Protein–RNA interactions for Protein: Q969F1

GTF3C6, General transcription factor 3C polypeptide 6, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C6Q969F1 AC007557.3-201ENST00000418591 3135 ntTSL 2 BASIC6.81□□□□□ -1.32
GTF3C6Q969F1 AC079601.1-201ENST00000547824 2791 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
GTF3C6Q969F1 LINC00343-202ENST00000415294 1320 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
GTF3C6Q969F1 AC092451.3-201ENST00000625067 1343 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
GTF3C6Q969F1 RYR3-202ENST00000415757 15557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
GTF3C6Q969F1 RPL6-201ENST00000202773 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
GTF3C6Q969F1 RNA5SP500-201ENST00000364486 119 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
GTF3C6Q969F1 MIR621-201ENST00000384919 96 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
GTF3C6Q969F1 RAB5CP1-201ENST00000395972 580 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
GTF3C6Q969F1 MRPS21P2-201ENST00000424704 264 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
GTF3C6Q969F1 AC073283.2-202ENST00000426892 591 ntTSL 4 BASIC6.8□□□□□ -1.32
GTF3C6Q969F1 VTCN1-204ENST00000430871 569 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
GTF3C6Q969F1 KATNBL1P2-201ENST00000433311 835 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
GTF3C6Q969F1 AL359636.1-201ENST00000433572 522 ntTSL 3 BASIC6.8□□□□□ -1.32
GTF3C6Q969F1 ZNF559-ZNF177-201ENST00000434737 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
GTF3C6Q969F1 ATP6V1E1P1-201ENST00000439215 681 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
GTF3C6Q969F1 ATP5LP2-201ENST00000440646 311 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
GTF3C6Q969F1 PCNPP2-201ENST00000441651 455 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
GTF3C6Q969F1 LINC01765-201ENST00000448680 491 ntTSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
GTF3C6Q969F1 AC093166.3-201ENST00000448785 303 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
GTF3C6Q969F1 AC019117.1-204ENST00000451792 442 ntTSL 3 BASIC6.8□□□□□ -1.32
GTF3C6Q969F1 AC105021.1-201ENST00000455347 590 ntTSL 3 BASIC6.8□□□□□ -1.32
GTF3C6Q969F1 ATP5J-207ENST00000457143 589 ntTSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
GTF3C6Q969F1 LINC01487-201ENST00000462531 905 ntTSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
GTF3C6Q969F1 RN7SL168P-201ENST00000463821 279 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
GTF3C6Q969F1 AC023194.2-201ENST00000465398 406 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
GTF3C6Q969F1 RN7SL193P-201ENST00000491708 276 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
GTF3C6Q969F1 RBBP4P1-201ENST00000502424 1276 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
GTF3C6Q969F1 AC010226.1-203ENST00000515570 765 ntTSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
GTF3C6Q969F1 C11orf54-206ENST00000528099 1862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
GTF3C6Q969F1 MITF-217ENST00000531774 1074 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
GTF3C6Q969F1 AAGAB-203ENST00000542650 1015 ntTSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
GTF3C6Q969F1 MED21-206ENST00000546323 575 ntTSL 3 BASIC6.8□□□□□ -1.32
GTF3C6Q969F1 AC078864.1-201ENST00000547538 512 ntTSL 4 BASIC6.8□□□□□ -1.32
GTF3C6Q969F1 AL845552.1-201ENST00000556820 323 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
GTF3C6Q969F1 LINC02345-203ENST00000558897 405 ntTSL 3 BASIC6.8□□□□□ -1.32
GTF3C6Q969F1 CYCSP38-201ENST00000559840 322 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
GTF3C6Q969F1 U95743.1-201ENST00000573369 1001 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
GTF3C6Q969F1 AC021549.1-201ENST00000580937 433 ntTSL 3 BASIC6.8□□□□□ -1.32
GTF3C6Q969F1 AC008507.3-201ENST00000585753 472 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
GTF3C6Q969F1 FGF1-214ENST00000612258 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
GTF3C6Q969F1 MIR6793-201ENST00000612376 63 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
GTF3C6Q969F1 AL683826.1-201ENST00000624104 627 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
GTF3C6Q969F1 AP004607.3-201ENST00000530354 3915 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
GTF3C6Q969F1 ZNF559-201ENST00000317221 2732 ntTSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
GTF3C6Q969F1 PCGF5-204ENST00000543648 7144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
GTF3C6Q969F1 TESPA1-203ENST00000524622 4188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
GTF3C6Q969F1 AL160286.3-201ENST00000569644 3294 ntTSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
GTF3C6Q969F1 AC027088.4-201ENST00000611559 1947 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
