Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 MRPL42P4-201ENST00000453267 443 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 BBIP1-208ENST00000454061 812 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 AL133477.1-201ENST00000457472 514 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 RNU7-27P-201ENST00000459281 62 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 AC026348.1-201ENST00000462549 1053 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 XACT-201ENST00000468762 497 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 MYL6P4-201ENST00000477911 453 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 AC025271.1-201ENST00000485045 429 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 AL079303.1-201ENST00000486611 463 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 SOX2-OT-210ENST00000487240 751 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 RPL21P42-201ENST00000488408 464 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 PGRMC2-204ENST00000503872 1028 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 AC021088.1-201ENST00000506519 805 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 LINC02057-202ENST00000511794 577 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 AC106800.2-201ENST00000514009 1103 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 AC090819.1-201ENST00000523800 1111 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 AP002004.1-202ENST00000528437 586 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 SSU72P6-201ENST00000532644 488 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 AC108471.2-203ENST00000532680 517 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 PHBP2-201ENST00000532859 806 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 PDCL2P2-201ENST00000533651 189 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 AC022075.2-201ENST00000535911 562 ntTSL 4 BASIC5.96□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 SDHAF2-205ENST00000537782 559 ntTSL 4 BASIC5.96□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 AC012464.1-201ENST00000550687 540 ntTSL 4 BASIC5.96□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 AC126323.4-201ENST00000566935 234 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 AC027801.5-201ENST00000574365 416 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 MTCYBP33-201ENST00000575007 1130 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 AC103808.1-201ENST00000579833 922 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 AC009303.2-206ENST00000588042 786 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 C10orf82-203ENST00000588184 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 ZNF397-211ENST00000592264 1104 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 PRR13P5-201ENST00000596581 442 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 BNIP3P4-201ENST00000604946 565 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 AC009283.1-201ENST00000615852 645 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 CU638689.4-205ENST00000623313 596 ntTSL 4 BASIC5.96□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 AC034229.6-201ENST00000623704 224 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 AC068620.4-201ENST00000636730 1182 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 AP002008.2-205ENST00000637111 1091 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 MFSD8-245ENST00000641743 948 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 OR2AK2-202ENST00000641852 1008 ntAPPRIS P2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 ZNF33B-201ENST00000359467 5958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 XRCC5-201ENST00000392132 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 AL589993.1-201ENST00000407450 2524 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 ADH7-202ENST00000437033 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 PEX13-201ENST00000295030 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 SEC62-201ENST00000337002 6568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 CASC19-284ENST00000642142 1868 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 DOCK4-216ENST00000494651 3282 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 EEF1A1P21-201ENST00000512363 1344 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 NFAT5-202ENST00000354436 13229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 PHF11-201ENST00000357596 1471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 CEACAM20-205ENST00000620096 1494 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 LRRC37B-220ENST00000584368 2773 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 OR52N5-202ENST00000641181 2778 ntAPPRIS P1 BASIC5.95□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 LCP1-201ENST00000323076 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 FRMD3-207ENST00000621208 5064 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 AC016251.2-201ENST00000623393 3089 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 TRPM6-204ENST00000449912 8244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 DNM1L-205ENST00000414834 4211 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 CPED1-206ENST00000450913 2501 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 EMCN-209ENST00000511970 1377 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 SLC25A46-208ENST00000513807 1546 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 VPS35P1-201ENST00000563400 1518 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 AC016907.2-203ENST00000455424 3563 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 ZNF507-203ENST00000544431 5764 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 NUMB-203ENST00000359560 3309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 GALNT5-201ENST00000259056 6171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 HESX1-201ENST00000295934 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 RPL12P13-201ENST00000310055 497 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 RNA5SP172-201ENST00000365061 118 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 C1orf194-203ENST00000369948 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 CACNB2-207ENST00000377329 3396 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 Y_RNA.465-201ENST00000384293 102 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 RN7SKP62-201ENST00000384539 329 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 OOSP1-201ENST00000398992 1270 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 STON1-202ENST00000406226 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 MRPL32P1-201ENST00000406301 247 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 RN7SKP254-201ENST00000410685 310 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 RNU4-72P-201ENST00000410754 173 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 AC096669.1-202ENST00000413708 616 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 LANCL1-AS1-201ENST00000416344 714 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 CD33-203ENST00000421133 1023 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 AC234064.1-201ENST00000436312 247 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 MTND4P32-201ENST00000437189 1237 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 AL583854.1-201ENST00000438818 613 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 AC005487.1-201ENST00000440208 665 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 ARAFP2-201ENST00000440565 559 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 AC009263.1-201ENST00000441193 1239 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 LINC00189-203ENST00000447125 783 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 GAPDHP16-201ENST00000448152 962 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 RHEBP2-201ENST00000450289 600 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 TMSB4X-204ENST00000451311 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 AC115989.1-202ENST00000452153 1150 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 Z99127.1-201ENST00000452442 670 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 NECAP1P2-201ENST00000455668 727 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 SCEL-AS1-201ENST00000456280 493 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 CCNJP2-201ENST00000457810 1163 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 SNORA81.1-201ENST00000458922 177 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 KCNIP2-211ENST00000461105 858 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 PABPC1P10-201ENST00000464731 381 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.3 ms