIPF-205ENST00000608620 1290 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
CBFBQ13951 AC112503.2-201ENST00000609005 552 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
CBFBQ13951 AL137246.2-201ENST00000613439 662 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
CBFBQ13951 ZNHIT3-208ENST00000619730 926 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
CBFBQ13951 MIR6811-201ENST00000620409 58 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
CBFBQ13951 AC089999.3-201ENST00000622440 577 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
CBFBQ13951 THEMIS-206ENST00000630369 2786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
CBFBQ13951 SCRN1-210ENST00000631335 423 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
CBFBQ13951 LINC01091-203ENST00000514823 5262 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
CBFBQ13951 BIN2P1-201ENST00000504996 1530 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
CBFBQ13951 EIF1AY-201ENST00000361365 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
CBFBQ13951 CCDC190-202ENST00000367911 1395 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
CBFBQ13951 CLASP2-205ENST00000461133 4814 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
CBFBQ13951 FTO-204ENST00000463855 3056 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
CBFBQ13951 RFC1-202ENST00000381897 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.48
CBFBQ13951 TMEM161BP1-201ENST00000457388 1457 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
CBFBQ13951 AC011815.2-201ENST00000618230 2021 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
CBFBQ13951 DYNC2LI1-210ENST00000605786 1346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
CBFBQ13951 CRB1-203ENST00000367400 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
CBFBQ13951 KIAA0586-203ENST00000423743 5339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
CBFBQ13951 ECT2L-205ENST00000541398 4483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
CBFBQ13951 CD86-203ENST00000393627 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
CBFBQ13951 AL359715.4-201ENST00000606629 1436 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
CBFBQ13951 AL442071.1-201ENST00000289890 558 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
CBFBQ13951 TMEM31-201ENST00000319560 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
CBFBQ13951 PIH1D3-201ENST00000336387 993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
CBFBQ13951 OR51F1-201ENST00000380383 960 ntAPPRIS P5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
CBFBQ13951 AL451046.1-201ENST00000406097 534 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
CBFBQ13951 AL158050.1-201ENST00000416077 457 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
CBFBQ13951 AL158827.1-201ENST00000416300 391 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
CBFBQ13951 AC234781.4-201ENST00000419384 244 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
CBFBQ13951 Z82198.3-201ENST00000421145 199 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
CBFBQ13951 LINC01435-201ENST00000425050 722 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
CBFBQ13951 AC244453.3-201ENST00000426275 459 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.7 ms