Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 AL133419.1-201ENST00000423153 640 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
LAMA3Q16787 FSIP2-AS1-201ENST00000429929 440 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
LAMA3Q16787 FSIP2-AS1-202ENST00000436557 689 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
LAMA3Q16787 IGLV3-24-201ENST00000517477 197 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
LAMA3Q16787 AC026620.1-201ENST00000584815 326 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
LAMA3Q16787 AC125494.2-201ENST00000602431 657 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
LAMA3Q16787 AC002384.2-201ENST00000636036 790 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
LAMA3Q16787 TP53BP1-210ENST00000450115 6179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
LAMA3Q16787 ZBTB43-202ENST00000373464 5965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
LAMA3Q16787 TMEM269-204ENST00000637012 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
LAMA3Q16787 MAP3K7-201ENST00000369320 3328 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
LAMA3Q16787 CMKLR1-202ENST00000412676 5110 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
LAMA3Q16787 ZBTB43-203ENST00000449886 5851 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
LAMA3Q16787 RPL36AP15-201ENST00000444514 266 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
LAMA3Q16787 AL049649.1-201ENST00000444792 1105 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
LAMA3Q16787 CARD8-211ENST00000519332 500 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
LAMA3Q16787 AP003696.1-201ENST00000519337 770 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
LAMA3Q16787 AL162872.1-201ENST00000557709 448 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
LAMA3Q16787 AC003682.1-201ENST00000599190 462 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
LAMA3Q16787 LINC00706-201ENST00000628989 699 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
LAMA3Q16787 LRRN3-201ENST00000308478 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
LAMA3Q16787 NAT1-201ENST00000307719 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
LAMA3Q16787 UTY-202ENST00000331397 6529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
LAMA3Q16787 USP9YP3-201ENST00000434481 1766 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
LAMA3Q16787 SLAMF6-202ENST00000368057 2712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
LAMA3Q16787 BPIFC-201ENST00000300399 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
LAMA3Q16787 SVIL-203ENST00000375400 6729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
LAMA3Q16787 ITPK1-AS1-201ENST00000553639 4701 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
LAMA3Q16787 RPL32P23-201ENST00000397237 405 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
LAMA3Q16787 C7orf69-201ENST00000418326 675 ntTSL 4 BASIC5.86□□□□□ -1.47
LAMA3Q16787 CATSPER2P1-205ENST00000446479 419 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
LAMA3Q16787 AL022237.1-201ENST00000446663 358 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
LAMA3Q16787 PWRN1-208ENST00000567647 561 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
LAMA3Q16787 CDH7-202ENST00000397968 12231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
LAMA3Q16787 TMEM68-202ENST00000434581 2549 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
LAMA3Q16787 MAPK10-344ENST00000641718 3746 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
LAMA3Q16787 CACNA2D3-212ENST00000620722 3296 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
LAMA3Q16787 B3GALT1-201ENST00000392690 5094 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
LAMA3Q16787 PROM1-201ENST00000447510 3977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
LAMA3Q16787 CHIC1-202ENST00000373504 6797 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
LAMA3Q16787 DSC1-201ENST00000257197 4271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
LAMA3Q16787 JAKMIP2-206ENST00000616793 9272 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
LAMA3Q16787 COL4A6-202ENST00000372216 6570 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
LAMA3Q16787 RN7SKP149-201ENST00000363008 344 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
LAMA3Q16787 C6orf48-208ENST00000395788 815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
LAMA3Q16787 DDX39BP1-205ENST00000422507 192 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
LAMA3Q16787 LINC01831-201ENST00000449772 493 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
LAMA3Q16787 STK26-205ENST00000496850 1186 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
LAMA3Q16787 MAL2-207ENST00000522828 603 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
LAMA3Q16787 AC060766.1-201ENST00000590824 627 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
LAMA3Q16787 SLC17A2-203ENST00000377850 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
LAMA3Q16787 ACVR2B-201ENST00000352511 11821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
LAMA3Q16787 GRIK2-203ENST00000369134 4185 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
LAMA3Q16787 POMP-202ENST00000460403 1428 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
LAMA3Q16787 USP3-201ENST00000268049 5311 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
LAMA3Q16787 CR1-203ENST00000367051 7469 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
LAMA3Q16787 CR1-204ENST00000367052 7469 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
LAMA3Q16787 CR1-205ENST00000367053 7469 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
LAMA3Q16787 METTL8-201ENST00000375258 8203 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
LAMA3Q16787 ADGRL3-209ENST00000508693 5009 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
LAMA3Q16787 UTY-210ENST00000538878 6574 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
LAMA3Q16787 OR2A1-202ENST00000641044 4632 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
LAMA3Q16787 AL138733.1-201ENST00000415477 853 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
LAMA3Q16787 AL353689.2-201ENST00000433837 440 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
LAMA3Q16787 AL590399.4-201ENST00000436561 601 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
LAMA3Q16787 CASC6-201ENST00000437768 733 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
LAMA3Q16787 OR7A15P-201ENST00000449848 1009 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
LAMA3Q16787 AC097484.1-201ENST00000471148 389 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
LAMA3Q16787 LINC02265-201ENST00000510551 957 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
LAMA3Q16787 SCARNA9-201ENST00000530422 353 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
LAMA3Q16787 SLC25A3P1-203ENST00000563752 460 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
LAMA3Q16787 MIR4715-201ENST00000584117 79 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
LAMA3Q16787 TTN-AS1-237ENST00000590743 812 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
LAMA3Q16787 MORF4L2-206ENST00000433176 1965 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
LAMA3Q16787 AC104793.1-201ENST00000508189 2840 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
LAMA3Q16787 ZKSCAN1-206ENST00000620510 9192 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
LAMA3Q16787 ZNF271P-201ENST00000399070 5124 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
LAMA3Q16787 NRK-201ENST00000243300 8062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
LAMA3Q16787 WDR63-201ENST00000294664 2995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
LAMA3Q16787 AP002991.2-201ENST00000623807 2801 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
LAMA3Q16787 MAPK10-366ENST00000641903 2812 ntAPPRIS ALT1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
LAMA3Q16787 OR9A2-201ENST00000350513 1038 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
LAMA3Q16787 AC007559.1-201ENST00000428736 355 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
LAMA3Q16787 ATP5J-207ENST00000457143 589 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
LAMA3Q16787 NEK1-207ENST00000511633 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
LAMA3Q16787 AC069366.1-201ENST00000583159 838 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
LAMA3Q16787 ZNF227-204ENST00000586228 569 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
LAMA3Q16787 AC009597.2-201ENST00000604659 592 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
LAMA3Q16787 AJ009632.2-207ENST00000634659 527 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
LAMA3Q16787 ZNF791-202ENST00000446165 6412 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
LAMA3Q16787 TACC2-210ENST00000369005 9673 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
LAMA3Q16787 ODF2-205ENST00000393527 3653 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
LAMA3Q16787 GMFB-208ENST00000554908 6721 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
LAMA3Q16787 CELF2-209ENST00000631460 5538 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
LAMA3Q16787 ATF2-212ENST00000426833 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
LAMA3Q16787 TMTC1-201ENST00000256062 8805 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
LAMA3Q16787 COL4A4-201ENST00000396625 9895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
LAMA3Q16787 OR10A2-201ENST00000307322 1053 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
LAMA3Q16787 MYL6P5-201ENST00000412707 459 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
LAMA3Q16787 AC093581.1-201ENST00000446411 461 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
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