Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXH8

CCBE1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCBE1Q6UXH8 AC007878.1-201ENST00000434786 1615 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
CCBE1Q6UXH8 KSR2-202ENST00000425217 17008 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CCBE1Q6UXH8 CAST-207ENST00000395813 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CCBE1Q6UXH8 CCNE2-202ENST00000396133 1361 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
CCBE1Q6UXH8 MAPK10-341ENST00000641657 3860 ntAPPRIS P2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CCBE1Q6UXH8 ADGRG4-202ENST00000394141 8971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
CCBE1Q6UXH8 RANBP3L-201ENST00000296604 3104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
CCBE1Q6UXH8 GTPBP10-201ENST00000222511 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
CCBE1Q6UXH8 CLC-201ENST00000221804 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
CCBE1Q6UXH8 OR4K5-201ENST00000315915 1078 ntAPPRIS P1 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CCBE1Q6UXH8 HIST1H1T-201ENST00000338379 718 ntAPPRIS P1 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CCBE1Q6UXH8 RGS5-202ENST00000367903 934 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CCBE1Q6UXH8 NOX1-203ENST00000372964 661 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CCBE1Q6UXH8 XAGE3-202ENST00000375491 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
CCBE1Q6UXH8 IFNA21-201ENST00000380225 1024 ntAPPRIS P1 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CCBE1Q6UXH8 SDHC-203ENST00000392169 369 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
CCBE1Q6UXH8 AC026310.1-201ENST00000396004 378 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CCBE1Q6UXH8 ZNF705B-201ENST00000400120 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CCBE1Q6UXH8 LINC00396-201ENST00000411690 439 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CCBE1Q6UXH8 RPL7AP51-201ENST00000422016 760 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CCBE1Q6UXH8 AL731534.1-201ENST00000434711 269 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CCBE1Q6UXH8 AC068888.2-201ENST00000435621 536 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CCBE1Q6UXH8 FBXW12-203ENST00000436231 1117 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
CCBE1Q6UXH8 AL663074.2-201ENST00000440621 479 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CCBE1Q6UXH8 LINC00349-201ENST00000448748 841 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CCBE1Q6UXH8 NPM1P9-201ENST00000453156 844 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CCBE1Q6UXH8 RPS6P2-201ENST00000454208 705 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CCBE1Q6UXH8 SLC9A9-AS1-201ENST00000479030 518 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CCBE1Q6UXH8 RN7SL502P-201ENST00000481857 290 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CCBE1Q6UXH8 GCSAM-204ENST00000484193 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CCBE1Q6UXH8 RPL29P23-201ENST00000486188 442 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CCBE1Q6UXH8 AC021146.11-201ENST00000503319 491 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CCBE1Q6UXH8 GAPDHP71-201ENST00000511530 1003 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CCBE1Q6UXH8 MINOS1P4-201ENST00000515470 318 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CCBE1Q6UXH8 LINC01484-201ENST00000517733 555 ntTSL 4 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CCBE1Q6UXH8 AC245519.1-201ENST00000522799 512 ntTSL 4 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CCBE1Q6UXH8 AP003033.2-201ENST00000528901 805 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CCBE1Q6UXH8 AP002370.2-202ENST00000533669 908 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CCBE1Q6UXH8 CREBZF-209ENST00000534224 545 ntTSL 4 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CCBE1Q6UXH8 AC117373.1-201ENST00000544036 392 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CCBE1Q6UXH8 AP002383.3-201ENST00000545958 593 ntTSL 4 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CCBE1Q6UXH8 PPFIA2-AS1-202ENST00000549161 1080 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CCBE1Q6UXH8 AP001007.3-201ENST00000560744 356 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CCBE1Q6UXH8 AC060780.2-201ENST00000589047 198 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CCBE1Q6UXH8 MIR132-201ENST00000591554 101 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CCBE1Q6UXH8 AC008750.7-201ENST00000600765 559 ntTSL 4 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CCBE1Q6UXH8 AC036176.3-201ENST00000602456 418 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CCBE1Q6UXH8 Metazoa_SRP.134-201ENST00000610965 327 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CCBE1Q6UXH8 MIR7109-201ENST00000613748 65 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CCBE1Q6UXH8 BNIP3P41-202ENST00000616656 861 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CCBE1Q6UXH8 CCL15-204ENST00000617897 1073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
