Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9B8

RASGEF1A, Ras-GEF domain-containing family member 1A, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASGEF1AQ8N9B8 AC022164.1-201ENST00000568767 2673 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
RASGEF1AQ8N9B8 MAPK9-213ENST00000539014 1668 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
RASGEF1AQ8N9B8 VCAM1-201ENST00000294728 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
RASGEF1AQ8N9B8 SGIP1-203ENST00000371037 7768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
RASGEF1AQ8N9B8 SPATA31D5P-202ENST00000527857 4863 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
RASGEF1AQ8N9B8 TRIM22-201ENST00000379965 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
RASGEF1AQ8N9B8 FCHSD2-201ENST00000311172 4340 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
RASGEF1AQ8N9B8 ZNF480-205ENST00000595962 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
RASGEF1AQ8N9B8 RMDN2-201ENST00000234195 1985 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.48
RASGEF1AQ8N9B8 AC130304.1-201ENST00000622942 2385 ntBASIC5.84□□□□□ -1.48
RASGEF1AQ8N9B8 FYB2-201ENST00000343433 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
RASGEF1AQ8N9B8 DDAH1-204ENST00000535924 3909 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
RASGEF1AQ8N9B8 PLEKHA1-201ENST00000368988 3872 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
RASGEF1AQ8N9B8 IQCM-205ENST00000636414 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
RASGEF1AQ8N9B8 WDPCP-203ENST00000409120 5408 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
RASGEF1AQ8N9B8 CCDC178-202ENST00000383096 3391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
RASGEF1AQ8N9B8 PUS3-203ENST00000530811 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
RASGEF1AQ8N9B8 MUT-201ENST00000274813 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
RASGEF1AQ8N9B8 FRMD7-202ENST00000370879 2864 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
RASGEF1AQ8N9B8 RAP1GDS1-202ENST00000339360 2092 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
RASGEF1AQ8N9B8 MECOM-209ENST00000472280 3593 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
RASGEF1AQ8N9B8 KLHL4-201ENST00000373114 2445 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
RASGEF1AQ8N9B8 AC068769.1-201ENST00000474767 2426 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
RASGEF1AQ8N9B8 ZNF571-202ENST00000358744 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
RASGEF1AQ8N9B8 CRYGS-201ENST00000307944 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
RASGEF1AQ8N9B8 OR4S2-201ENST00000312422 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
RASGEF1AQ8N9B8 RNA5-8SP5-201ENST00000365304 152 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
RASGEF1AQ8N9B8 SNORA70.9-201ENST00000384370 135 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
RASGEF1AQ8N9B8 ZNF736P10Y-201ENST00000403990 1110 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
RASGEF1AQ8N9B8 MIR1203-201ENST00000408812 85 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
RASGEF1AQ8N9B8 MIR1282-201ENST00000408865 101 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
RASGEF1AQ8N9B8 AC012368.2-201ENST00000423539 560 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
RASGEF1AQ8N9B8 BX323845.3-201ENST00000428215 527 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
RASGEF1AQ8N9B8 KCTD9P1-201ENST00000430462 1167 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
RASGEF1AQ8N9B8 PCBP2P1-201ENST00000437262 977 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
RASGEF1AQ8N9B8 H3F3BP1-201ENST00000440551 403 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
RASGEF1AQ8N9B8 RPS10P18-201ENST00000442662 495 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
RASGEF1AQ8N9B8 MIS18A-AS1-201ENST00000453549 769 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
RASGEF1AQ8N9B8 ACA64.1-201ENST00000459171 127 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
RASGEF1AQ8N9B8 AC104849.1-201ENST00000462623 405 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
RASGEF1AQ8N9B8 AL603882.1-201ENST00000463059 681 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
RASGEF1AQ8N9B8 PFN1P6-201ENST00000476786 399 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
RASGEF1AQ8N9B8 RPL38P3-201ENST00000484463 213 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
RASGEF1AQ8N9B8 PRB1-202ENST00000500254 775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
RASGEF1AQ8N9B8 AC108727.2-201ENST00000512277 392 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
RASGEF1AQ8N9B8 AC097537.1-201ENST00000514864 1213 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
RASGEF1AQ8N9B8 RN7SKP248-201ENST00000516278 305 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
