Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

Predictions only

Length 790 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 SERF1B-203ENST00000503931 569 ntTSL 4 BASIC5.98□□□□□ -1.45
CDH18Q13634 SERF1A-204ENST00000504458 569 ntTSL 4 BASIC5.98□□□□□ -1.45
CDH18Q13634 AC011396.3-201ENST00000508845 512 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
CDH18Q13634 AC109481.1-201ENST00000509173 282 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
CDH18Q13634 MIR2117-201ENST00000516780 80 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
CDH18Q13634 AP003031.2-202ENST00000533590 572 ntTSL 4 BASIC5.98□□□□□ -1.45
CDH18Q13634 FRMD6-AS2-201ENST00000556617 548 ntTSL 4 BASIC5.98□□□□□ -1.45
CDH18Q13634 AC107419.1-202ENST00000608735 1081 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
CDH18Q13634 AL352984.2-201ENST00000611153 546 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
CDH18Q13634 AC126175.1-201ENST00000617041 758 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
CDH18Q13634 C1orf195-202ENST00000625027 441 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
CDH18Q13634 UOX-205ENST00000640983 544 ntTSL 4 BASIC5.98□□□□□ -1.45
CDH18Q13634 IGLV10-54-202ENST00000640991 351 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
CDH18Q13634 MIR193BHG-214ENST00000641765 509 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
CDH18Q13634 AC239868.2-201ENST00000564237 4527 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
CDH18Q13634 WDR63-202ENST00000326813 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
CDH18Q13634 AC022164.1-201ENST00000568767 2673 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
CDH18Q13634 CLSPN-202ENST00000318121 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
CDH18Q13634 ZNF214-204ENST00000536068 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
CDH18Q13634 CCDC77-201ENST00000239830 2371 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
CDH18Q13634 ZNF311-203ENST00000377179 2730 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
CDH18Q13634 RUFY3-202ENST00000381006 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
CDH18Q13634 KCNT2-203ENST00000451324 3146 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
CDH18Q13634 UGT2B11-201ENST00000446444 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
CDH18Q13634 CARD6-201ENST00000254691 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
CDH18Q13634 INSL4-201ENST00000239316 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
CDH18Q13634 AP004607.3-201ENST00000530354 3915 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
CDH18Q13634 SLAMF6-203ENST00000368059 2743 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
CDH18Q13634 SSX5-202ENST00000347757 1261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
CDH18Q13634 WFDC11-202ENST00000356562 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
CDH18Q13634 RN7SKP81-201ENST00000365603 331 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
CDH18Q13634 SSX5-203ENST00000376923 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
CDH18Q13634 CEACAM7-202ENST00000401731 1236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
CDH18Q13634 OR2W4P-201ENST00000406496 926 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
CDH18Q13634 RN7SKP286-201ENST00000410894 299 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
CDH18Q13634 SDHDP6-201ENST00000414693 480 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
CDH18Q13634 RPL34P3-201ENST00000421454 338 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
CDH18Q13634 AC019205.1-201ENST00000421830 730 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
CDH18Q13634 AL158817.1-201ENST00000422310 933 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
CDH18Q13634 AC244033.1-201ENST00000426826 870 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
CDH18Q13634 RPL12P16-201ENST00000431098 498 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
CDH18Q13634 AL365220.1-201ENST00000432923 399 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
CDH18Q13634 AL391987.1-201ENST00000441025 200 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
CDH18Q13634 AC064862.4-201ENST00000442180 334 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
CDH18Q13634 AC092941.2-201ENST00000444379 1008 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
CDH18Q13634 TAS2R39-201ENST00000446620 1017 ntAPPRIS P1 BASIC5.97□□□□□ -1.45
CDH18Q13634 AC245041.2-201ENST00000479781 376 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
CDH18Q13634 AC079080.1-201ENST00000479841 822 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
CDH18Q13634 LINC02006-201ENST00000488210 524 ntTSL 4 BASIC5.97□□□□□ -1.45
CDH18Q13634 WASHC5-AS1-201ENST00000519140 587 ntTSL 4 BASIC5.97□□□□□ -1.45
CDH18Q13634 IGLV3-30-201ENST00000524362 298 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
