Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

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Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 TAS2R31-201ENST00000390675 1021 ntAPPRIS P1 BASIC7.95□□□□□ -1.14
PTCH1Q13635 RNA5SP251-201ENST00000410614 137 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
PTCH1Q13635 C14orf105-202ENST00000422976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
PTCH1Q13635 PIH1D2-202ENST00000431456 1245 ntTSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
PTCH1Q13635 AL731534.1-201ENST00000434711 269 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
PTCH1Q13635 CEACAMP7-201ENST00000444105 496 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
PTCH1Q13635 AC011396.3-201ENST00000508845 512 ntTSL 3 BASIC7.95□□□□□ -1.14
PTCH1Q13635 MYLK-AS2-201ENST00000510827 500 ntTSL 3 BASIC7.95□□□□□ -1.14
PTCH1Q13635 AC097515.1-202ENST00000511818 371 ntTSL 3 BASIC7.95□□□□□ -1.14
PTCH1Q13635 AC090424.1-201ENST00000535243 736 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
PTCH1Q13635 AC090109.1-201ENST00000548885 819 ntTSL 3 BASIC7.95□□□□□ -1.14
PTCH1Q13635 AC004448.4-204ENST00000585389 743 ntTSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
PTCH1Q13635 AC025574.2-201ENST00000615621 514 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
PTCH1Q13635 LINC02246-206ENST00000630211 712 ntTSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
PTCH1Q13635 LMO7-203ENST00000357063 8237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
PTCH1Q13635 FYB2-201ENST00000343433 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
PTCH1Q13635 VEGFD-201ENST00000297904 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
PTCH1Q13635 AL359195.2-201ENST00000623657 4412 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
PTCH1Q13635 TRIQK-223ENST00000537541 3510 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.94□□□□□ -1.14
PTCH1Q13635 ZNF248-201ENST00000357328 4795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.94□□□□□ -1.14
PTCH1Q13635 OR51E2-203ENST00000641638 2626 ntAPPRIS P1 BASIC7.94□□□□□ -1.14
PTCH1Q13635 WASHC4-202ENST00000332180 5812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
PTCH1Q13635 MTTP-203ENST00000457717 4092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
PTCH1Q13635 MIA3-201ENST00000340535 2735 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
PTCH1Q13635 MID1-202ENST00000380779 6044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
PTCH1Q13635 SNORD8-201ENST00000363915 110 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
PTCH1Q13635 AC116036.1-201ENST00000412199 367 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
PTCH1Q13635 AC025946.1-201ENST00000413286 430 ntTSL 3 BASIC7.94□□□□□ -1.14
PTCH1Q13635 RPS26P13-201ENST00000419030 330 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
PTCH1Q13635 LINC02257-202ENST00000433576 720 ntTSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
PTCH1Q13635 Z80107.2-201ENST00000445127 392 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
PTCH1Q13635 RPL7P6-201ENST00000480903 738 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
PTCH1Q13635 RN7SL447P-201ENST00000494711 245 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
PTCH1Q13635 AL671862.1-201ENST00000515851 349 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
PTCH1Q13635 RN7SKP288-201ENST00000516227 268 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
PTCH1Q13635 PFDN1-207ENST00000524074 395 ntTSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
PTCH1Q13635 FCF1-203ENST00000553615 954 ntTSL 3 BASIC7.94□□□□□ -1.14
PTCH1Q13635 LINC01966-201ENST00000595809 821 ntTSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
PTCH1Q13635 AC009093.5-201ENST00000620963 359 ntTSL 2 BASIC7.94□□□□□ -1.14
PTCH1Q13635 NAPEPLD-203ENST00000417955 4988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
PTCH1Q13635 CPED1-203ENST00000423795 2189 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
PTCH1Q13635 AL662795.2-201ENST00000624252 3706 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
PTCH1Q13635 NDST4-204ENST00000613194 3439 ntTSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
PTCH1Q13635 AIMP1-203ENST00000442366 2519 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
PTCH1Q13635 AL080276.2-201ENST00000637995 2090 ntTSL 3 BASIC7.93□□□□□ -1.14
PTCH1Q13635 MAGEB16-204ENST00000399989 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
PTCH1Q13635 SERPINB11-205ENST00000544088 1846 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.93□□□□□ -1.14
PTCH1Q13635 OR2T2-202ENST00000641925 3530 ntAPPRIS P1 BASIC7.93□□□□□ -1.14
PTCH1Q13635 SORBS1-219ENST00000607232 4374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
