Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI33

SCN11A, Sodium channel protein type 11 subunit alpha, humanhuman

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Length 1,791 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN11AQ9UI33 CENPW-203ENST00000368328 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
SCN11AQ9UI33 OR4K12P-201ENST00000406538 961 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
SCN11AQ9UI33 RPS27P18-201ENST00000431701 247 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
SCN11AQ9UI33 AL049649.1-201ENST00000444792 1105 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
SCN11AQ9UI33 EEF1B2P5-201ENST00000444820 548 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
SCN11AQ9UI33 AP001604.1-201ENST00000447384 954 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
SCN11AQ9UI33 MEMO1P4-201ENST00000453590 386 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
SCN11AQ9UI33 FTH1P2-201ENST00000466086 412 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
SCN11AQ9UI33 GIMAP2-202ENST00000474605 309 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
SCN11AQ9UI33 EIF1P7-201ENST00000487533 337 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
SCN11AQ9UI33 LINC02039-201ENST00000507428 566 ntTSL 4 BASIC7.22□□□□□ -1.25
SCN11AQ9UI33 CREBZF-209ENST00000534224 545 ntTSL 4 BASIC7.22□□□□□ -1.25
SCN11AQ9UI33 AC069307.1-201ENST00000602820 447 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
SCN11AQ9UI33 DAOA-212ENST00000640578 378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
SCN11AQ9UI33 Z82209.2-201ENST00000623410 2012 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
SCN11AQ9UI33 TRPC1-205ENST00000612385 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
SCN11AQ9UI33 CORIN-201ENST00000273857 4852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
SCN11AQ9UI33 LMO3-202ENST00000320122 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
SCN11AQ9UI33 OR9Q2-202ENST00000641291 3774 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
SCN11AQ9UI33 AC022819.1-201ENST00000563495 3910 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
SCN11AQ9UI33 AP4E1-203ENST00000560508 6653 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
SCN11AQ9UI33 CELF2-203ENST00000416382 6894 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
SCN11AQ9UI33 SLC23A2-202ENST00000379333 6962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
SCN11AQ9UI33 MAGI2-205ENST00000519748 3316 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
SCN11AQ9UI33 CDYL2-207ENST00000570137 8159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
SCN11AQ9UI33 HSDL2-201ENST00000398803 2983 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
SCN11AQ9UI33 SNORA56-201ENST00000383966 129 ntBASIC7.21□□□□□ -1.25
SCN11AQ9UI33 MIR223-201ENST00000385204 110 ntBASIC7.21□□□□□ -1.25
SCN11AQ9UI33 AL645927.1-201ENST00000396783 406 ntBASIC7.21□□□□□ -1.25
SCN11AQ9UI33 AC096711.3-201ENST00000420721 582 ntTSL 4 BASIC7.21□□□□□ -1.25
SCN11AQ9UI33 LINC01798-203ENST00000428590 553 ntTSL 4 BASIC7.21□□□□□ -1.25
SCN11AQ9UI33 LINC02257-202ENST00000433576 720 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.25
SCN11AQ9UI33 NANOGP9-201ENST00000439890 892 ntBASIC7.21□□□□□ -1.25
SCN11AQ9UI33 CBX1P5-201ENST00000475330 559 ntBASIC7.21□□□□□ -1.25
SCN11AQ9UI33 AC008448.1-201ENST00000505109 584 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.25
SCN11AQ9UI33 RNU6-941P-201ENST00000516346 108 ntBASIC7.21□□□□□ -1.25
SCN11AQ9UI33 AC009623.1-201ENST00000517964 1131 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.25
SCN11AQ9UI33 AF181450.1-201ENST00000522980 410 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.25
SCN11AQ9UI33 AP003501.1-201ENST00000524453 744 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.25
SCN11AQ9UI33 HIGD1AP5-201ENST00000529959 259 ntBASIC7.21□□□□□ -1.25
SCN11AQ9UI33 OR7G1-201ENST00000541538 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.21□□□□□ -1.25
SCN11AQ9UI33 LINC02310-201ENST00000556762 572 ntTSL 4 BASIC7.21□□□□□ -1.25
SCN11AQ9UI33 AC015845.1-202ENST00000580184 242 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.25
SCN11AQ9UI33 AC006504.7-201ENST00000592806 924 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.25
SCN11AQ9UI33 ZNF649-AS1-201ENST00000600329 579 ntTSL 4 BASIC7.21□□□□□ -1.25
SCN11AQ9UI33 AC002128.2-201ENST00000604161 618 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.25
SCN11AQ9UI33 CIITA-201ENST00000324288 11952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
SCN11AQ9UI33 ZNF724-201ENST00000418100 2764 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
SCN11AQ9UI33 TRIM6-205ENST00000445329 2951 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
SCN11AQ9UI33 AC140479.2-201ENST00000421567 3130 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
SCN11AQ9UI33 PROM1-201ENST00000447510 3977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
