Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 RSU1P1-201ENST00000453416 441 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
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PGGT1BP53609 LINC01611-203ENST00000454981 504 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
PGGT1BP53609 AC093166.4-201ENST00000457867 318 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
PGGT1BP53609 RN7SL254P-201ENST00000460609 284 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
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PGGT1BP53609 AC008957.1-203ENST00000508745 589 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
PGGT1BP53609 AC020551.1-201ENST00000512036 539 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
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PGGT1BP53609 AC008601.1-201ENST00000519892 527 ntTSL 4 BASIC5.81□□□□□ -1.48
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PGGT1BP53609 LAMA2-201ENST00000421865 9640 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
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PGGT1BP53609 AC139426.3-201ENST00000605648 2059 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
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PGGT1BP53609 SLC7A11-201ENST00000280612 9645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
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PGGT1BP53609 USP15-201ENST00000280377 4748 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
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PGGT1BP53609 GTDC1-201ENST00000241391 2356 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
PGGT1BP53609 SDAD1-203ENST00000395711 2513 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
PGGT1BP53609 AC006600.2-201ENST00000624834 2506 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
PGGT1BP53609 PAK3-201ENST00000262836 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
PGGT1BP53609 PAK3-205ENST00000417227 2196 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
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