Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2I5

IFFO1, Intermediate filament family orphan 1, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFFO1Q0D2I5 IFI16-205ENST00000368132 2704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
IFFO1Q0D2I5 PTBP3-207ENST00000458258 7995 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
IFFO1Q0D2I5 PLCB1-210ENST00000612075 6576 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
IFFO1Q0D2I5 USP45-204ENST00000369233 2514 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
IFFO1Q0D2I5 AC104260.2-201ENST00000623551 3497 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
IFFO1Q0D2I5 GNG2-212ENST00000556752 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
IFFO1Q0D2I5 AL356479.1-203ENST00000411798 1440 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
IFFO1Q0D2I5 C11orf1-203ENST00000529270 1437 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
IFFO1Q0D2I5 OBSCN-205ENST00000422127 24060 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
IFFO1Q0D2I5 ANKS1B-216ENST00000549558 2268 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
IFFO1Q0D2I5 FAM46D-202ENST00000538312 3106 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
IFFO1Q0D2I5 UQCRC2P1-201ENST00000417777 1332 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
IFFO1Q0D2I5 GNL2P1-201ENST00000451274 2190 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
IFFO1Q0D2I5 AL121886.1-201ENST00000358609 435 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
IFFO1Q0D2I5 RNU1-134P-201ENST00000362935 165 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
IFFO1Q0D2I5 IFNB1-201ENST00000380232 859 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
IFFO1Q0D2I5 AC096921.1-201ENST00000411661 375 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
IFFO1Q0D2I5 AL138479.1-201ENST00000426913 484 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
IFFO1Q0D2I5 HSPE1P27-201ENST00000430808 296 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
IFFO1Q0D2I5 AC022387.1-201ENST00000444770 794 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
IFFO1Q0D2I5 AC012512.1-201ENST00000446594 718 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
IFFO1Q0D2I5 OR7E116P-201ENST00000448529 957 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
IFFO1Q0D2I5 RPS17P5-201ENST00000498293 408 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
IFFO1Q0D2I5 AC104779.1-201ENST00000503557 441 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
IFFO1Q0D2I5 AL133240.1-201ENST00000553537 580 ntTSL 4 BASIC5.85□□□□□ -1.47
IFFO1Q0D2I5 THSD4-AS1-201ENST00000561571 554 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
IFFO1Q0D2I5 AC013640.1-201ENST00000565366 565 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
IFFO1Q0D2I5 NIFKP4-201ENST00000567275 1192 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
IFFO1Q0D2I5 ZNF174-204ENST00000572544 1002 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
IFFO1Q0D2I5 AC114488.2-207ENST00000585660 700 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
IFFO1Q0D2I5 AC020909.2-201ENST00000595005 626 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
IFFO1Q0D2I5 AC099777.1-201ENST00000603779 1070 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
IFFO1Q0D2I5 WDR11-AS1-204ENST00000608667 522 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
IFFO1Q0D2I5 AC004839.1-201ENST00000610269 501 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
IFFO1Q0D2I5 Metazoa_SRP.195-201ENST00000612667 287 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
IFFO1Q0D2I5 AL021918.2-201ENST00000613415 194 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
IFFO1Q0D2I5 SAMMSON-227ENST00000642114 1199 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
IFFO1Q0D2I5 OR4F13P-202ENST00000560066 2054 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
IFFO1Q0D2I5 PCDH15-209ENST00000395433 6942 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
IFFO1Q0D2I5 ANO6-205ENST00000441606 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
IFFO1Q0D2I5 VPS13D-214ENST00000620676 16320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
IFFO1Q0D2I5 ADGRL2-209ENST00000370727 5164 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
IFFO1Q0D2I5 SMNDC1-202ENST00000369603 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
IFFO1Q0D2I5 CEP85L-201ENST00000360290 1736 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
IFFO1Q0D2I5 ADGRL2-206ENST00000370721 5023 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
IFFO1Q0D2I5 SNW1-204ENST00000554775 1687 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
IFFO1Q0D2I5 GPR87-201ENST00000260843 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
IFFO1Q0D2I5 HOXD8-202ENST00000429017 1608 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
IFFO1Q0D2I5 BCLAF1-201ENST00000353331 7110 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
IFFO1Q0D2I5 LINC01923-203ENST00000456248 2528 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
