Protein–RNA interactions for Protein: Q14964

RAB39A, Ras-related protein Rab-39A, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB39AQ14964 AC024589.2-201ENST00000605642 1294 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
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RAB39AQ14964 AC244131.2-201ENST00000612592 512 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
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RAB39AQ14964 MARCH7-201ENST00000259050 5922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
RAB39AQ14964 FGF1-216ENST00000621536 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
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RAB39AQ14964 OR2J1-202ENST00000641659 2144 ntAPPRIS P1 BASIC6.05□□□□□ -1.44
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RAB39AQ14964 ZC3H7A-214ENST00000575984 2632 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
RAB39AQ14964 LINC01505-205ENST00000636028 2298 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
RAB39AQ14964 MCM10-202ENST00000378714 4547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
RAB39AQ14964 SSH2-204ENST00000540801 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
RAB39AQ14964 DCC-202ENST00000412726 9525 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
RAB39AQ14964 LCA5L-203ENST00000380671 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
RAB39AQ14964 KIF27-204ENST00000413982 4493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
RAB39AQ14964 EXD1-201ENST00000314992 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
RAB39AQ14964 AC010624.4-201ENST00000597606 1351 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
RAB39AQ14964 NRDC-213ENST00000539524 3417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
RAB39AQ14964 CCDC150-202ENST00000409270 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
RAB39AQ14964 AL157938.3-201ENST00000502188 3084 ntTSL 4 BASIC6.05□□□□□ -1.44
RAB39AQ14964 ZNF763-202ENST00000358987 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
RAB39AQ14964 PSG2-202ENST00000406487 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
RAB39AQ14964 AHNAK2-201ENST00000333244 18254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
RAB39AQ14964 NOL8-221ENST00000542053 3393 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
RAB39AQ14964 CYLD-201ENST00000311559 5371 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
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