Protein–RNA interactions for Protein: Q53S08

RAB6C, Rab6C, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6CQ53S08 IKZF2-201ENST00000342002 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
RAB6CQ53S08 PARD3B-214ENST00000622699 7442 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
RAB6CQ53S08 ANK2-201ENST00000264366 11775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
RAB6CQ53S08 GPR87-201ENST00000260843 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
RAB6CQ53S08 MAPK10-261ENST00000641050 3109 ntBASIC6□□□□□ -1.45
RAB6CQ53S08 PKIB-203ENST00000368446 556 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
RAB6CQ53S08 OR6C65-201ENST00000379665 1076 ntAPPRIS P1 BASIC6□□□□□ -1.45
RAB6CQ53S08 MIR130A-201ENST00000385274 89 ntBASIC6□□□□□ -1.45
RAB6CQ53S08 RAB5CP1-201ENST00000395972 580 ntBASIC6□□□□□ -1.45
RAB6CQ53S08 DNAJA1P3-201ENST00000399417 1194 ntBASIC6□□□□□ -1.45
RAB6CQ53S08 MTND3P20-201ENST00000407663 186 ntBASIC6□□□□□ -1.45
RAB6CQ53S08 RPL23AP18-201ENST00000416139 468 ntBASIC6□□□□□ -1.45
RAB6CQ53S08 AP000221.1-201ENST00000419694 1046 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
RAB6CQ53S08 CRIP1P1-201ENST00000427567 185 ntBASIC6□□□□□ -1.45
RAB6CQ53S08 AC242426.1-201ENST00000435270 960 ntBASIC6□□□□□ -1.45
RAB6CQ53S08 KRT8P51-201ENST00000438938 274 ntBASIC6□□□□□ -1.45
RAB6CQ53S08 AL121917.1-201ENST00000441270 893 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
RAB6CQ53S08 SORCS3-AS1-201ENST00000449805 1278 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
RAB6CQ53S08 AP006222.1-205ENST00000450734 457 ntBASIC6□□□□□ -1.45
RAB6CQ53S08 LINC01448-201ENST00000455947 1171 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
RAB6CQ53S08 MRE11P1-201ENST00000464884 2127 ntBASIC6□□□□□ -1.45
RAB6CQ53S08 RPL12P24-201ENST00000474907 486 ntBASIC6□□□□□ -1.45
RAB6CQ53S08 LINC00483-204ENST00000502517 940 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
RAB6CQ53S08 AC113398.2-201ENST00000507630 558 ntBASIC6□□□□□ -1.45
RAB6CQ53S08 AF250324.1-203ENST00000508156 517 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
RAB6CQ53S08 AC139720.1-201ENST00000509497 512 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
RAB6CQ53S08 SUMO2P19-201ENST00000518920 295 ntBASIC6□□□□□ -1.45
RAB6CQ53S08 IGHVIII-76-1-201ENST00000523776 286 ntBASIC6□□□□□ -1.45
RAB6CQ53S08 AP000648.1-201ENST00000529682 397 ntBASIC6□□□□□ -1.45
RAB6CQ53S08 AC099850.2-201ENST00000577660 557 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
RAB6CQ53S08 AC008395.1-201ENST00000601752 607 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
RAB6CQ53S08 AL031601.1-201ENST00000605702 394 ntBASIC6□□□□□ -1.45
RAB6CQ53S08 AF117829.2-201ENST00000619538 361 ntBASIC6□□□□□ -1.45
RAB6CQ53S08 AL035661.1-201ENST00000620459 1144 ntBASIC6□□□□□ -1.45
RAB6CQ53S08 UGP2-232ENST00000640075 567 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
RAB6CQ53S08 NEPNP-201ENST00000404786 1371 ntBASIC6□□□□□ -1.45
RAB6CQ53S08 RPE65-201ENST00000262340 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
RAB6CQ53S08 AC010401.2-201ENST00000575137 4934 ntBASIC6□□□□□ -1.45
RAB6CQ53S08 RALYL-211ENST00000523850 1684 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
RAB6CQ53S08 NELL2-201ENST00000333837 2943 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
RAB6CQ53S08 ADCY10-205ENST00000545172 4966 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
RAB6CQ53S08 PAK3-201ENST00000262836 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
RAB6CQ53S08 PLCE1-201ENST00000371375 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
RAB6CQ53S08 PAK3-205ENST00000417227 2196 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
RAB6CQ53S08 SELENOI-205ENST00000613142 8126 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
RAB6CQ53S08 AC007159.1-201ENST00000566529 4706 ntBASIC6□□□□□ -1.45
RAB6CQ53S08 EFNA5-206ENST00000611503 4933 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
RAB6CQ53S08 SPARCL1-202ENST00000418378 2994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
RAB6CQ53S08 TOR1AIP2-201ENST00000367612 7905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
RAB6CQ53S08 PROM1-201ENST00000447510 3977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
RAB6CQ53S08 CCDC178-202ENST00000383096 3391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
RAB6CQ53S08 FABP2-201ENST00000274024 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
RAB6CQ53S08 AC068870.1-201ENST00000563737 2455 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
