Protein–RNA interactions for Protein: P31271

HOXA13, Homeobox protein Hox-A13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 388 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA13P31271 AC112211.1-201ENST00000607832 305 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
HOXA13P31271 AC069234.4-201ENST00000621276 412 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
HOXA13P31271 CU638689.1-201ENST00000623225 897 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
HOXA13P31271 CU634019.4-201ENST00000623347 897 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
HOXA13P31271 OR51Q1-202ENST00000641085 1096 ntAPPRIS P1 BASIC6.59□□□□□ -1.35
HOXA13P31271 POGZ-213ENST00000491586 4130 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
HOXA13P31271 LINC00906-206ENST00000589921 3444 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
HOXA13P31271 PLCXD3-202ENST00000377801 7704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
HOXA13P31271 ZNF271P-205ENST00000639248 4573 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
HOXA13P31271 HORMAD2-202ENST00000403975 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
HOXA13P31271 CLSPN-202ENST00000318121 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
HOXA13P31271 CLVS1-203ENST00000518592 2880 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.36
HOXA13P31271 ENPP3-203ENST00000414305 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.36
HOXA13P31271 GNG2-212ENST00000556752 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.36
HOXA13P31271 MAPK10-366ENST00000641903 2812 ntAPPRIS ALT1 BASIC6.58□□□□□ -1.36
HOXA13P31271 CDK14-206ENST00000436577 4787 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
HOXA13P31271 GRIA4-204ENST00000428631 2778 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
HOXA13P31271 TRIQK-206ENST00000518748 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
HOXA13P31271 IQCM-206ENST00000636793 1900 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
HOXA13P31271 MFSD8-239ENST00000641590 2479 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
HOXA13P31271 TOPBP1-201ENST00000260810 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
HOXA13P31271 CTAGE5-217ENST00000557038 2869 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
HOXA13P31271 TCF7L2-219ENST00000542695 4136 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
HOXA13P31271 PTBP3-207ENST00000458258 7995 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
HOXA13P31271 OR10D3-201ENST00000318666 1030 ntAPPRIS P1 BASIC6.58□□□□□ -1.36
HOXA13P31271 RNA5-8SP5-201ENST00000365304 152 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
HOXA13P31271 U3.25-201ENST00000391209 220 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
HOXA13P31271 RN7SKP229-201ENST00000410465 302 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
HOXA13P31271 RMRPP5-201ENST00000411156 267 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
HOXA13P31271 OR2AT2P-201ENST00000413438 905 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
HOXA13P31271 LINC02518-201ENST00000421737 524 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
HOXA13P31271 AC019205.1-201ENST00000421830 730 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
HOXA13P31271 AC107057.1-201ENST00000425763 319 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
HOXA13P31271 AC074011.1-201ENST00000431376 581 ntTSL 4 BASIC6.58□□□□□ -1.36
HOXA13P31271 AC004990.1-201ENST00000431722 564 ntTSL 4 BASIC6.58□□□□□ -1.36
HOXA13P31271 Z84478.1-201ENST00000438230 1219 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
HOXA13P31271 DNAJC19P5-201ENST00000443295 316 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
HOXA13P31271 AF015262.1-201ENST00000455028 698 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
HOXA13P31271 RN7SL72P-201ENST00000460697 269 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
HOXA13P31271 AP002371.1-201ENST00000463604 433 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
HOXA13P31271 AC093719.1-201ENST00000480427 441 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
HOXA13P31271 TRBV5-2-201ENST00000489095 273 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
HOXA13P31271 AC117386.2-203ENST00000489690 557 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
HOXA13P31271 AC094108.1-201ENST00000502494 527 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
HOXA13P31271 SSX6-203ENST00000509958 336 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
HOXA13P31271 AC034238.3-201ENST00000512349 591 ntTSL 4 BASIC6.58□□□□□ -1.36
HOXA13P31271 RRM2B-206ENST00000519317 420 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
HOXA13P31271 PPP1R42-212ENST00000522909 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
HOXA13P31271 VEPH1-219ENST00000537559 992 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
HOXA13P31271 AC005692.2-201ENST00000566521 596 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
