Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTS3

PTF1A, Pancreas transcription factor 1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTF1AQ7RTS3 ZNF418-212ENST00000616958 2212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
PTF1AQ7RTS3 SLC12A1-205ENST00000558405 3426 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
PTF1AQ7RTS3 ARFGEF3-201ENST00000251691 14877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
PTF1AQ7RTS3 ZFHX4-204ENST00000518282 12175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
PTF1AQ7RTS3 NEDD9-202ENST00000379446 4536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
PTF1AQ7RTS3 CCDC18-AS1-205ENST00000421202 2973 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
PTF1AQ7RTS3 PGAP1-201ENST00000354764 11114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
PTF1AQ7RTS3 SYNPO2-206ENST00000610556 3934 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
PTF1AQ7RTS3 SYT14P1-202ENST00000600441 1448 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
PTF1AQ7RTS3 NDUFS1-207ENST00000455934 3361 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
PTF1AQ7RTS3 LRRC36-202ENST00000435835 1765 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
PTF1AQ7RTS3 KCNAB1-212ENST00000490337 3122 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
PTF1AQ7RTS3 AC013488.1-201ENST00000526618 1838 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
PTF1AQ7RTS3 NPHP3-AS1-202ENST00000504440 2507 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
PTF1AQ7RTS3 MBD5-201ENST00000404807 5920 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
PTF1AQ7RTS3 AL161911.1-202ENST00000464488 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
PTF1AQ7RTS3 LRBA-209ENST00000510413 10032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
PTF1AQ7RTS3 MTM1-203ENST00000370396 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
PTF1AQ7RTS3 FZD3-204ENST00000537916 13740 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
PTF1AQ7RTS3 PSG1-206ENST00000595356 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
PTF1AQ7RTS3 CFAP61-201ENST00000245957 4082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
PTF1AQ7RTS3 TTC39B-207ENST00000507993 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
PTF1AQ7RTS3 DEFB1-201ENST00000297439 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
PTF1AQ7RTS3 MYRFL-201ENST00000299350 820 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
PTF1AQ7RTS3 RNA5SP350-201ENST00000363298 111 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
PTF1AQ7RTS3 GPR52-201ENST00000367685 1088 ntAPPRIS P1 BASIC7.43□□□□□ -1.22
PTF1AQ7RTS3 AL360271.1-201ENST00000395679 510 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
PTF1AQ7RTS3 BTBD9-203ENST00000403056 1155 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
PTF1AQ7RTS3 AC096559.1-201ENST00000414086 399 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
PTF1AQ7RTS3 AL390243.1-201ENST00000422038 708 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
PTF1AQ7RTS3 RPS6P14-201ENST00000425165 719 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
PTF1AQ7RTS3 AL050338.2-202ENST00000431609 956 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
PTF1AQ7RTS3 LINC01918-202ENST00000438148 415 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
PTF1AQ7RTS3 CD200R1L-202ENST00000448932 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
PTF1AQ7RTS3 LINC01831-201ENST00000449772 493 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
PTF1AQ7RTS3 AC018450.1-202ENST00000465880 529 ntTSL 4 BASIC7.43□□□□□ -1.22
PTF1AQ7RTS3 RPL38P3-201ENST00000484463 213 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
PTF1AQ7RTS3 CCDC11P1-201ENST00000503137 1162 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
PTF1AQ7RTS3 AC122710.1-201ENST00000510622 553 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
PTF1AQ7RTS3 AC097515.1-202ENST00000511818 371 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
PTF1AQ7RTS3 AC023442.2-201ENST00000526455 270 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
PTF1AQ7RTS3 KLRC1-204ENST00000536188 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
PTF1AQ7RTS3 AC137768.1-201ENST00000549998 553 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
PTF1AQ7RTS3 LINC01619-209ENST00000552277 571 ntTSL 4 BASIC7.43□□□□□ -1.22
PTF1AQ7RTS3 AC007494.1-201ENST00000562293 760 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
PTF1AQ7RTS3 MIR4330-201ENST00000579077 105 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
PTF1AQ7RTS3 AC087783.2-201ENST00000605070 562 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
PTF1AQ7RTS3 PPATP2-201ENST00000605635 508 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
PTF1AQ7RTS3 AL118522.2-201ENST00000616045 615 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
PTF1AQ7RTS3 AL591848.4-201ENST00000567832 3472 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
