Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZW5

TM6SF1, Transmembrane 6 superfamily member 1, humanhuman

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM6SF1Q9BZW5 TBC1D5-201ENST00000253692 7854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
TM6SF1Q9BZW5 PREPL-216ENST00000541738 6049 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
TM6SF1Q9BZW5 AL049634.1-201ENST00000453770 1720 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
TM6SF1Q9BZW5 AL133284.1-201ENST00000423715 4996 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
TM6SF1Q9BZW5 OSER1-202ENST00000372970 1616 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
TM6SF1Q9BZW5 RPL7-204ENST00000396467 1526 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
TM6SF1Q9BZW5 LINC02477-201ENST00000512652 1417 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
TM6SF1Q9BZW5 ESRRG-208ENST00000391890 5542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
TM6SF1Q9BZW5 AC015799.1-201ENST00000622996 3122 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
TM6SF1Q9BZW5 CD200R1L-204ENST00000488794 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
TM6SF1Q9BZW5 ASB14-201ENST00000389601 3175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
TM6SF1Q9BZW5 SRSF11-202ENST00000370950 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
TM6SF1Q9BZW5 DNHD1-201ENST00000254579 14862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
TM6SF1Q9BZW5 SCAMP1-206ENST00000618166 1358 ntTSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
TM6SF1Q9BZW5 KCNJ1-206ENST00000440599 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
TM6SF1Q9BZW5 RLN1-201ENST00000223862 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
TM6SF1Q9BZW5 USMG5-201ENST00000309579 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
TM6SF1Q9BZW5 RNA5SP30-201ENST00000365552 115 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
TM6SF1Q9BZW5 C9orf153-202ENST00000376001 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
TM6SF1Q9BZW5 CCL8-201ENST00000394620 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
TM6SF1Q9BZW5 OR7E101P-201ENST00000400428 513 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
TM6SF1Q9BZW5 AC099654.1-202ENST00000415836 564 ntTSL 4 BASIC6.74□□□□□ -1.33
TM6SF1Q9BZW5 AK4P4-201ENST00000419465 646 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
TM6SF1Q9BZW5 AL035660.1-201ENST00000422041 222 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
TM6SF1Q9BZW5 AL451047.1-201ENST00000424451 814 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
TM6SF1Q9BZW5 PCBP2P1-201ENST00000437262 977 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
TM6SF1Q9BZW5 AC007327.2-201ENST00000440788 457 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
TM6SF1Q9BZW5 LINC02210-201ENST00000444561 288 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
TM6SF1Q9BZW5 AL596266.1-201ENST00000448132 400 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
TM6SF1Q9BZW5 BIRC6-AS1-201ENST00000455572 697 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
TM6SF1Q9BZW5 ATP5LP5-201ENST00000483050 299 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
TM6SF1Q9BZW5 RPL32P33-201ENST00000487023 394 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
TM6SF1Q9BZW5 AC027343.2-201ENST00000513219 343 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
TM6SF1Q9BZW5 SCARNA6.1-201ENST00000516989 238 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
TM6SF1Q9BZW5 TPPP2-208ENST00000530140 703 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
TM6SF1Q9BZW5 AC069208.1-201ENST00000540811 676 ntTSL 4 BASIC6.74□□□□□ -1.33
TM6SF1Q9BZW5 HSPE1P2-201ENST00000554777 306 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
TM6SF1Q9BZW5 FRMD6-AS2-201ENST00000556617 548 ntTSL 4 BASIC6.74□□□□□ -1.33
TM6SF1Q9BZW5 CASC22-201ENST00000569713 386 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
TM6SF1Q9BZW5 AC016252.1-201ENST00000609721 474 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
TM6SF1Q9BZW5 AC244100.4-201ENST00000617747 388 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
TM6SF1Q9BZW5 ZNF383-201ENST00000352998 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
TM6SF1Q9BZW5 MID1-209ENST00000453318 6393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
TM6SF1Q9BZW5 MTND5P12-201ENST00000502851 1449 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
TM6SF1Q9BZW5 ADH4-207ENST00000505590 1400 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
TM6SF1Q9BZW5 NOX4-214ENST00000532825 2039 ntTSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
TM6SF1Q9BZW5 VPS50-220ENST00000544910 5736 ntTSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
TM6SF1Q9BZW5 MRE11-203ENST00000393241 2604 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
TM6SF1Q9BZW5 RYR3-202ENST00000415757 15557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