RAB6CQ53S08 OR52B3P-201ENST00000314715 928 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
RAB6CQ53S08 KRTAP23-1-201ENST00000334160 211 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
RAB6CQ53S08 SNTN-201ENST00000343837 1090 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
RAB6CQ53S08 PRSS37-201ENST00000350549 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
RAB6CQ53S08 FIG4-202ENST00000368941 791 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
RAB6CQ53S08 TYRP1-201ENST00000381136 872 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
RAB6CQ53S08 CCL8-201ENST00000394620 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
RAB6CQ53S08 NIFKP3-201ENST00000417799 865 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
RAB6CQ53S08 AL035660.1-201ENST00000422041 222 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
RAB6CQ53S08 HTR3E-AS1-201ENST00000431427 515 ntTSL 4 BASIC5.99□□□□□ -1.45
RAB6CQ53S08 HMGB3P24-201ENST00000433260 622 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
RAB6CQ53S08 AC079080.1-201ENST00000479841 822 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
RAB6CQ53S08 AC073610.1-201ENST00000489971 396 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
RAB6CQ53S08 GYPB-213ENST00000513128 360 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
RAB6CQ53S08 AC068389.4-201ENST00000531379 689 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
RAB6CQ53S08 AAGAB-203ENST00000542650 1015 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
RAB6CQ53S08 CCL4-202ENST00000615863 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
RAB6CQ53S08 Metazoa_SRP.43-201ENST00000616394 271 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
RAB6CQ53S08 NADK2-211ENST00000617628 744 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
RAB6CQ53S08 AL031665.2-201ENST00000620712 209 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
RAB6CQ53S08 AC022400.9-201ENST00000623633 273 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
RAB6CQ53S08 MIR325HG-202ENST00000626832 598 ntTSL 4 BASIC5.99□□□□□ -1.45
RAB6CQ53S08 AC092574.2-201ENST00000631198 753 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
RAB6CQ53S08 AL596218.1-201ENST00000634239 1140 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
RAB6CQ53S08 CFTRP2-201ENST00000634304 199 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
RAB6CQ53S08 OR3A3-203ENST00000641141 3800 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
RAB6CQ53S08 AL022344.1-201ENST00000439913 3965 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
RAB6CQ53S08 ZNF480-205ENST00000595962 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
RAB6CQ53S08 GPN1-205ENST00000458167 1618 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
RAB6CQ53S08 LGI1-219ENST00000636155 1618 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
RAB6CQ53S08 CLEC12A-201ENST00000304361 1549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
RAB6CQ53S08 AL161912.4-201ENST00000623889 2468 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
RAB6CQ53S08 PREPL-201ENST00000260648 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
RAB6CQ53S08 RMDN2-201ENST00000234195 1985 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
RAB6CQ53S08 SLC35F1-202ENST00000621341 4481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
RAB6CQ53S08 GFPT1-202ENST00000361060 8632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
RAB6CQ53S08 MEF2C-202ENST00000424173 6336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
RAB6CQ53S08 SIAH1-202ENST00000380006 3352 ntAPPRIS P3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
RAB6CQ53S08 SLC16A6-201ENST00000327268 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
RAB6CQ53S08 TAF13-201ENST00000338366 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
RAB6CQ53S08 SSX5-202ENST00000347757 1261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
RAB6CQ53S08 SNORA64.1-201ENST00000362600 132 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
RAB6CQ53S08 RNA5SP326-201ENST00000363209 110 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
RAB6CQ53S08 SSX5-203ENST00000376923 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
RAB6CQ53S08 IGLV3-10-201ENST00000390315 382 ntAPPRIS P1 BASIC5.98□□□□□ -1.45
RAB6CQ53S08 TRAV8-7-201ENST00000390456 341 ntAPPRIS P1 BASIC5.98□□□□□ -1.45
RAB6CQ53S08 F9-202ENST00000394090 1272 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
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