SCN11AQ9UI33 YOD1-202ENST00000367084 6291 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
SCN11AQ9UI33 SLC25A40-201ENST00000341119 4045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
SCN11AQ9UI33 VCAN-202ENST00000342785 7154 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
SCN11AQ9UI33 LNX2-201ENST00000316334 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
SCN11AQ9UI33 C1orf27-201ENST00000287859 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
SCN11AQ9UI33 PLCZ1-201ENST00000266505 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
SCN11AQ9UI33 TMBIM4-201ENST00000286424 989 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
SCN11AQ9UI33 VEGFD-201ENST00000297904 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
SCN11AQ9UI33 COMMD6-204ENST00000377619 594 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
SCN11AQ9UI33 AC009804.1-201ENST00000400949 179 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
SCN11AQ9UI33 AC009784.1-201ENST00000426484 460 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
SCN11AQ9UI33 USP24P1-201ENST00000433802 779 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
SCN11AQ9UI33 AC105399.1-202ENST00000447303 205 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
SCN11AQ9UI33 AL512328.1-202ENST00000452640 850 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
SCN11AQ9UI33 AC079896.1-201ENST00000455845 488 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
SCN11AQ9UI33 AC073569.1-201ENST00000548469 667 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
SCN11AQ9UI33 AC022098.3-201ENST00000590715 315 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
SCN11AQ9UI33 TAF1-203ENST00000373790 7629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
SCN11AQ9UI33 AC068389.1-202ENST00000526470 3564 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
SCN11AQ9UI33 ZNF329-203ENST00000597186 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
SCN11AQ9UI33 ZNF365-204ENST00000395251 2695 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
SCN11AQ9UI33 ANKFY1-201ENST00000341657 7418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
SCN11AQ9UI33 RSF1-201ENST00000308488 11550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
SCN11AQ9UI33 FCGR3B-208ENST00000613418 2251 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
SCN11AQ9UI33 OR5AS1-201ENST00000313555 975 ntAPPRIS P1 BASIC7.2□□□□□ -1.26
SCN11AQ9UI33 RNA5SP319-201ENST00000362768 119 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
SCN11AQ9UI33 MIR551A-201ENST00000385042 96 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
SCN11AQ9UI33 SLC35E1P1-201ENST00000419313 864 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
SCN11AQ9UI33 VN1R21P-201ENST00000426703 765 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
SCN11AQ9UI33 AC034228.3-201ENST00000446275 562 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
SCN11AQ9UI33 AL672138.1-201ENST00000450604 1015 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
SCN11AQ9UI33 FTH1P8-201ENST00000498161 514 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
SCN11AQ9UI33 AC078899.1-201ENST00000521432 1185 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
SCN11AQ9UI33 UQCRB-209ENST00000523920 695 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
SCN11AQ9UI33 AC020612.3-201ENST00000550644 570 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
SCN11AQ9UI33 AC092078.1-201ENST00000558370 325 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
SCN11AQ9UI33 RPL10P14-201ENST00000565265 298 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
SCN11AQ9UI33 AC009962.1-201ENST00000567327 3813 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
SCN11AQ9UI33 MIR3691-201ENST00000578066 90 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
SCN11AQ9UI33 AC004448.4-204ENST00000585389 743 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
SCN11AQ9UI33 SLC1A3-215ENST00000612708 3832 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
SCN11AQ9UI33 AC090527.3-201ENST00000619041 548 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
SCN11AQ9UI33 SF3B1-201ENST00000335508 6526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
SCN11AQ9UI33 SIPA1L1-201ENST00000358550 6539 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
SCN11AQ9UI33 HSPD1P7-201ENST00000447985 1686 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
SCN11AQ9UI33 HMMR-203ENST00000393915 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
SCN11AQ9UI33 DAZ2-203ENST00000382424 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
SCN11AQ9UI33 FAM205BP-203ENST00000455647 3752 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
SCN11AQ9UI33 AL139805.2-201ENST00000455305 2433 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
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