Protein–RNA interactions for Protein: Q99952

PTPN18, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 18, humanhuman

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Length 460 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN18Q99952 IGLV3-6-201ENST00000523937 250 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
PTPN18Q99952 GTF2H1-208ENST00000526630 932 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
PTPN18Q99952 LINC02451-201ENST00000546982 565 ntTSL 4 BASIC7.06□□□□□ -1.28
PTPN18Q99952 AL161752.1-201ENST00000557721 263 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
PTPN18Q99952 AC106796.1-201ENST00000577173 615 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
PTPN18Q99952 AL353811.1-201ENST00000602851 736 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
PTPN18Q99952 AL953862.2-201ENST00000603089 820 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
PTPN18Q99952 AL391425.1-202ENST00000617518 774 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
PTPN18Q99952 AC112694.2-201ENST00000623697 768 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
PTPN18Q99952 FP475955.2-201ENST00000623720 458 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
PTPN18Q99952 AL132640.3-201ENST00000630473 177 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
PTPN18Q99952 ADGRL3-205ENST00000506746 4935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
PTPN18Q99952 CFAP70-202ENST00000340329 1403 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
PTPN18Q99952 SOX5-205ENST00000451604 4261 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
PTPN18Q99952 BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
PTPN18Q99952 KLHL2-204ENST00000506761 2169 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
PTPN18Q99952 FAM227A-205ENST00000535113 10322 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
PTPN18Q99952 HSPA13-201ENST00000285667 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
PTPN18Q99952 BABAM2-201ENST00000342045 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
PTPN18Q99952 BABAM2-203ENST00000361704 1686 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
PTPN18Q99952 SERPINB11-205ENST00000544088 1846 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
PTPN18Q99952 MYBL1-206ENST00000524176 2148 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
PTPN18Q99952 EBF1-203ENST00000517373 2277 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
PTPN18Q99952 FAM216B-202ENST00000537894 3300 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.06□□□□□ -1.28
PTPN18Q99952 RNF14-204ENST00000394519 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
PTPN18Q99952 PGAP1-201ENST00000354764 11114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
PTPN18Q99952 AC104024.1-201ENST00000428142 2201 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PTPN18Q99952 GAS1RR-201ENST00000415801 4387 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
PTPN18Q99952 ZNF652-201ENST00000362063 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
PTPN18Q99952 NCKAP5-203ENST00000405974 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PTPN18Q99952 ZNF69-202ENST00000429654 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PTPN18Q99952 IL1R1-202ENST00000409329 1862 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PTPN18Q99952 CLUL1-205ENST00000579494 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
PTPN18Q99952 WNK3-201ENST00000354646 11341 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
PTPN18Q99952 HLF-210ENST00000575345 3589 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PTPN18Q99952 HMG20A-202ENST00000381714 4112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
PTPN18Q99952 SF3B1-201ENST00000335508 6526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
PTPN18Q99952 PRSS37-201ENST00000350549 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
PTPN18Q99952 MRRF-203ENST00000373723 1176 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PTPN18Q99952 MRRF-207ENST00000373729 870 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PTPN18Q99952 ZNF365-203ENST00000395249 433 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
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PTPN18Q99952 AC022173.1-201ENST00000418554 577 ntTSL 4 BASIC7.05□□□□□ -1.28
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PTPN18Q99952 AL450384.1-201ENST00000433526 413 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PTPN18Q99952 LINC02528-202ENST00000434437 535 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PTPN18Q99952 DNAJA1P6-201ENST00000437347 354 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PTPN18Q99952 MTCYBP31-201ENST00000438855 1122 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PTPN18Q99952 AC012445.1-201ENST00000442831 607 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
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PTPN18Q99952 CASP12-208ENST00000448103 1071 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
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PTPN18Q99952 AC021733.1-201ENST00000519786 325 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
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PTPN18Q99952 AC119674.1-220ENST00000641502 1048 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PTPN18Q99952 STAU2-210ENST00000521210 1950 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PTPN18Q99952 NFATC3-202ENST00000346183 6040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
PTPN18Q99952 AC123769.2-201ENST00000624332 5984 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PTPN18Q99952 TSC1-203ENST00000440111 8463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
PTPN18Q99952 TEX41-210ENST00000451774 2098 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
PTPN18Q99952 NPIPB8-202ENST00000529716 2058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PTPN18Q99952 AC005261.6-201ENST00000623072 1387 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PTPN18Q99952 BMPR2-202ENST00000374580 11461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
PTPN18Q99952 AC024587.1-201ENST00000505925 2157 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PTPN18Q99952 AC021237.1-201ENST00000504175 1643 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PTPN18Q99952 IBTK-201ENST00000306270 6054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
PTPN18Q99952 AC009120.2-204ENST00000621548 2032 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PTPN18Q99952 PPFIA2-203ENST00000443686 3782 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PTPN18Q99952 SPATA31B1P-201ENST00000434692 4016 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
PTPN18Q99952 TDP1-213ENST00000555880 1894 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
PTPN18Q99952 AC061975.7-201ENST00000592016 2692 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
PTPN18Q99952 PROM1-219ENST00000539194 3884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
PTPN18Q99952 LGALS8-222ENST00000527974 1349 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
PTPN18Q99952 TTTY2-201ENST00000417072 3168 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
PTPN18Q99952 TTTY2B-201ENST00000450591 3168 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
PTPN18Q99952 RBM48-202ENST00000481551 4093 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
PTPN18Q99952 JADE3-203ENST00000611250 4713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
PTPN18Q99952 RAPGEF4-214ENST00000538974 3920 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
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