Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN3

EHD3, EH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD3Q9NZN3 CLRN1-AS1-201ENST00000465576 2045 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
EHD3Q9NZN3 SLC41A2-201ENST00000258538 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
EHD3Q9NZN3 DDX1-208ENST00000621973 2183 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
EHD3Q9NZN3 PLEKHA5-216ENST00000540972 1954 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
EHD3Q9NZN3 PRKDC-202ENST00000338368 12784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
EHD3Q9NZN3 LINC01415-201ENST00000587320 4071 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
EHD3Q9NZN3 C2CD6-201ENST00000286195 2104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
EHD3Q9NZN3 DGKB-203ENST00000403951 6917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
EHD3Q9NZN3 AC109811.1-201ENST00000512833 2807 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
EHD3Q9NZN3 IFIT1-201ENST00000371804 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
EHD3Q9NZN3 N4BP2L1-209ENST00000530622 1897 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
EHD3Q9NZN3 UGGT1-201ENST00000259253 10650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
EHD3Q9NZN3 AL359976.1-201ENST00000418655 3528 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
EHD3Q9NZN3 DNM1P47-202ENST00000561463 15043 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
EHD3Q9NZN3 ZNF138-206ENST00000440598 2230 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
EHD3Q9NZN3 AC079753.1-201ENST00000623243 3868 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
EHD3Q9NZN3 AL353743.3-201ENST00000442109 1468 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
EHD3Q9NZN3 AC011815.2-201ENST00000618230 2021 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
EHD3Q9NZN3 SLC2A14-203ENST00000431042 3458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
EHD3Q9NZN3 GSTA5-201ENST00000284562 845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
EHD3Q9NZN3 RNA5SP478-201ENST00000364657 115 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
EHD3Q9NZN3 RNU1-84P-201ENST00000365447 164 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
EHD3Q9NZN3 PSMD10-206ENST00000372296 878 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
EHD3Q9NZN3 RFPL3S-201ENST00000382084 1117 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
EHD3Q9NZN3 VIM2P-201ENST00000402383 1294 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
EHD3Q9NZN3 RN7SKP221-201ENST00000410420 301 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
EHD3Q9NZN3 AL138828.1-204ENST00000413745 898 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
EHD3Q9NZN3 MTND4LP21-201ENST00000415303 295 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
EHD3Q9NZN3 AC096644.3-201ENST00000416788 338 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
EHD3Q9NZN3 MRPS21P5-201ENST00000417885 231 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
EHD3Q9NZN3 CYP4F30P-202ENST00000420048 405 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
EHD3Q9NZN3 AC010745.4-201ENST00000420130 740 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
EHD3Q9NZN3 AL157884.1-201ENST00000424561 454 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
EHD3Q9NZN3 ZNF736P7Y-201ENST00000425158 820 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
EHD3Q9NZN3 AL512661.1-201ENST00000434586 1253 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
EHD3Q9NZN3 AL353768.1-201ENST00000439872 487 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
EHD3Q9NZN3 AC079763.1-201ENST00000441295 738 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
EHD3Q9NZN3 AL445991.1-201ENST00000450381 475 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
EHD3Q9NZN3 AL008723.1-201ENST00000452181 590 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
EHD3Q9NZN3 LINC02465-202ENST00000508724 503 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
EHD3Q9NZN3 AC139491.3-201ENST00000509643 684 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
EHD3Q9NZN3 HMGB1P47-201ENST00000511281 589 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
EHD3Q9NZN3 LINC01216-201ENST00000515728 824 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
EHD3Q9NZN3 AC140125.1-201ENST00000515739 684 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
EHD3Q9NZN3 RN7SKP265-201ENST00000516448 223 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
EHD3Q9NZN3 CARD8-211ENST00000519332 500 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
EHD3Q9NZN3 AL133399.1-201ENST00000527476 298 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
EHD3Q9NZN3 AC073864.1-201ENST00000540161 562 ntTSL 4 BASIC6.05□□□□□ -1.44
EHD3Q9NZN3 MIR9-3HG-211ENST00000561037 779 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