PTCH1Q13635 SSR1-201ENST00000244763 9669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
PTCH1Q13635 XRCC5-201ENST00000392132 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
PTCH1Q13635 LHX9-201ENST00000367387 7836 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
PTCH1Q13635 TMEM167B-201ENST00000338272 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
PTCH1Q13635 CLCC1-205ENST00000369969 4343 ntTSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
PTCH1Q13635 UNC79-202ENST00000393151 7908 ntTSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
PTCH1Q13635 OR5B12-201ENST00000302572 1054 ntAPPRIS P1 BASIC7.93□□□□□ -1.14
PTCH1Q13635 AL391097.2-201ENST00000435057 485 ntTSL 3 BASIC7.93□□□□□ -1.14
PTCH1Q13635 AC096775.1-201ENST00000437724 448 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
PTCH1Q13635 AL161618.1-201ENST00000438738 761 ntTSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
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PTCH1Q13635 RSRC1-207ENST00000475278 1195 ntTSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
PTCH1Q13635 AC007686.1-201ENST00000488511 463 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
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PTCH1Q13635 GYPB-202ENST00000502664 521 ntTSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
PTCH1Q13635 AC079226.2-201ENST00000509283 518 ntTSL 2 BASIC7.93□□□□□ -1.14
PTCH1Q13635 KCTD21-AS1-206ENST00000532831 856 ntTSL 2 BASIC7.93□□□□□ -1.14
PTCH1Q13635 MIR4697-201ENST00000582977 78 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
PTCH1Q13635 Metazoa_SRP.207-201ENST00000612254 285 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
PTCH1Q13635 ZNF227-201ENST00000313040 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
PTCH1Q13635 TRPC4-202ENST00000355779 2784 ntTSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
PTCH1Q13635 TRPC4-204ENST00000379673 2760 ntTSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
PTCH1Q13635 ATF7IP-222ENST00000544627 4847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
PTCH1Q13635 C4orf33-202ENST00000425929 1588 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.92□□□□□ -1.14
PTCH1Q13635 CACNA2D3-210ENST00000490478 3557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
PTCH1Q13635 RAPGEF6-208ENST00000509018 8357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
PTCH1Q13635 LINC00698-203ENST00000468072 1957 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
PTCH1Q13635 ZMAT1-201ENST00000372782 3185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
PTCH1Q13635 MAGI2-235ENST00000637282 3174 ntTSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
PTCH1Q13635 OR5M8-201ENST00000327216 1047 ntAPPRIS P1 BASIC7.92□□□□□ -1.14
PTCH1Q13635 CENPW-203ENST00000368328 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
PTCH1Q13635 SNORA70H-201ENST00000383910 135 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
PTCH1Q13635 SNORA70J-201ENST00000384182 135 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
PTCH1Q13635 AC007562.1-201ENST00000421819 517 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
PTCH1Q13635 AC244394.2-201ENST00000425109 735 ntTSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
PTCH1Q13635 AC016027.5-201ENST00000427227 210 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
PTCH1Q13635 AC092106.1-201ENST00000444291 373 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
PTCH1Q13635 AC023274.2-201ENST00000445264 521 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
PTCH1Q13635 AC009220.1-201ENST00000451614 275 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
PTCH1Q13635 LINC02499-201ENST00000502291 763 ntTSL 3 BASIC7.92□□□□□ -1.14
PTCH1Q13635 AC106864.2-201ENST00000505632 740 ntTSL 2 BASIC7.92□□□□□ -1.14
PTCH1Q13635 AC013644.1-202ENST00000523166 499 ntTSL 2 BASIC7.92□□□□□ -1.14
PTCH1Q13635 AC022098.3-201ENST00000590715 315 ntTSL 3 BASIC7.92□□□□□ -1.14
PTCH1Q13635 LINGO2-204ENST00000613945 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
PTCH1Q13635 AC090607.5-201ENST00000615692 224 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
PTCH1Q13635 FSTL5-202ENST00000379164 4757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
PTCH1Q13635 AC010401.2-201ENST00000575137 4934 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
PTCH1Q13635 KIAA0040-206ENST00000619513 4340 ntTSL 2 BASIC7.92□□□□□ -1.14
PTCH1Q13635 CSNK1G1-204ENST00000606793 1658 ntTSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
PTCH1Q13635 ITSN1-206ENST00000381318 17015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
PTCH1Q13635 MOSPD2-201ENST00000380492 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
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