RASGEF1AQ8N9B8 RNU6-551P-201ENST00000516661 103 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
RASGEF1AQ8N9B8 LINC00861-202ENST00000517869 606 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
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RASGEF1AQ8N9B8 AP001972.1-201ENST00000529215 506 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
RASGEF1AQ8N9B8 OR4A42P-201ENST00000531397 938 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
RASGEF1AQ8N9B8 AP005436.1-201ENST00000531454 488 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
RASGEF1AQ8N9B8 AL157756.1-203ENST00000553269 600 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
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RASGEF1AQ8N9B8 AL356801.1-201ENST00000559320 294 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
RASGEF1AQ8N9B8 AP001007.3-201ENST00000560744 356 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
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RASGEF1AQ8N9B8 LINC01050-201ENST00000604485 760 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
RASGEF1AQ8N9B8 OR11H2-202ENST00000641517 1085 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
RASGEF1AQ8N9B8 C17orf105-201ENST00000449302 3753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
RASGEF1AQ8N9B8 INSL4-201ENST00000239316 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
RASGEF1AQ8N9B8 AASDH-203ENST00000502617 3004 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
RASGEF1AQ8N9B8 NOSTRIN-207ENST00000445023 1569 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
RASGEF1AQ8N9B8 TOR1AIP2-206ENST00000609928 4364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
RASGEF1AQ8N9B8 OR10A6-204ENST00000642108 6104 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
RASGEF1AQ8N9B8 CASC8-203ENST00000502082 1420 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
RASGEF1AQ8N9B8 SLC17A4-202ENST00000397076 2331 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
RASGEF1AQ8N9B8 AL591135.1-201ENST00000401578 5914 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
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RASGEF1AQ8N9B8 CRB1-211ENST00000638467 4348 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
RASGEF1AQ8N9B8 GNG2-212ENST00000556752 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
RASGEF1AQ8N9B8 AC140479.2-201ENST00000421567 3130 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
RASGEF1AQ8N9B8 FCHSD2-208ENST00000458644 2215 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
RASGEF1AQ8N9B8 PRR14L-201ENST00000327423 10826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
RASGEF1AQ8N9B8 NXF3-201ENST00000395065 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
RASGEF1AQ8N9B8 NOL8-214ENST00000535387 3390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
RASGEF1AQ8N9B8 ANKRD46-204ENST00000519597 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
RASGEF1AQ8N9B8 RIMS2-209ENST00000507740 8002 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
RASGEF1AQ8N9B8 LINC01179-201ENST00000507838 2163 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
RASGEF1AQ8N9B8 TAS2R16-201ENST00000249284 997 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
RASGEF1AQ8N9B8 SSX3-201ENST00000298396 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
RASGEF1AQ8N9B8 EMSY-201ENST00000334736 5508 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
RASGEF1AQ8N9B8 RNU1-150P-201ENST00000362491 162 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
RASGEF1AQ8N9B8 FIG4-202ENST00000368941 791 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
RASGEF1AQ8N9B8 CPB2-AS1-201ENST00000415033 747 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
RASGEF1AQ8N9B8 AC096669.1-201ENST00000422203 648 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
RASGEF1AQ8N9B8 AL157834.1-201ENST00000422744 420 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
RASGEF1AQ8N9B8 LINC01501-201ENST00000427523 409 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
RASGEF1AQ8N9B8 AL162408.1-201ENST00000428853 433 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
RASGEF1AQ8N9B8 AL365220.1-201ENST00000432923 399 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
RASGEF1AQ8N9B8 RAET1E-AS1-201ENST00000446954 491 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
RASGEF1AQ8N9B8 GAS5-218ENST00000448718 565 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
RASGEF1AQ8N9B8 AC079896.1-201ENST00000455845 488 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
RASGEF1AQ8N9B8 AC094085.1-201ENST00000468914 584 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
RASGEF1AQ8N9B8 RN7SL57P-201ENST00000493687 290 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
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