Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

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Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 AC104417.1-201ENST00000523974 751 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 AP000442.2-201ENST00000531108 440 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 C11orf74-210ENST00000534635 801 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 AC016957.1-201ENST00000534895 309 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 AC019209.3-201ENST00000536949 772 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 AC023080.1-201ENST00000551663 931 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 AC007686.2-201ENST00000554043 469 ntTSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 OR11H3P-201ENST00000554547 982 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 LINC02303-204ENST00000555442 889 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 ZNF519P3-201ENST00000557158 1032 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 AL162464.1-201ENST00000557642 554 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 AC022523.3-201ENST00000559643 410 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 NQO1-205ENST00000561500 891 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 AC104938.1-202ENST00000563041 630 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 AC126323.4-201ENST00000566935 234 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 C16orf62-224ENST00000567245 573 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 SNORA59B-202ENST00000578183 701 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 AC022662.1-201ENST00000580252 331 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 RN7SL622P-201ENST00000585292 275 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 AC005208.1-202ENST00000587325 725 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 ZNF415-218ENST00000599261 601 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 CLPTM1LP1-201ENST00000604519 484 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 AL078624.2-201ENST00000605063 554 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 AC005377.1-201ENST00000605126 456 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 AC242426.3-203ENST00000606757 712 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 AC009237.15-201ENST00000610252 501 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 AC016769.4-201ENST00000616893 535 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 AC104985.2-201ENST00000620598 500 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 AC087565.2-201ENST00000637695 952 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 FGA-201ENST00000302053 3678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 AC097478.1-207ENST00000612706 2422 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 ERBIN-205ENST00000416865 2351 ntTSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 AC090673.1-202ENST00000356215 4617 ntTSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 CNOT1-216ENST00000569240 7660 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 SRFBP1-201ENST00000339397 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 MAPK10-357ENST00000641831 2858 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 AL359263.1-201ENST00000441188 2796 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 ALCAM-207ENST00000486979 1818 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 NDUFS1-201ENST00000233190 11819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 MIA3-201ENST00000340535 2735 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 IL31RA-201ENST00000297015 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 AC005034.3-201ENST00000604845 1747 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 ODF2L-201ENST00000294678 4267 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 BROX-201ENST00000340934 4124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 PYHIN1-204ENST00000392252 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
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FOXE3Q13461 EGFEM1P-205ENST00000483846 2327 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
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FOXE3Q13461 LINC01204-202ENST00000435394 2214 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
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FOXE3Q13461 CTNND1-218ENST00000528232 5745 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 C5orf24-201ENST00000338051 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
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FOXE3Q13461 TTTY3-201ENST00000417334 344 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
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FOXE3Q13461 AC004039.1-201ENST00000431165 502 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 OR6R1P-201ENST00000431838 940 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 MTND3P23-201ENST00000431980 347 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 ST7-AS2-203ENST00000434993 918 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 RPL14P5-201ENST00000436474 730 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 AL139237.2-201ENST00000438454 493 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
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FOXE3Q13461 LINC01628-201ENST00000444266 397 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 RPL21P33-201ENST00000444831 484 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 AL592447.1-201ENST00000447592 540 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 AL096803.2-201ENST00000450032 677 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
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FOXE3Q13461 ZNF114P1-201ENST00000453500 292 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 AC002368.1-201ENST00000456981 388 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 EIF3LP2-201ENST00000457262 807 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 CXCR6-203ENST00000457814 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 AC117395.2-201ENST00000463122 1128 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 C2orf74-204ENST00000464909 726 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 MBNL1-213ENST00000465907 945 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
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