Protein–RNA interactions for Protein: Q5BKX8

CAVIN4, Caveolae-associated protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN4Q5BKX8 FABP2-201ENST00000274024 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
CAVIN4Q5BKX8 ADAM18-202ENST00000379866 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
CAVIN4Q5BKX8 NSD1-201ENST00000347982 7688 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
CAVIN4Q5BKX8 MNS1-201ENST00000260453 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
CAVIN4Q5BKX8 PSG7-201ENST00000406070 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
CAVIN4Q5BKX8 CASC11-201ENST00000502463 3301 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
CAVIN4Q5BKX8 MAGI2-235ENST00000637282 3174 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
CAVIN4Q5BKX8 NUP107-211ENST00000539906 3004 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
CAVIN4Q5BKX8 TCF7L2-219ENST00000542695 4136 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
CAVIN4Q5BKX8 RASGRP1-203ENST00000450598 2296 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
CAVIN4Q5BKX8 AL159987.1-201ENST00000347911 293 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
CAVIN4Q5BKX8 RN7SKP160-201ENST00000363804 340 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
CAVIN4Q5BKX8 HIST1H3PS1-201ENST00000404612 417 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
CAVIN4Q5BKX8 OR6E1P-201ENST00000414424 923 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
CAVIN4Q5BKX8 AC099654.1-202ENST00000415836 564 ntTSL 4 BASIC7.05□□□□□ -1.28
CAVIN4Q5BKX8 GTF3AP1-201ENST00000416942 1004 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
CAVIN4Q5BKX8 AC113412.1-201ENST00000425840 504 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
CAVIN4Q5BKX8 AP001476.3-201ENST00000429512 415 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
CAVIN4Q5BKX8 KATNBL1P2-201ENST00000433311 835 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
CAVIN4Q5BKX8 HRAT17-202ENST00000451962 687 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
CAVIN4Q5BKX8 RN7SL72P-201ENST00000460697 269 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
CAVIN4Q5BKX8 MRE11P1-201ENST00000464884 2127 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
CAVIN4Q5BKX8 AC087672.1-201ENST00000479876 766 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
CAVIN4Q5BKX8 RN7SL570P-201ENST00000484405 292 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
CAVIN4Q5BKX8 AC074255.1-201ENST00000511259 501 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
CAVIN4Q5BKX8 NSMCE2-210ENST00000522563 1037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
CAVIN4Q5BKX8 MINCR-206ENST00000524335 499 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
CAVIN4Q5BKX8 GPRC5D-AS1-205ENST00000540198 404 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
CAVIN4Q5BKX8 DCN-210ENST00000547568 823 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
CAVIN4Q5BKX8 AC125612.1-201ENST00000547580 377 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
CAVIN4Q5BKX8 AL157756.1-203ENST00000553269 600 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
CAVIN4Q5BKX8 PWRN1-204ENST00000565241 480 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
CAVIN4Q5BKX8 ZNF43-209ENST00000598288 560 ntTSL 4 BASIC7.05□□□□□ -1.28
CAVIN4Q5BKX8 AC003682.1-201ENST00000599190 462 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
CAVIN4Q5BKX8 ADAMTS9-AS1-210ENST00000625328 699 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
CAVIN4Q5BKX8 BIRC3-207ENST00000615299 4342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
CAVIN4Q5BKX8 ANGPT1-205ENST00000520052 1523 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
CAVIN4Q5BKX8 NBPF25P-202ENST00000619932 3827 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
CAVIN4Q5BKX8 MFSD8-219ENST00000641228 2559 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
CAVIN4Q5BKX8 DNAH17-201ENST00000389840 13723 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
CAVIN4Q5BKX8 SRRM1P3-201ENST00000426911 2678 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
CAVIN4Q5BKX8 NF1-201ENST00000356175 12362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
CAVIN4Q5BKX8 SLC30A7-203ENST00000370112 7898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
CAVIN4Q5BKX8 DCC-203ENST00000442544 10206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
CAVIN4Q5BKX8 AP004607.3-201ENST00000530354 3915 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
CAVIN4Q5BKX8 POLR1D-218ENST00000636817 4592 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
CAVIN4Q5BKX8 GTF2IP4-201ENST00000453092 2054 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
CAVIN4Q5BKX8 ELOVL5-203ENST00000370918 3081 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
CAVIN4Q5BKX8 GABRG2-228ENST00000640985 3086 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
