Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 RAPGEF5-202ENST00000401957 6159 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 OCM2-201ENST00000257627 696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 OR10A3-201ENST00000360759 1061 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 PLIN2-202ENST00000380464 655 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 YWHAZP6-201ENST00000399764 738 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 AC025750.1-201ENST00000399891 379 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 IL6-203ENST00000401651 539 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 MTCO3P12-201ENST00000416718 547 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 AC079163.1-201ENST00000418416 407 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 RPS27AP14-201ENST00000422868 454 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 AL009174.1-201ENST00000426577 416 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 LINC00382-201ENST00000427918 890 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 EIF4A1P5-201ENST00000428062 1095 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 AL031123.1-201ENST00000432823 568 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 LINC00460-201ENST00000435024 631 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 AC092167.1-201ENST00000435466 495 ntTSL 4 BASIC7.4□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 DNAJA1P6-201ENST00000437347 354 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 S100A13-204ENST00000440685 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 ARL2BPP7-201ENST00000446421 490 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 COX6CP18-201ENST00000448769 222 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 USP9YP12-201ENST00000450481 570 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 AL451074.1-202ENST00000453762 989 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 PLCH1-AS2-201ENST00000472913 408 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 AHI1-208ENST00000488690 712 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 AC093325.1-201ENST00000508378 326 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 RPL10P19-201ENST00000519013 301 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 AC090150.1-201ENST00000521408 585 ntTSL 4 BASIC7.4□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 AC093027.1-201ENST00000546698 429 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 AC013356.3-201ENST00000558601 584 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 AC087477.3-201ENST00000559214 552 ntTSL 4 BASIC7.4□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 SCIMP-204ENST00000574297 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 MIR3137-201ENST00000577367 75 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 PRR13P4-201ENST00000577786 421 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 RN7SL14P-201ENST00000579715 298 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 DIAPH2-AS1-204ENST00000579945 974 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 C10orf82-203ENST00000588184 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 AC006305.2-201ENST00000589617 552 ntTSL 4 BASIC7.4□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 AL008635.1-201ENST00000609073 385 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 AL136295.6-201ENST00000610486 658 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 RN7SL82P-201ENST00000611435 237 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 RN7SL628P-201ENST00000619139 237 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 AP005242.3-201ENST00000623604 607 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 PSMC1P7-201ENST00000495689 1315 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 DLGAP1-AS2-202ENST00000573177 1388 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 EEF1A1P28-201ENST00000450915 1403 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 CEACAM20-205ENST00000620096 1494 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 CYLC2-204ENST00000612124 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 AC005538.2-201ENST00000623215 1864 ntBASIC7.4□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 ZRANB1-201ENST00000359653 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 MON2-202ENST00000393630 13275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 DNAJC5G-202ENST00000402462 1904 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 EPB41-201ENST00000343067 5956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 CACNB4-270ENST00000638040 2026 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 SPATS2L-201ENST00000358677 6156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 SGMS2-203ENST00000394686 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 ELF5-201ENST00000257832 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 AL049697.1-201ENST00000507897 2301 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 NPEPPS-215ENST00000530173 2864 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 IFIT2-202ENST00000611722 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 AC138409.1-201ENST00000505001 3598 ntBASIC7.4□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 Z97832.2-201ENST00000605896 4261 ntBASIC7.4□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 IRAK4-214ENST00000613694 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 AC060780.1-202ENST00000590740 5084 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 MAP3K20-201ENST00000338983 7179 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 CNR1-202ENST00000369499 5549 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 AC022784.6-204ENST00000520390 3442 ntTSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 PLEKHA5-215ENST00000539256 3357 ntTSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 ARHGAP11A-202ENST00000543522 3152 ntTSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 CUL4B-201ENST00000336592 3109 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 AC012467.2-201ENST00000607783 2583 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 GNL2-201ENST00000373062 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 AC098679.1-203ENST00000505532 2227 ntTSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 LINC01182-202ENST00000510907 2228 ntTSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 FOLH1B-202ENST00000529567 2145 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 GJA10-201ENST00000369352 1652 ntAPPRIS P2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 NXPE4-202ENST00000424261 1687 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 MT-RNR2-201ENST00000387347 1559 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 CCR3-202ENST00000395940 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 WASF5P-205ENST00000428639 1455 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 ZNF887P-201ENST00000431363 1407 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 AC093225.1-201ENST00000506867 1408 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 MPZL3-201ENST00000278949 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 LINC01677-204ENST00000635342 1329 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 PKHD1-201ENST00000340994 11589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 Y_RNA.394-201ENST00000383942 103 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 RNU6-483P-201ENST00000384088 108 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 SNORD15A-201ENST00000384214 148 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 LINC01505-201ENST00000411451 686 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 PSMA4-202ENST00000413382 1019 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 AL358942.1-201ENST00000418595 1178 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 AC064875.1-203ENST00000422996 582 ntTSL 4 BASIC7.39□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 LINC01707-201ENST00000425517 627 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 MTCYBP6-201ENST00000441810 138 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 OR51P1P-201ENST00000447547 942 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 AC007557.1-201ENST00000451711 541 ntTSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 AC073476.1-201ENST00000452854 407 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 LINC00533-201ENST00000456103 537 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 AL035443.1-201ENST00000456631 304 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 RN7SL791P-201ENST00000467868 295 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 ZBTB20-AS2-201ENST00000478301 372 ntTSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
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