HOXA13P31271 AC021549.1-201ENST00000580937 433 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
HOXA13P31271 AC063977.5-201ENST00000601044 974 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
HOXA13P31271 ASNSD1-209ENST00000607829 581 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
HOXA13P31271 AL049767.1-202ENST00000637826 242 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
HOXA13P31271 PSG7-201ENST00000406070 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
HOXA13P31271 MOB1B-201ENST00000309395 6963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
HOXA13P31271 CHRM3-AS2-201ENST00000427859 2431 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
HOXA13P31271 ATP6V1A-201ENST00000273398 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
HOXA13P31271 ZNF300P1-202ENST00000520773 3115 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
HOXA13P31271 TRIM38-201ENST00000357085 9413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
HOXA13P31271 FILIP1L-201ENST00000331335 4219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
HOXA13P31271 ZNF440-201ENST00000304060 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
HOXA13P31271 SLC16A6-201ENST00000327268 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
HOXA13P31271 CARD6-201ENST00000254691 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
HOXA13P31271 DDX6-208ENST00000620157 6152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
HOXA13P31271 ADTRP-201ENST00000229583 891 ntTSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
HOXA13P31271 APOOL-201ENST00000373173 1279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
HOXA13P31271 STMN1-202ENST00000374291 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
HOXA13P31271 OR6E1P-201ENST00000414424 923 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
HOXA13P31271 AL139008.2-201ENST00000420315 395 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
HOXA13P31271 RFESDP1-201ENST00000422350 461 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
HOXA13P31271 AL157834.1-201ENST00000422744 420 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
HOXA13P31271 AL391097.2-201ENST00000435057 485 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
HOXA13P31271 RPS3AP38-201ENST00000435889 763 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
HOXA13P31271 UBE2L5P-201ENST00000436446 465 ntAPPRIS P1 BASIC6.57□□□□□ -1.36
HOXA13P31271 AC005297.1-201ENST00000444765 862 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
HOXA13P31271 LINC01765-201ENST00000448680 491 ntTSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
HOXA13P31271 OSTCP1-201ENST00000455507 450 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
HOXA13P31271 ATP5J-207ENST00000457143 589 ntTSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
HOXA13P31271 AC018793.4-201ENST00000524542 585 ntAPPRIS P1 BASIC6.57□□□□□ -1.36
HOXA13P31271 LINC02412-201ENST00000552584 1269 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
HOXA13P31271 AC130650.1-201ENST00000570581 415 ntTSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
HOXA13P31271 FO393422.1-201ENST00000603908 708 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
HOXA13P31271 AC104695.2-201ENST00000605056 775 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
HOXA13P31271 Z98949.1-207ENST00000609157 814 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
HOXA13P31271 AC079298.3-203ENST00000623269 555 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
HOXA13P31271 MVP-219ENST00000629059 120 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
HOXA13P31271 AC018793.1-201ENST00000638166 585 ntAPPRIS P1 BASIC6.57□□□□□ -1.36
HOXA13P31271 AC018793.2-201ENST00000639584 585 ntAPPRIS P1 BASIC6.57□□□□□ -1.36
HOXA13P31271 AC018793.3-201ENST00000640805 585 ntAPPRIS P1 BASIC6.57□□□□□ -1.36
HOXA13P31271 TET1P1-201ENST00000426627 2301 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
HOXA13P31271 SLAMF6-202ENST00000368057 2712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
HOXA13P31271 CSNK1G1-204ENST00000606793 1658 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
HOXA13P31271 ZNF630-202ENST00000409324 2455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
HOXA13P31271 ASAH1-232ENST00000636691 2472 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
HOXA13P31271 CAPN6-201ENST00000324068 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
HOXA13P31271 AC068389.1-202ENST00000526470 3564 ntTSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
HOXA13P31271 SLC7A11-201ENST00000280612 9645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
HOXA13P31271 CDH13-209ENST00000567109 8042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
HOXA13P31271 ZNF160-203ENST00000429604 4336 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
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