TM6SF1Q9BZW5 PNISR-202ENST00000438806 3142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
TM6SF1Q9BZW5 PHC3-217ENST00000497658 2087 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
TM6SF1Q9BZW5 ZRANB3-211ENST00000619650 2494 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
TM6SF1Q9BZW5 YTHDC1-207ENST00000579690 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
TM6SF1Q9BZW5 DNAH3-201ENST00000261383 12394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
TM6SF1Q9BZW5 ANO4-202ENST00000392979 3909 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
TM6SF1Q9BZW5 PREPL-201ENST00000260648 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
TM6SF1Q9BZW5 DBT-201ENST00000370131 1521 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
TM6SF1Q9BZW5 CLEC2D-201ENST00000261339 465 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
TM6SF1Q9BZW5 OR6K2-201ENST00000359610 975 ntAPPRIS P1 BASIC6.73□□□□□ -1.33
TM6SF1Q9BZW5 SUGT1P2-201ENST00000379452 992 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
TM6SF1Q9BZW5 UBE2F-204ENST00000409953 924 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
TM6SF1Q9BZW5 RPS21P8-201ENST00000413365 247 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
TM6SF1Q9BZW5 AC004882.2-201ENST00000420180 244 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
TM6SF1Q9BZW5 OR5W1P-201ENST00000423705 938 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
TM6SF1Q9BZW5 AC004990.1-201ENST00000431722 564 ntTSL 4 BASIC6.73□□□□□ -1.33
TM6SF1Q9BZW5 AC069154.1-201ENST00000432914 542 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
TM6SF1Q9BZW5 NPM1P18-201ENST00000434232 732 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
TM6SF1Q9BZW5 AC108066.1-201ENST00000437261 596 ntTSL 4 BASIC6.73□□□□□ -1.33
TM6SF1Q9BZW5 NANOGP9-201ENST00000439890 892 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
TM6SF1Q9BZW5 AC009963.4-201ENST00000448535 339 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
TM6SF1Q9BZW5 RPS3AP15-201ENST00000483874 781 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
TM6SF1Q9BZW5 IGLV3-24-201ENST00000517477 197 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
TM6SF1Q9BZW5 AC023310.2-201ENST00000553844 547 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
TM6SF1Q9BZW5 RMDN2-AS1-203ENST00000601029 613 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
TM6SF1Q9BZW5 AC009237.13-201ENST00000603193 276 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
TM6SF1Q9BZW5 AC009779.8-202ENST00000607990 932 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
TM6SF1Q9BZW5 AC090607.5-201ENST00000615692 224 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
TM6SF1Q9BZW5 NEK3-211ENST00000629912 141 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
TM6SF1Q9BZW5 NABP1-204ENST00000410026 11521 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
TM6SF1Q9BZW5 MID1-206ENST00000380787 5973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
TM6SF1Q9BZW5 CPEB2-AS1-202ENST00000501916 1806 ntTSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
TM6SF1Q9BZW5 LIN7C-202ENST00000524596 4290 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
TM6SF1Q9BZW5 VPS13B-203ENST00000358544 14094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
TM6SF1Q9BZW5 ADGRL2-222ENST00000627151 5789 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
TM6SF1Q9BZW5 CASC19-260ENST00000641828 2001 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
TM6SF1Q9BZW5 PTBP3-207ENST00000458258 7995 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
TM6SF1Q9BZW5 CHST9-203ENST00000618847 11388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
TM6SF1Q9BZW5 TCF7L2-219ENST00000542695 4136 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
TM6SF1Q9BZW5 TTC37-201ENST00000358746 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
TM6SF1Q9BZW5 MECOM-203ENST00000460814 3374 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
TM6SF1Q9BZW5 STX19-201ENST00000315099 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
TM6SF1Q9BZW5 OR51J1-201ENST00000332043 951 ntAPPRIS P1 BASIC6.72□□□□□ -1.33
TM6SF1Q9BZW5 AC004386.1-201ENST00000393214 761 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
TM6SF1Q9BZW5 HAO2-IT1-201ENST00000419144 311 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
TM6SF1Q9BZW5 BX323845.3-201ENST00000428215 527 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
TM6SF1Q9BZW5 HTR3E-AS1-201ENST00000431427 515 ntTSL 4 BASIC6.72□□□□□ -1.33
TM6SF1Q9BZW5 TMEM183AP1-205ENST00000432739 290 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
TM6SF1Q9BZW5 AC007283.1-201ENST00000434645 445 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
TM6SF1Q9BZW5 AC023271.1-201ENST00000445936 1090 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
TM6SF1Q9BZW5 EIF4E2P2-201ENST00000492033 736 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100 ms