Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 701 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 CD52-201ENST00000374213 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-1257P-201ENST00000384625 110 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
SH3BP1Q9Y3L3 RNY3P9-201ENST00000384727 106 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
SH3BP1Q9Y3L3 AC003045.1-201ENST00000398779 713 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
SH3BP1Q9Y3L3 AC117944.1-201ENST00000430748 641 ntTSL 3 BASIC6.77□□□□□ -1.33
SH3BP1Q9Y3L3 AL592146.1-201ENST00000433869 1126 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
SH3BP1Q9Y3L3 AP006216.1-201ENST00000439104 419 ntTSL 3 BASIC6.77□□□□□ -1.33
SH3BP1Q9Y3L3 MTND2P22-201ENST00000444325 1033 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
SH3BP1Q9Y3L3 RPS26P41-201ENST00000450370 284 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
SH3BP1Q9Y3L3 MTND2P6-201ENST00000455337 1030 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
SH3BP1Q9Y3L3 RN7SL72P-201ENST00000460697 269 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
SH3BP1Q9Y3L3 GLYCTK-AS1-202ENST00000472761 109 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
SH3BP1Q9Y3L3 RPL5P14-201ENST00000494197 878 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
SH3BP1Q9Y3L3 AC023794.2-201ENST00000504891 528 ntTSL 3 BASIC6.77□□□□□ -1.33
SH3BP1Q9Y3L3 AC018645.1-201ENST00000505003 109 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
SH3BP1Q9Y3L3 LINC01093-201ENST00000506479 634 ntTSL 3 BASIC6.77□□□□□ -1.33
SH3BP1Q9Y3L3 LINC02201-201ENST00000508992 468 ntTSL 2 BASIC6.77□□□□□ -1.33
SH3BP1Q9Y3L3 AC012055.1-201ENST00000511346 1144 ntTSL 3 BASIC6.77□□□□□ -1.33
SH3BP1Q9Y3L3 Vault.2-201ENST00000516519 98 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
SH3BP1Q9Y3L3 RN7SKP287-201ENST00000516546 266 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
SH3BP1Q9Y3L3 AC027117.1-201ENST00000520646 667 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
SH3BP1Q9Y3L3 CYCSP25-201ENST00000525280 316 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
SH3BP1Q9Y3L3 DEFB134-202ENST00000526438 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
SH3BP1Q9Y3L3 AP001978.1-201ENST00000526851 834 ntTSL 2 BASIC6.77□□□□□ -1.33
SH3BP1Q9Y3L3 AC011853.2-201ENST00000526901 774 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
SH3BP1Q9Y3L3 MYL2-203ENST00000548438 664 ntTSL 3 BASIC6.77□□□□□ -1.33
SH3BP1Q9Y3L3 AL109741.3-201ENST00000561748 592 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
SH3BP1Q9Y3L3 AC009139.2-201ENST00000569032 566 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
SH3BP1Q9Y3L3 AP003774.2-201ENST00000569737 558 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
SH3BP1Q9Y3L3 AC007786.1-202ENST00000590607 443 ntTSL 3 BASIC6.77□□□□□ -1.33
SH3BP1Q9Y3L3 Z98949.1-228ENST00000595093 798 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
SH3BP1Q9Y3L3 BUB1P1-201ENST00000603541 607 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
SH3BP1Q9Y3L3 AC239809.3-208ENST00000611452 531 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
SH3BP1Q9Y3L3 AC018926.1-201ENST00000616335 435 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
SH3BP1Q9Y3L3 CNTNAP3P1-201ENST00000616657 906 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
SH3BP1Q9Y3L3 U6.48-201ENST00000618523 106 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
SH3BP1Q9Y3L3 AC026422.1-201ENST00000623961 452 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
SH3BP1Q9Y3L3 CHRM3-AS2-209ENST00000628573 766 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
SH3BP1Q9Y3L3 AP003399.1-201ENST00000637534 361 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
SH3BP1Q9Y3L3 STIL-203ENST00000371877 5009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF337-AS1-201ENST00000414393 4666 ntTSL 2 BASIC6.77□□□□□ -1.33
SH3BP1Q9Y3L3 CFI-205ENST00000512148 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
SH3BP1Q9Y3L3 LINC00598-211ENST00000636621 3241 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF813-201ENST00000396403 6151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.77□□□□□ -1.33
SH3BP1Q9Y3L3 TTI1-202ENST00000373448 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
SH3BP1Q9Y3L3 AC079601.1-201ENST00000547824 2791 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
SH3BP1Q9Y3L3 TRPC1-205ENST00000612385 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
