Protein–RNA interactions for Protein: Q16654

PDK4, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 4, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK4Q16654 AC005544.1-201ENST00000584277 460 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
PDK4Q16654 LINC01533-204ENST00000590719 435 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
PDK4Q16654 LINC01435-212ENST00000601212 742 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
PDK4Q16654 AC073333.2-201ENST00000603589 769 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
PDK4Q16654 NANOGP3-201ENST00000605855 286 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
PDK4Q16654 LINC02343-201ENST00000605909 573 ntTSL 4 BASIC5.83□□□□□ -1.48
PDK4Q16654 AC008280.3-201ENST00000606436 732 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
PDK4Q16654 AC005828.7-201ENST00000607331 556 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
PDK4Q16654 AC092681.3-201ENST00000609463 678 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
PDK4Q16654 uc_338.31-201ENST00000615595 186 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
PDK4Q16654 FAM27E2-201ENST00000619668 403 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
PDK4Q16654 IKZF3-213ENST00000439167 1879 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
PDK4Q16654 IGSF10-201ENST00000282466 11067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
PDK4Q16654 SLC7A11-201ENST00000280612 9645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
PDK4Q16654 DYNC1I2-225ENST00000508530 2494 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
PDK4Q16654 CACNB4-203ENST00000397327 2112 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
PDK4Q16654 LINC00320-204ENST00000437238 2004 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
PDK4Q16654 AC007938.2-201ENST00000604666 2634 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
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PDK4Q16654 EEF1A1P33-201ENST00000554413 1362 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
PDK4Q16654 RNF32-203ENST00000392741 2260 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
PDK4Q16654 CTAGE5-217ENST00000557038 2869 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
PDK4Q16654 SDAD1-203ENST00000395711 2513 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
PDK4Q16654 LINC01378-201ENST00000422145 2516 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
PDK4Q16654 LINC02355-201ENST00000503100 2520 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
PDK4Q16654 FBXL21-201ENST00000297158 1305 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
PDK4Q16654 CLEC4A-204ENST00000360500 597 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
PDK4Q16654 GKN1-201ENST00000377938 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
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PDK4Q16654 LIX1L-AS1-202ENST00000412239 570 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
PDK4Q16654 AL109610.1-201ENST00000414598 431 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
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PDK4Q16654 OR10T1P-201ENST00000424327 947 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
PDK4Q16654 ICA1L-210ENST00000425178 879 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
PDK4Q16654 AC024601.1-201ENST00000427247 524 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
PDK4Q16654 ZEB2-AS1-203ENST00000428623 436 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
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PDK4Q16654 AL162385.2-201ENST00000437864 285 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
PDK4Q16654 AL358074.1-201ENST00000444800 509 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
PDK4Q16654 NPM1P28-201ENST00000492269 840 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
PDK4Q16654 AC104779.1-201ENST00000503557 441 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
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PDK4Q16654 RDM1-226ENST00000619828 687 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
PDK4Q16654 SNHG5-214ENST00000623001 598 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
PDK4Q16654 CU638689.1-201ENST00000623225 897 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
PDK4Q16654 CU634019.4-201ENST00000623347 897 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
PDK4Q16654 CCDC195-201ENST00000638102 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
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PDK4Q16654 MAPRE2-211ENST00000589699 4080 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
PDK4Q16654 ZNF615-201ENST00000376716 4048 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
PDK4Q16654 DSC2-201ENST00000251081 4826 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
PDK4Q16654 SLC26A3-201ENST00000340010 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
PDK4Q16654 LARP4-203ENST00000398473 6427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
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PDK4Q16654 MEMO1-202ENST00000379383 1498 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
PDK4Q16654 DAZ2-203ENST00000382424 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
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PDK4Q16654 ATF2-212ENST00000426833 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
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PDK4Q16654 DIAPH3-208ENST00000498416 2249 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
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PDK4Q16654 OR6C1-201ENST00000379668 1064 ntAPPRIS P1 BASIC5.81□□□□□ -1.48
PDK4Q16654 SNORA70.6-201ENST00000383934 134 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
PDK4Q16654 TRAJ38-201ENST00000390499 62 ntAPPRIS P1 BASIC5.81□□□□□ -1.48
PDK4Q16654 RBBP4P5-201ENST00000398583 1266 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
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PDK4Q16654 AL512353.1-202ENST00000416809 627 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
PDK4Q16654 LINC01690-201ENST00000424837 576 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
PDK4Q16654 VN1R21P-201ENST00000426703 765 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
PDK4Q16654 LINC02522-201ENST00000431401 256 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
PDK4Q16654 AC023141.3-201ENST00000436698 278 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
PDK4Q16654 RPS12P17-201ENST00000438591 377 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
PDK4Q16654 AC007327.2-201ENST00000440788 457 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
PDK4Q16654 VN1R96P-201ENST00000446052 858 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
PDK4Q16654 HMGB1P7-201ENST00000450921 612 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
PDK4Q16654 AC115618.2-201ENST00000453810 450 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
PDK4Q16654 AC013549.1-201ENST00000454086 566 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
PDK4Q16654 RCHY1-206ENST00000507014 650 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
PDK4Q16654 LACTB2-AS1-203ENST00000518553 817 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
PDK4Q16654 AP001893.1-201ENST00000532866 362 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
PDK4Q16654 C3orf14-207ENST00000542214 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
PDK4Q16654 AL162511.1-201ENST00000556542 879 ntTSL 4 BASIC5.81□□□□□ -1.48
PDK4Q16654 AC055874.1-201ENST00000561458 479 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
PDK4Q16654 AC026464.3-201ENST00000563634 564 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.81□□□□□ -1.48
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