EHD3Q9NZN3 AC009120.3-201ENST00000563335 499 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
EHD3Q9NZN3 C16orf97-205ENST00000568524 406 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
EHD3Q9NZN3 MIR212-201ENST00000586026 110 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
EHD3Q9NZN3 AC098935.2-201ENST00000604222 466 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
EHD3Q9NZN3 AC025811.1-201ENST00000604312 472 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
EHD3Q9NZN3 MIR6813-201ENST00000621638 56 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
EHD3Q9NZN3 AC068213.1-201ENST00000625124 226 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
EHD3Q9NZN3 AC007603.3-201ENST00000636915 979 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
EHD3Q9NZN3 GPN1-205ENST00000458167 1618 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
EHD3Q9NZN3 ALMS1-IT1-201ENST00000441587 2107 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
EHD3Q9NZN3 DAOA-AS1-201ENST00000448407 2482 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
EHD3Q9NZN3 MCMDC2-204ENST00000422365 5096 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
EHD3Q9NZN3 TRIP12-204ENST00000389045 5355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
EHD3Q9NZN3 SLC26A5-207ENST00000393729 2422 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
EHD3Q9NZN3 CCDC129-211ENST00000615280 4142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
EHD3Q9NZN3 SERPINB7-202ENST00000398019 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
EHD3Q9NZN3 TLR5-205ENST00000540964 4088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
EHD3Q9NZN3 ANKRD31-203ENST00000506364 6207 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
EHD3Q9NZN3 SEMA5A-AS1-201ENST00000510879 1679 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
EHD3Q9NZN3 PCGF5-204ENST00000543648 7144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
EHD3Q9NZN3 LZTFL1-201ENST00000296135 4073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
EHD3Q9NZN3 TRPC4-201ENST00000338947 2912 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
EHD3Q9NZN3 ARCN1-202ENST00000359415 4038 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
EHD3Q9NZN3 SLC2A14-221ENST00000616981 3366 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
EHD3Q9NZN3 AC084816.1-210ENST00000540895 1920 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
EHD3Q9NZN3 OR1Q1-201ENST00000297913 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.04□□□□□ -1.44
EHD3Q9NZN3 RN7SKP74-201ENST00000362849 309 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
EHD3Q9NZN3 RN7SKP237-201ENST00000364663 301 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
EHD3Q9NZN3 CAV1-204ENST00000393470 598 ntTSL 4 BASIC6.04□□□□□ -1.44
EHD3Q9NZN3 SMARCE1P6-201ENST00000398372 1216 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
EHD3Q9NZN3 CEACAM1-208ENST00000403461 1263 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
EHD3Q9NZN3 RN7SKP281-201ENST00000410472 352 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
EHD3Q9NZN3 UBE2V1P14-201ENST00000415815 558 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
EHD3Q9NZN3 AL031428.1-201ENST00000427154 666 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
EHD3Q9NZN3 MGAT2P2-201ENST00000427194 797 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
EHD3Q9NZN3 BBIP1-205ENST00000436562 383 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
EHD3Q9NZN3 RPL12P49-201ENST00000441100 121 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
EHD3Q9NZN3 AC006326.1-201ENST00000445465 787 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
EHD3Q9NZN3 AC012355.1-201ENST00000450290 769 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
EHD3Q9NZN3 MTND2P8-201ENST00000450555 1025 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
EHD3Q9NZN3 AL590652.1-201ENST00000453790 850 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
EHD3Q9NZN3 AC013549.1-201ENST00000454086 566 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
EHD3Q9NZN3 RN7SL413P-201ENST00000482700 297 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
EHD3Q9NZN3 RN7SL423P-201ENST00000486202 304 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
EHD3Q9NZN3 WDR78-207ENST00000488333 613 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
EHD3Q9NZN3 LINC02025-201ENST00000488348 360 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
EHD3Q9NZN3 RN7SL205P-201ENST00000490174 284 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
EHD3Q9NZN3 AC078785.1-205ENST00000491578 482 ntTSL 4 BASIC6.04□□□□□ -1.44
EHD3Q9NZN3 AC018645.1-201ENST00000505003 109 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
EHD3Q9NZN3 ASNSP4-201ENST00000511103 447 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
EHD3Q9NZN3 AC091979.1-201ENST00000517595 706 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.6 ms