PTF1AQ7RTS3 GABPB2-201ENST00000368916 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
PTF1AQ7RTS3 AC008147.2-201ENST00000552061 4713 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
PTF1AQ7RTS3 KLHL5-203ENST00000381930 3288 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
PTF1AQ7RTS3 KIF13A-205ENST00000378843 5707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
PTF1AQ7RTS3 N4BP2-201ENST00000261435 9744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
PTF1AQ7RTS3 AC012213.2-201ENST00000562917 4597 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
PTF1AQ7RTS3 AC068389.1-202ENST00000526470 3564 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
PTF1AQ7RTS3 TAF7L-203ENST00000372907 2341 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
PTF1AQ7RTS3 TSPAN6-204ENST00000612152 3796 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
PTF1AQ7RTS3 ESRRG-212ENST00000463665 3359 ntTSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
PTF1AQ7RTS3 TESPA1-212ENST00000532804 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
PTF1AQ7RTS3 FCGR1B-209ENST00000616817 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
PTF1AQ7RTS3 FCGR1B-210ENST00000623603 1581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
PTF1AQ7RTS3 SLC15A2-205ENST00000489711 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
PTF1AQ7RTS3 MAPK10-341ENST00000641657 3860 ntAPPRIS P2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
PTF1AQ7RTS3 PRKCA-202ENST00000413366 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
PTF1AQ7RTS3 HMMR-203ENST00000393915 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
PTF1AQ7RTS3 BACH1-201ENST00000286800 5669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
PTF1AQ7RTS3 LINC00284-201ENST00000423211 3208 ntTSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
PTF1AQ7RTS3 OR4D5-201ENST00000307033 1095 ntAPPRIS P1 BASIC7.42□□□□□ -1.22
PTF1AQ7RTS3 OR6C65-201ENST00000379665 1076 ntAPPRIS P1 BASIC7.42□□□□□ -1.22
PTF1AQ7RTS3 GAPDHP42-201ENST00000406848 981 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
PTF1AQ7RTS3 AC016397.1-201ENST00000412463 242 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
PTF1AQ7RTS3 FTH1P10-202ENST00000430907 550 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
PTF1AQ7RTS3 AC074011.1-201ENST00000431376 581 ntTSL 4 BASIC7.42□□□□□ -1.22
PTF1AQ7RTS3 AL160271.1-201ENST00000444708 829 ntTSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
PTF1AQ7RTS3 AL355870.1-201ENST00000448272 454 ntTSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
PTF1AQ7RTS3 RAB28P2-201ENST00000454299 641 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
PTF1AQ7RTS3 OR13C1P-201ENST00000457612 963 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
PTF1AQ7RTS3 ACA64.4-201ENST00000459070 127 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
PTF1AQ7RTS3 RPS29P22-201ENST00000472363 168 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
PTF1AQ7RTS3 AC006463.2-201ENST00000473326 348 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
PTF1AQ7RTS3 RPL7P6-201ENST00000480903 738 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
PTF1AQ7RTS3 RN7SL346P-201ENST00000491561 294 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
PTF1AQ7RTS3 AC025187.1-201ENST00000506305 686 ntTSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
PTF1AQ7RTS3 AC091180.4-201ENST00000511322 245 ntTSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
PTF1AQ7RTS3 AC139722.1-201ENST00000512502 782 ntTSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
PTF1AQ7RTS3 AC040914.1-201ENST00000518674 318 ntTSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
PTF1AQ7RTS3 AP001922.4-201ENST00000526967 290 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
PTF1AQ7RTS3 AP000676.2-201ENST00000529711 301 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
PTF1AQ7RTS3 AC022832.1-201ENST00000530718 645 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
PTF1AQ7RTS3 AC112693.1-201ENST00000555297 682 ntTSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
PTF1AQ7RTS3 AC107926.1-201ENST00000581673 621 ntTSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
PTF1AQ7RTS3 AL136164.2-201ENST00000602823 732 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
PTF1AQ7RTS3 DLG1-210ENST00000422288 2854 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
PTF1AQ7RTS3 ERLIN2-201ENST00000276461 6073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
PTF1AQ7RTS3 KCNJ1-204ENST00000392665 4074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
PTF1AQ7RTS3 TRIP12-201ENST00000283943 9874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
PTF1AQ7RTS3 TLR10-208ENST00000622002 3673 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
PTF1AQ7RTS3 NBPF12-204ENST00000613714 2701 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
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