GTF3C6Q969F1 KIAA0586-203ENST00000423743 5339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
GTF3C6Q969F1 LINC00309-201ENST00000431020 3307 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
GTF3C6Q969F1 OR6C75-202ENST00000641576 4569 ntAPPRIS P1 BASIC6.79□□□□□ -1.32
GTF3C6Q969F1 MEMO1-202ENST00000379383 1498 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
GTF3C6Q969F1 ZNF682-201ENST00000358523 2161 ntTSL 2 BASIC6.79□□□□□ -1.32
GTF3C6Q969F1 HHLA2-209ENST00000489514 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
GTF3C6Q969F1 ACSL5-202ENST00000354655 3351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.79□□□□□ -1.32
GTF3C6Q969F1 SEM1-202ENST00000356686 2667 ntTSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
GTF3C6Q969F1 CASC19-238ENST00000641523 1558 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
GTF3C6Q969F1 ZNF227-208ENST00000589005 2943 ntTSL 2 BASIC6.79□□□□□ -1.32
GTF3C6Q969F1 ZNF418-212ENST00000616958 2212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
GTF3C6Q969F1 LAMTOR3-201ENST00000226522 1220 ntTSL 3 BASIC6.79□□□□□ -1.32
GTF3C6Q969F1 PRIM2-201ENST00000274891 864 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
GTF3C6Q969F1 OR7G2-201ENST00000305456 1038 ntAPPRIS P2 BASIC6.79□□□□□ -1.32
GTF3C6Q969F1 COX6B1P3-201ENST00000312310 260 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
GTF3C6Q969F1 ODF3-202ENST00000342593 386 ntTSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
GTF3C6Q969F1 BTBD9-203ENST00000403056 1155 ntTSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
GTF3C6Q969F1 BX284632.2-201ENST00000421091 399 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
GTF3C6Q969F1 AC002069.1-201ENST00000429649 1159 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
GTF3C6Q969F1 AC007679.3-201ENST00000434035 414 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
GTF3C6Q969F1 GAPDHP48-201ENST00000436626 961 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
GTF3C6Q969F1 VN1R110P-201ENST00000438988 971 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
GTF3C6Q969F1 AL512605.1-202ENST00000441919 381 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
GTF3C6Q969F1 AL359955.2-201ENST00000445380 353 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
GTF3C6Q969F1 AC007099.1-201ENST00000451622 1185 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
GTF3C6Q969F1 AL021940.1-201ENST00000454271 677 ntTSL 2 BASIC6.79□□□□□ -1.32
GTF3C6Q969F1 RPL36A-206ENST00000471855 399 ntTSL 3 BASIC6.79□□□□□ -1.32
GTF3C6Q969F1 AC117386.1-201ENST00000474444 606 ntTSL 4 BASIC6.79□□□□□ -1.32
GTF3C6Q969F1 AP000926.3-201ENST00000497201 299 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
GTF3C6Q969F1 AC136777.2-201ENST00000522979 358 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
GTF3C6Q969F1 RPL36A-209ENST00000553110 429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
GTF3C6Q969F1 AL133371.1-201ENST00000555481 764 ntTSL 2 BASIC6.79□□□□□ -1.32
GTF3C6Q969F1 NPM1P5-201ENST00000557228 838 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
GTF3C6Q969F1 ZNF322P1-201ENST00000568013 1209 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
GTF3C6Q969F1 AC117569.1-201ENST00000584482 739 ntTSL 3 BASIC6.79□□□□□ -1.32
GTF3C6Q969F1 AC010320.2-201ENST00000593857 551 ntTSL 4 BASIC6.79□□□□□ -1.32
GTF3C6Q969F1 HIRAP1-201ENST00000605318 787 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
GTF3C6Q969F1 AC104836.2-201ENST00000609675 1293 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
GTF3C6Q969F1 AL391117.1-201ENST00000640003 1186 ntTSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
GTF3C6Q969F1 AL596275.2-207ENST00000641188 675 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
GTF3C6Q969F1 MIR4500HG-201ENST00000436290 1675 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
GTF3C6Q969F1 C17orf78-203ENST00000611038 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.79□□□□□ -1.32
GTF3C6Q969F1 RFX3-212ENST00000617270 9253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.79□□□□□ -1.32
GTF3C6Q969F1 SYCP2L-207ENST00000543878 2436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
GTF3C6Q969F1 OR51G2-202ENST00000641926 3326 ntAPPRIS P1 BASIC6.79□□□□□ -1.32
GTF3C6Q969F1 BX284613.1-201ENST00000452221 1641 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
GTF3C6Q969F1 LEPR-208ENST00000616738 5081 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
GTF3C6Q969F1 AC137056.2-201ENST00000624055 1958 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
GTF3C6Q969F1 TOR1AIP1-202ENST00000435319 3397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
GTF3C6Q969F1 AC009962.1-201ENST00000567327 3813 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
GTF3C6Q969F1 ATP6V1A-201ENST00000273398 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.8 ms