IFFO1Q0D2I5 SYTL2-204ENST00000389958 1943 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
IFFO1Q0D2I5 AC015971.1-203ENST00000426549 1948 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
IFFO1Q0D2I5 ORC4-215ENST00000536575 6328 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
IFFO1Q0D2I5 Y_RNA.209-201ENST00000364156 111 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
IFFO1Q0D2I5 RNA5SP77-201ENST00000365394 120 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
IFFO1Q0D2I5 FTH1P26-201ENST00000406512 701 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
IFFO1Q0D2I5 MIR1266-201ENST00000408125 84 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
IFFO1Q0D2I5 OR52N3P-201ENST00000413417 934 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
IFFO1Q0D2I5 AL160004.1-201ENST00000434311 478 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
IFFO1Q0D2I5 AL355472.1-201ENST00000451795 575 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
IFFO1Q0D2I5 OSTC-204ENST00000512478 663 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
IFFO1Q0D2I5 CR383658.1-201ENST00000514609 734 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
IFFO1Q0D2I5 AC083973.1-201ENST00000523459 590 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
IFFO1Q0D2I5 KCTD21-AS1-203ENST00000527321 586 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
IFFO1Q0D2I5 LRTOMT-217ENST00000539587 428 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
IFFO1Q0D2I5 LINC00944-202ENST00000540684 888 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
IFFO1Q0D2I5 LRTOMT-218ENST00000541614 726 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
IFFO1Q0D2I5 TDGP1-201ENST00000543961 1229 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
IFFO1Q0D2I5 AL157871.6-201ENST00000553954 206 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
IFFO1Q0D2I5 AP005136.2-201ENST00000583253 1049 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
IFFO1Q0D2I5 MIR3936-201ENST00000584304 110 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
IFFO1Q0D2I5 AC092067.1-201ENST00000592929 488 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
IFFO1Q0D2I5 AC020915.3-201ENST00000595301 550 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
IFFO1Q0D2I5 AC145423.1-201ENST00000605712 336 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
IFFO1Q0D2I5 RPSAP75-201ENST00000605848 301 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
IFFO1Q0D2I5 AC068726.1-201ENST00000610993 341 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
IFFO1Q0D2I5 MIR6726-201ENST00000613751 61 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
IFFO1Q0D2I5 AL139099.4-201ENST00000614802 114 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
IFFO1Q0D2I5 IKZF2-201ENST00000342002 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
IFFO1Q0D2I5 CDK15-204ENST00000450471 3659 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
IFFO1Q0D2I5 OR6C4-203ENST00000641851 4989 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
IFFO1Q0D2I5 NBPF14-206ENST00000614999 10080 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
IFFO1Q0D2I5 RAB18-209ENST00000621805 4894 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
IFFO1Q0D2I5 INTU-201ENST00000335251 13233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
IFFO1Q0D2I5 TRPC4-203ENST00000358477 2955 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
IFFO1Q0D2I5 PIGK-203ENST00000445065 4318 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
IFFO1Q0D2I5 RASSF8-201ENST00000282884 1994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.48
IFFO1Q0D2I5 TJP1-209ENST00000545208 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.48
IFFO1Q0D2I5 KIAA0408-204ENST00000483725 3284 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.48
IFFO1Q0D2I5 ROS1-201ENST00000368507 7417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
IFFO1Q0D2I5 AC079097.1-201ENST00000512187 1399 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
IFFO1Q0D2I5 AC008079.2-201ENST00000623543 20396 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
IFFO1Q0D2I5 ATP5A1P1-201ENST00000454088 1321 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
IFFO1Q0D2I5 AC005261.2-201ENST00000593427 4258 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
IFFO1Q0D2I5 TAS2R16-201ENST00000249284 997 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
IFFO1Q0D2I5 OR4N2-201ENST00000315947 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
IFFO1Q0D2I5 CTSL3P-202ENST00000412179 788 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
IFFO1Q0D2I5 RPS14P4-201ENST00000415880 418 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
IFFO1Q0D2I5 LINC02246-202ENST00000418954 717 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
IFFO1Q0D2I5 THEM7P-201ENST00000419556 672 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
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