CDH18Q13634 AP003059.1-201ENST00000526206 432 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
CDH18Q13634 AL390816.1-201ENST00000553990 322 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
CDH18Q13634 AC022211.1-201ENST00000579554 717 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
CDH18Q13634 RN7SL544P-201ENST00000617232 284 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
CDH18Q13634 NADK2-211ENST00000617628 744 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
CDH18Q13634 RN7SL763P-201ENST00000620922 284 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
CDH18Q13634 AC069234.4-201ENST00000621276 412 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
CDH18Q13634 PCBP1-AS1-282ENST00000625783 826 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
CDH18Q13634 AP001043.1-201ENST00000626259 773 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
CDH18Q13634 MIR4302-201ENST00000638058 60 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
CDH18Q13634 NFE2L2-206ENST00000446151 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
CDH18Q13634 TMEM161B-211ENST00000512429 1796 ntTSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
CDH18Q13634 AP004243.1-201ENST00000529108 1433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
CDH18Q13634 HSPD1P8-201ENST00000400121 1658 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
CDH18Q13634 AC084816.1-210ENST00000540895 1920 ntTSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
CDH18Q13634 KLHL4-201ENST00000373114 2445 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
CDH18Q13634 BDNF-210ENST00000438929 4059 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
CDH18Q13634 NOL8-214ENST00000535387 3390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
CDH18Q13634 RMDN2-201ENST00000234195 1985 ntTSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
CDH18Q13634 CHMP1B2P-202ENST00000614414 6813 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
CDH18Q13634 CTAGE5-217ENST00000557038 2869 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
CDH18Q13634 LINC01206-204ENST00000482787 9580 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
CDH18Q13634 DSC2-201ENST00000251081 4826 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
CDH18Q13634 N4BP2L2-IT2-201ENST00000629393 4890 ntBASIC5.96□□□□□ -1.45
CDH18Q13634 ZEB2-241ENST00000637304 9158 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.45
CDH18Q13634 ENKUR-201ENST00000331161 3382 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
CDH18Q13634 CALCOCO2-204ENST00000448105 1916 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CDH18Q13634 PARP8-212ENST00000505697 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
CDH18Q13634 OR1L4-201ENST00000259466 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CDH18Q13634 MIR323A-201ENST00000362199 86 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
CDH18Q13634 SNORD1C-201ENST00000363315 78 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
CDH18Q13634 PPCS-201ENST00000372556 984 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CDH18Q13634 HMGB1P20-201ENST00000402555 677 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
CDH18Q13634 AC087380.1-202ENST00000415970 1163 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CDH18Q13634 NME1P1-201ENST00000420914 382 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
CDH18Q13634 AC003991.1-210ENST00000434733 1048 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CDH18Q13634 AC015983.1-201ENST00000441577 373 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
CDH18Q13634 AC099677.4-201ENST00000446786 380 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CDH18Q13634 PPIAP20-201ENST00000449839 135 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
CDH18Q13634 HNRNPDLP2-201ENST00000455248 751 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
CDH18Q13634 OR7E157P-201ENST00000494376 911 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
CDH18Q13634 MOSPD2-206ENST00000497603 775 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
CDH18Q13634 AC008680.1-201ENST00000523398 283 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CDH18Q13634 AC090424.1-201ENST00000535243 736 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
CDH18Q13634 AC244502.2-201ENST00000543361 851 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
CDH18Q13634 AC135626.1-201ENST00000556983 435 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
CDH18Q13634 AC087286.2-201ENST00000558980 660 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CDH18Q13634 BLOC1S6-209ENST00000565409 616 ntTSL 4 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CDH18Q13634 AC010547.6-201ENST00000571789 193 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
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