CCBE1Q6UXH8 AC061999.1-201ENST00000624454 177 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CCBE1Q6UXH8 TEX41-293ENST00000630451 690 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CCBE1Q6UXH8 AC003992.1-201ENST00000635364 557 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CCBE1Q6UXH8 MYOCOS-202ENST00000636788 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CCBE1Q6UXH8 RGS22-215ENST00000523437 3975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
CCBE1Q6UXH8 LINC01630-202ENST00000578152 3188 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CCBE1Q6UXH8 PNPLA4-203ENST00000444736 2752 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CCBE1Q6UXH8 FANCD2P2-201ENST00000437591 1400 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CCBE1Q6UXH8 OR51G2-202ENST00000641926 3326 ntAPPRIS P1 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CCBE1Q6UXH8 MYBPC1-201ENST00000361466 3899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
CCBE1Q6UXH8 PLEKHA5-216ENST00000540972 1954 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
CCBE1Q6UXH8 PTPRZ1-201ENST00000393386 8175 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
CCBE1Q6UXH8 ZFYVE16-206ENST00000510158 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
CCBE1Q6UXH8 VNN3-211ENST00000509351 1700 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
CCBE1Q6UXH8 NCOR1-202ENST00000395848 3106 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
CCBE1Q6UXH8 AC239868.2-201ENST00000564237 4527 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CCBE1Q6UXH8 ELF2-203ENST00000379550 3278 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CCBE1Q6UXH8 LYPD6B-202ENST00000409029 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
CCBE1Q6UXH8 LZTFL1-216ENST00000539217 4113 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CCBE1Q6UXH8 NUP107-202ENST00000378905 2859 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CCBE1Q6UXH8 MBNL2-201ENST00000343600 4596 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
CCBE1Q6UXH8 AP001029.2-203ENST00000589795 4910 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CCBE1Q6UXH8 PALMD-201ENST00000263174 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
CCBE1Q6UXH8 C15orf41-201ENST00000338183 2578 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CCBE1Q6UXH8 PARP8-212ENST00000505697 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
CCBE1Q6UXH8 LINC00517-202ENST00000554257 3460 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CCBE1Q6UXH8 ING3-201ENST00000315870 3777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
CCBE1Q6UXH8 CSTA-201ENST00000264474 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
CCBE1Q6UXH8 ZNF669-202ENST00000366500 489 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CCBE1Q6UXH8 YAF2-202ENST00000380790 1211 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CCBE1Q6UXH8 MT-RNR1-201ENST00000389680 954 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CCBE1Q6UXH8 IGKV3-7-201ENST00000390247 445 ntAPPRIS P1 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CCBE1Q6UXH8 RPL5P19-201ENST00000404228 893 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CCBE1Q6UXH8 AL590635.1-201ENST00000406314 586 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CCBE1Q6UXH8 AL138828.1-204ENST00000413745 898 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CCBE1Q6UXH8 AC244033.1-201ENST00000426826 870 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CCBE1Q6UXH8 AL354707.3-201ENST00000427308 331 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CCBE1Q6UXH8 MTHFD2L-207ENST00000433372 1407 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
CCBE1Q6UXH8 AC138761.5-201ENST00000433967 325 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CCBE1Q6UXH8 AL035701.1-202ENST00000437249 371 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CCBE1Q6UXH8 EEF1B2P3-201ENST00000447718 678 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CCBE1Q6UXH8 OR2AF1P-201ENST00000454899 889 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CCBE1Q6UXH8 NIP7P2-201ENST00000485801 544 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CCBE1Q6UXH8 TRBV5-2-201ENST00000489095 273 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CCBE1Q6UXH8 RN7SL37P-201ENST00000490461 307 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CCBE1Q6UXH8 SUCLG2-AS1-203ENST00000496640 862 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CCBE1Q6UXH8 AC080013.1-206ENST00000496842 712 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CCBE1Q6UXH8 AC022126.1-201ENST00000502995 593 ntTSL 4 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CCBE1Q6UXH8 AC008413.2-201ENST00000507398 342 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
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