Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK5

ZNF548, Zinc finger protein 548, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548Q8NEK5 AP000424.2-201ENST00000523784 233 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
ZNF548Q8NEK5 MTND5P21-201ENST00000531961 522 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
ZNF548Q8NEK5 MYL12A-202ENST00000536605 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
ZNF548Q8NEK5 AC025419.1-207ENST00000546198 1072 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
ZNF548Q8NEK5 INO80-AS1-201ENST00000558967 312 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
ZNF548Q8NEK5 AP000842.3-201ENST00000564354 808 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
ZNF548Q8NEK5 MTND2P13-201ENST00000577438 1039 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
ZNF548Q8NEK5 MIR3189-201ENST00000578735 73 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
ZNF548Q8NEK5 MYL12A-209ENST00000580887 899 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
ZNF548Q8NEK5 AC005288.1-201ENST00000582842 860 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
ZNF548Q8NEK5 ZNF43-209ENST00000598288 560 ntTSL 4 BASIC6.03□□□□□ -1.44
ZNF548Q8NEK5 AL021368.3-201ENST00000607119 578 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
ZNF548Q8NEK5 AL035587.1-202ENST00000607218 984 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
ZNF548Q8NEK5 CDC37L1-AS1-202ENST00000609131 235 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
ZNF548Q8NEK5 AC096708.4-201ENST00000620563 552 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
ZNF548Q8NEK5 AC084816.1-204ENST00000628326 631 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
ZNF548Q8NEK5 SCN1A-217ENST00000637988 8562 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
ZNF548Q8NEK5 NLGN1-202ENST00000401917 1827 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
ZNF548Q8NEK5 ZNF607-202ENST00000395835 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
ZNF548Q8NEK5 ADAM20-201ENST00000256389 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
ZNF548Q8NEK5 MAPKAPK5P1-201ENST00000431810 1376 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
ZNF548Q8NEK5 OR5B2-202ENST00000641342 2184 ntAPPRIS P1 BASIC6.03□□□□□ -1.44
ZNF548Q8NEK5 ALG11-202ENST00000521508 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
ZNF548Q8NEK5 THOC2-220ENST00000618150 3211 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
ZNF548Q8NEK5 MFSD8-201ENST00000296468 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
ZNF548Q8NEK5 MDM4-217ENST00000621032 5592 ntTSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
ZNF548Q8NEK5 C16orf87-202ENST00000394806 6640 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
ZNF548Q8NEK5 TBC1D32-204ENST00000398212 3824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
ZNF548Q8NEK5 ZNF208-201ENST00000397126 3992 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
ZNF548Q8NEK5 LEPR-205ENST00000371060 5135 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
ZNF548Q8NEK5 ZNF624-201ENST00000311331 4241 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
ZNF548Q8NEK5 SLC26A5-205ENST00000393723 2174 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
ZNF548Q8NEK5 ZNF112-201ENST00000337401 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
ZNF548Q8NEK5 TMSB4XP2-201ENST00000335179 210 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
ZNF548Q8NEK5 RN7SKP81-201ENST00000365603 331 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
ZNF548Q8NEK5 DEFB127-201ENST00000382388 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
ZNF548Q8NEK5 AL512422.1-201ENST00000407033 553 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
ZNF548Q8NEK5 AC009468.1-201ENST00000412800 437 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
ZNF548Q8NEK5 AC007562.1-201ENST00000421819 517 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
ZNF548Q8NEK5 AC007557.4-201ENST00000421907 430 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
ZNF548Q8NEK5 GRM7-AS3-203ENST00000424366 486 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
ZNF548Q8NEK5 AL021408.1-201ENST00000430428 552 ntTSL 4 BASIC6.02□□□□□ -1.45
ZNF548Q8NEK5 BX679664.2-201ENST00000439282 283 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
ZNF548Q8NEK5 TRIM60P16-201ENST00000444048 694 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
ZNF548Q8NEK5 AC023274.2-201ENST00000445264 521 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
ZNF548Q8NEK5 RPL31P15-201ENST00000449770 338 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
ZNF548Q8NEK5 PEX5L-AS2-201ENST00000462801 630 ntTSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
ZNF548Q8NEK5 RN7SL193P-201ENST00000491708 276 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
ZNF548Q8NEK5 AC106872.4-201ENST00000510050 523 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
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ZNF548Q8NEK5 AP003086.2-201ENST00000534168 437 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
ZNF548Q8NEK5 LINC01146-207ENST00000557339 397 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
ZNF548Q8NEK5 AC009097.1-201ENST00000567077 406 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
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ZNF548Q8NEK5 AC092121.1-201ENST00000569452 202 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
ZNF548Q8NEK5 AC027229.1-201ENST00000583887 253 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
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ZNF548Q8NEK5 LINC01198-204ENST00000594153 552 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
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ZNF548Q8NEK5 AL136228.1-201ENST00000622221 319 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
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ZNF548Q8NEK5 AC005480.1-202ENST00000555916 3548 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
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ZNF548Q8NEK5 C16orf62-216ENST00000543152 3352 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
ZNF548Q8NEK5 RCAN2-201ENST00000306764 3240 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
ZNF548Q8NEK5 CAMSAP2-201ENST00000236925 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
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ZNF548Q8NEK5 GTF3C3-202ENST00000409364 1736 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
ZNF548Q8NEK5 ZNF101P1-201ENST00000435701 1720 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
ZNF548Q8NEK5 ERC1-222ENST00000589028 9202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
ZNF548Q8NEK5 FLJ12825-201ENST00000515617 3942 ntTSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
ZNF548Q8NEK5 RFX3-212ENST00000617270 9253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
ZNF548Q8NEK5 AC005154.1-228ENST00000454922 1405 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
ZNF548Q8NEK5 GLRA2-204ENST00000443437 3182 ntTSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
ZNF548Q8NEK5 RALGAPA2-201ENST00000202677 6152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
ZNF548Q8NEK5 RMDN2-201ENST00000234195 1985 ntTSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
ZNF548Q8NEK5 GPN1-205ENST00000458167 1618 ntTSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
ZNF548Q8NEK5 TNP1-201ENST00000236979 407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
ZNF548Q8NEK5 AL442071.1-201ENST00000289890 558 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
ZNF548Q8NEK5 TMEM202-201ENST00000341689 1012 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
ZNF548Q8NEK5 RPS24-201ENST00000360830 514 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
ZNF548Q8NEK5 SNORA72.3-201ENST00000365074 132 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
ZNF548Q8NEK5 TOMM7-203ENST00000405021 455 ntTSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
ZNF548Q8NEK5 SLC3A1-203ENST00000409294 792 ntTSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
ZNF548Q8NEK5 AL034347.1-201ENST00000420766 835 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
ZNF548Q8NEK5 AC073641.1-201ENST00000425192 429 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
ZNF548Q8NEK5 AC108051.1-201ENST00000435291 549 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
ZNF548Q8NEK5 NPSR1-AS1-206ENST00000439852 710 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
ZNF548Q8NEK5 AC011476.1-201ENST00000466725 307 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
ZNF548Q8NEK5 AL355032.1-201ENST00000472981 438 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
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