Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 RN7SL199P-201ENST00000578752 281 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 RN7SL656P-201ENST00000579044 281 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 AC015818.3-202ENST00000579603 283 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 RN7SL404P-201ENST00000582421 281 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 AL133247.2-201ENST00000603236 482 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 AL139407.1-201ENST00000613826 1175 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 BMS1P14-201ENST00000615056 606 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 AL591926.1-201ENST00000620542 217 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 AC012653.2-201ENST00000621880 420 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 LINC00836-201ENST00000625325 582 ntTSL 4 BASIC6.16□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 CASC22-202ENST00000628396 802 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 SNORA16A-202ENST00000628458 135 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 MIR1910-201ENST00000636955 80 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 OR5AC4P-202ENST00000642086 985 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 ASNSP1-201ENST00000518311 1939 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 PPP1R1C-201ENST00000280295 1636 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 ZNF192P1-201ENST00000440790 1628 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 ZEB2-AS1-202ENST00000427278 1322 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 CCDC158-201ENST00000388914 3663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 SEC31A-207ENST00000443462 4042 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 CALN1-203ENST00000395276 9189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 USP50-203ENST00000532404 1386 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 AC096656.1-201ENST00000623826 1364 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 MBNL2-203ENST00000376673 4632 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 IPO8-209ENST00000544829 3212 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 ATP13A4-204ENST00000400270 1458 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 AL391261.1-201ENST00000555712 1479 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 CASC11-201ENST00000502463 3301 ntTSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 AF064860.2-201ENST00000457325 1542 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 AC102941.1-201ENST00000567616 1537 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 ECHDC1-210ENST00000454859 2341 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 PDE4B-201ENST00000329654 3998 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 NLN-202ENST00000502464 8354 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 OR2L5-201ENST00000355281 2429 ntAPPRIS P1 BASIC6.15□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 LINC01415-201ENST00000587320 4071 ntTSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 ZBTB38-202ENST00000441582 3662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 LINC01920-201ENST00000441356 2528 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 OR8K1-201ENST00000279783 1087 ntAPPRIS P1 BASIC6.15□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 RNU1-65P-201ENST00000363919 148 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 CFHR2-201ENST00000367415 1059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 PKIB-203ENST00000368446 556 ntTSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 IGKV3-7-201ENST00000390247 445 ntAPPRIS P1 BASIC6.15□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 RNA5SP176-201ENST00000390956 110 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 EMX2OS-201ENST00000412075 1025 ntTSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 NUCB1-AS1-201ENST00000416432 433 ntTSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 LINC00701-201ENST00000418295 742 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 AC048351.1-201ENST00000420064 602 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 AL139184.1-202ENST00000422303 222 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 PTPN2P1-201ENST00000423212 1072 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 AL596268.1-201ENST00000427910 1048 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 AC096677.2-201ENST00000430471 598 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 GAPDHP19-201ENST00000431768 1005 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 NDUFA5P10-201ENST00000432147 357 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 MYL6P3-201ENST00000436904 432 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 LINC01681-201ENST00000439184 760 ntTSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 H3F3BP1-201ENST00000440551 403 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 FMR1-IT1-201ENST00000441414 343 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 LINC00867-203ENST00000445161 580 ntTSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 VN1R38P-201ENST00000450265 887 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 AC068522.1-201ENST00000482895 345 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 CDH12P2-201ENST00000504393 298 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 LINC02039-201ENST00000507428 566 ntTSL 4 BASIC6.15□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 FGB-207ENST00000509493 1164 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 AC114284.1-201ENST00000511422 1114 ntTSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 IGKV2-19-201ENST00000518132 283 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 POLR2K-203ENST00000522439 543 ntTSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 COG2-209ENST00000534989 2963 ntTSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 AC006065.4-204ENST00000537478 654 ntTSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 VEPH1-219ENST00000537559 992 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 AC006065.4-203ENST00000541065 526 ntTSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.42
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FOXD4Q12950 AC008083.2-201ENST00000546707 476 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 FLVCR2-204ENST00000553587 584 ntTSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 C14orf119-202ENST00000554203 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.42
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FOXD4Q12950 AC013652.1-204ENST00000558209 489 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 CYCSP38-201ENST00000559840 322 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 AC026462.4-201ENST00000565229 951 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 AC134669.1-201ENST00000581275 672 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 ZNF137P-202ENST00000597158 308 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 PSMA6P4-201ENST00000603247 718 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 AC007423.1-201ENST00000605009 627 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 AL023583.1-201ENST00000607518 1143 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 ERC2-214ENST00000612797 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 EDRF1-AS1-210ENST00000613304 569 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 MIR6071-201ENST00000616741 78 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 AC074276.2-201ENST00000619891 348 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 AC244517.6-202ENST00000623884 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.15□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 AC020923.1-201ENST00000624021 917 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 AL683826.1-201ENST00000624104 627 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 AP000577.1-201ENST00000624366 878 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 SNX18P10-201ENST00000625014 519 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 AL139220.2-221ENST00000628123 395 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 TOR1AIP2-206ENST00000609928 4364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.43
FOXD4Q12950 TTTY4B-201ENST00000420149 1346 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
FOXD4Q12950 TTTY4-201ENST00000436568 1346 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
FOXD4Q12950 ZNF761-203ENST00000454407 3967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.43
FOXD4Q12950 TTTY4C-201ENST00000456123 1346 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
FOXD4Q12950 CRISP1-204ENST00000507853 1793 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
FOXD4Q12950 SCN1A-203ENST00000409050 5946 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.43
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