CAVIN4Q5BKX8 CAPN6-201ENST00000324068 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
CAVIN4Q5BKX8 AL139008.2-201ENST00000420315 395 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
CAVIN4Q5BKX8 LINC02518-201ENST00000421737 524 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
CAVIN4Q5BKX8 AC016994.1-201ENST00000425419 552 ntTSL 4 BASIC7.04□□□□□ -1.28
CAVIN4Q5BKX8 HSPE1P27-201ENST00000430808 296 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
CAVIN4Q5BKX8 AL450996.1-201ENST00000445574 1202 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
CAVIN4Q5BKX8 EIF4A1P6-201ENST00000448133 1210 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
CAVIN4Q5BKX8 AP006216.2-201ENST00000457746 333 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
CAVIN4Q5BKX8 AL355032.1-201ENST00000472981 438 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
CAVIN4Q5BKX8 RPS3AP15-201ENST00000483874 781 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
CAVIN4Q5BKX8 RPS4XP14-201ENST00000493072 781 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
CAVIN4Q5BKX8 MOSPD2-206ENST00000497603 775 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
CAVIN4Q5BKX8 AC013644.1-201ENST00000523724 555 ntTSL 4 BASIC7.04□□□□□ -1.28
CAVIN4Q5BKX8 AC107884.2-201ENST00000530963 550 ntTSL 4 BASIC7.04□□□□□ -1.28
CAVIN4Q5BKX8 GPRC5D-AS1-208ENST00000545914 566 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
CAVIN4Q5BKX8 AC087286.2-201ENST00000558980 660 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
CAVIN4Q5BKX8 AC092078.2-201ENST00000560900 581 ntTSL 4 BASIC7.04□□□□□ -1.28
CAVIN4Q5BKX8 AC096996.1-201ENST00000563813 325 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
CAVIN4Q5BKX8 LYRM1-211ENST00000569023 769 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
CAVIN4Q5BKX8 AC022211.1-201ENST00000579554 717 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
CAVIN4Q5BKX8 MIR1273E-201ENST00000581165 102 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
CAVIN4Q5BKX8 ZNF561-AS1-207ENST00000591932 676 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
CAVIN4Q5BKX8 AC063977.5-201ENST00000601044 974 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
CAVIN4Q5BKX8 TMOD2-201ENST00000249700 9191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
CAVIN4Q5BKX8 LRRC39-202ENST00000370137 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
CAVIN4Q5BKX8 LRRC49-204ENST00000544974 6605 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
CAVIN4Q5BKX8 SMIM21-203ENST00000584508 2554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
CAVIN4Q5BKX8 AC067956.1-201ENST00000414512 2062 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
CAVIN4Q5BKX8 ANKRD44-201ENST00000282272 5147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
CAVIN4Q5BKX8 CUZD1-205ENST00000368904 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
CAVIN4Q5BKX8 SCN1A-203ENST00000409050 5946 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
CAVIN4Q5BKX8 MYO3B-202ENST00000408978 5529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
CAVIN4Q5BKX8 PATL1-201ENST00000300146 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
CAVIN4Q5BKX8 BDNF-205ENST00000395981 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
CAVIN4Q5BKX8 OR2T7-201ENST00000641057 3463 ntAPPRIS P1 BASIC7.03□□□□□ -1.28
CAVIN4Q5BKX8 AC114786.1-201ENST00000512892 1415 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
CAVIN4Q5BKX8 ZNF33A-203ENST00000432900 3994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
CAVIN4Q5BKX8 LZTFL1-215ENST00000536047 4342 ntTSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
CAVIN4Q5BKX8 INSL4-201ENST00000239316 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
CAVIN4Q5BKX8 RN7SKP124-201ENST00000364730 341 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
CAVIN4Q5BKX8 LEMD1-203ENST00000367152 741 ntTSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
CAVIN4Q5BKX8 AL391422.1-201ENST00000402155 436 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
CAVIN4Q5BKX8 ZSCAN12P1-201ENST00000406489 419 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
CAVIN4Q5BKX8 AC004882.2-201ENST00000420180 244 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
CAVIN4Q5BKX8 LINC01506-201ENST00000432148 495 ntTSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
CAVIN4Q5BKX8 FMO7P-201ENST00000436045 768 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
CAVIN4Q5BKX8 UBE2L5P-201ENST00000436446 465 ntAPPRIS P1 BASIC7.03□□□□□ -1.28
CAVIN4Q5BKX8 GAPDHP48-201ENST00000436626 961 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
CAVIN4Q5BKX8 AL445687.2-201ENST00000458156 728 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
CAVIN4Q5BKX8 DUTP7-201ENST00000507982 486 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
CAVIN4Q5BKX8 AC079209.1-202ENST00000521953 522 ntTSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.6 ms