SH3BP1Q9Y3L3 AC019197.1-201ENST00000638199 3611 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
SH3BP1Q9Y3L3 PDE4D-226ENST00000546160 7690 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
SH3BP1Q9Y3L3 SRBD1-201ENST00000263736 3681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
SH3BP1Q9Y3L3 AC109811.1-201ENST00000512833 2807 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
SH3BP1Q9Y3L3 MUT-201ENST00000274813 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
SH3BP1Q9Y3L3 OR8H3-201ENST00000313472 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.76□□□□□ -1.33
SH3BP1Q9Y3L3 RPL11P4-201ENST00000332269 436 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
SH3BP1Q9Y3L3 PCYT1B-201ENST00000356768 1289 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
SH3BP1Q9Y3L3 DEFB126-201ENST00000382398 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
SH3BP1Q9Y3L3 RNU11-201ENST00000387069 134 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
SH3BP1Q9Y3L3 CFHR3-203ENST00000391985 1043 ntTSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
SH3BP1Q9Y3L3 AC234781.4-201ENST00000419384 244 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
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SH3BP1Q9Y3L3 AC005772.1-201ENST00000446671 976 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
SH3BP1Q9Y3L3 RARRES2P3-201ENST00000457739 473 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
SH3BP1Q9Y3L3 CTSLP6-201ENST00000458273 1002 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
SH3BP1Q9Y3L3 AC104629.2-201ENST00000468627 598 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
SH3BP1Q9Y3L3 METTL15P1-201ENST00000481421 1045 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
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SH3BP1Q9Y3L3 CREM-242ENST00000490511 469 ntTSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
SH3BP1Q9Y3L3 MTCO2P9-201ENST00000503214 694 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
SH3BP1Q9Y3L3 AC010627.1-201ENST00000503819 1294 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
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SH3BP1Q9Y3L3 AP002954.1-201ENST00000526274 425 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
SH3BP1Q9Y3L3 RERGL-202ENST00000536890 367 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
SH3BP1Q9Y3L3 PRH1-204ENST00000539853 837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
SH3BP1Q9Y3L3 ZKSCAN7P1-201ENST00000543668 673 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
SH3BP1Q9Y3L3 AC078922.1-201ENST00000547547 434 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
SH3BP1Q9Y3L3 LINC02394-201ENST00000549140 543 ntTSL 4 BASIC6.76□□□□□ -1.33
SH3BP1Q9Y3L3 AC138123.2-201ENST00000550324 579 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
SH3BP1Q9Y3L3 AL139021.2-201ENST00000556390 399 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
SH3BP1Q9Y3L3 AC087721.1-201ENST00000559959 476 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
SH3BP1Q9Y3L3 MTCYBP28-201ENST00000566728 1132 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
SH3BP1Q9Y3L3 AC016180.1-201ENST00000567945 403 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
SH3BP1Q9Y3L3 PPIAL4A-201ENST00000577856 660 ntAPPRIS P1 BASIC6.76□□□□□ -1.33
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SH3BP1Q9Y3L3 AL360012.1-201ENST00000602813 131 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
SH3BP1Q9Y3L3 AC093424.1-201ENST00000604999 338 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
SH3BP1Q9Y3L3 Z99289.3-201ENST00000605586 594 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
SH3BP1Q9Y3L3 AC097717.1-250ENST00000608498 273 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
SH3BP1Q9Y3L3 AL121652.1-201ENST00000608851 448 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
SH3BP1Q9Y3L3 Metazoa_SRP.170-201ENST00000616060 254 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
SH3BP1Q9Y3L3 CC2D2B-209ENST00000618242 980 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
SH3BP1Q9Y3L3 AC073592.6-201ENST00000624271 415 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
SH3BP1Q9Y3L3 TTN-AS1-268ENST00000629094 604 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
SH3BP1Q9Y3L3 AC132825.8-201ENST00000640783 297 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
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