Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

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Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 MCFD2-206ENST00000409800 3955 ntTSL 4 BASIC7.98□□□□□ -1.13
PTCH1Q13635 PDE4DIP-206ENST00000369356 8307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
PTCH1Q13635 DOCK11P1-201ENST00000553480 5932 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
PTCH1Q13635 ZPLD1-201ENST00000306176 3619 ntTSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
PTCH1Q13635 ZNF283-203ENST00000588797 2428 ntTSL 2 BASIC7.97□□□□□ -1.13
PTCH1Q13635 TGFBR3-207ENST00000525962 3927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
PTCH1Q13635 RNU1-77P-201ENST00000390868 162 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
PTCH1Q13635 LINC01798-203ENST00000428590 553 ntTSL 4 BASIC7.97□□□□□ -1.13
PTCH1Q13635 GSTA7P-201ENST00000438425 448 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
PTCH1Q13635 AL606490.8-201ENST00000441624 319 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
PTCH1Q13635 AC113349.1-201ENST00000512105 583 ntTSL 4 BASIC7.97□□□□□ -1.13
PTCH1Q13635 AC064807.2-201ENST00000521188 672 ntTSL 3 BASIC7.97□□□□□ -1.13
PTCH1Q13635 NOP10-202ENST00000557912 436 ntTSL 2 BASIC7.97□□□□□ -1.13
PTCH1Q13635 AC025580.2-202ENST00000558536 715 ntTSL 3 BASIC7.97□□□□□ -1.13
PTCH1Q13635 AC018558.3-201ENST00000567902 572 ntTSL 4 BASIC7.97□□□□□ -1.13
PTCH1Q13635 PPIAL4F-202ENST00000581138 660 ntAPPRIS P1 BASIC7.97□□□□□ -1.13
PTCH1Q13635 PPIAL4E-201ENST00000581164 785 ntAPPRIS P1 BASIC7.97□□□□□ -1.13
PTCH1Q13635 AC087763.1-201ENST00000603391 286 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
PTCH1Q13635 AC133644.2-201ENST00000608142 540 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
PTCH1Q13635 GOLT1B-210ENST00000631252 223 ntTSL 3 BASIC7.97□□□□□ -1.13
PTCH1Q13635 ODF2-205ENST00000393527 3653 ntTSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
PTCH1Q13635 PLEKHS1-205ENST00000369312 3443 ntTSL 2 BASIC7.97□□□□□ -1.13
PTCH1Q13635 OR2T29-202ENST00000641069 2637 ntAPPRIS P1 BASIC7.97□□□□□ -1.13
PTCH1Q13635 DOCK9-216ENST00000627024 4096 ntTSL 2 BASIC7.97□□□□□ -1.13
PTCH1Q13635 SEPT7-AS1-203ENST00000437235 3810 ntTSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
PTCH1Q13635 LRRC37B-204ENST00000543378 3091 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.97□□□□□ -1.13
PTCH1Q13635 NUP214-202ENST00000411637 7538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
PTCH1Q13635 GART-205ENST00000381839 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
PTCH1Q13635 NDUFS1-207ENST00000455934 3361 ntTSL 2 BASIC7.97□□□□□ -1.13
PTCH1Q13635 GABRR1-206ENST00000611484 3259 ntTSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
PTCH1Q13635 TMEM99-201ENST00000301665 2058 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.97□□□□□ -1.13
PTCH1Q13635 LINC02119-201ENST00000508853 2573 ntTSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
PTCH1Q13635 ADAMTS9-201ENST00000295903 7060 ntTSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
PTCH1Q13635 AC016251.2-201ENST00000623393 3089 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
PTCH1Q13635 DLGAP1-AS2-202ENST00000573177 1388 ntBASIC7.96□□□□□ -1.13
PTCH1Q13635 PLCB4-202ENST00000378473 5619 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
PTCH1Q13635 AL357153.1-201ENST00000500016 2941 ntTSL 2 BASIC7.96□□□□□ -1.13
PTCH1Q13635 TM9SF4-202ENST00000398022 3978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
PTCH1Q13635 ZNF658B-201ENST00000602828 3408 ntBASIC7.96□□□□□ -1.13
PTCH1Q13635 BMPR2-204ENST00000638587 3443 ntTSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.13
PTCH1Q13635 CEP128-202ENST00000281129 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
PTCH1Q13635 METTL8-217ENST00000612742 8132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.96□□□□□ -1.13
PTCH1Q13635 CTAGE5-217ENST00000557038 2869 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
PTCH1Q13635 ITGA9-AS1-202ENST00000420870 581 ntTSL 4 BASIC7.96□□□□□ -1.13
PTCH1Q13635 EIF2S2P3-201ENST00000428356 999 ntBASIC7.96□□□□□ -1.13
PTCH1Q13635 ITGA9-AS1-203ENST00000429532 702 ntTSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.13
PTCH1Q13635 AC009948.1-206ENST00000436616 1020 ntTSL 3 BASIC7.96□□□□□ -1.13
PTCH1Q13635 LDHAP2-201ENST00000437325 985 ntBASIC7.96□□□□□ -1.13
PTCH1Q13635 RN7SL51P-201ENST00000468230 285 ntBASIC7.96□□□□□ -1.13
PTCH1Q13635 RPS29P22-201ENST00000472363 168 ntBASIC7.96□□□□□ -1.13
PTCH1Q13635 FTH1P8-201ENST00000498161 514 ntBASIC7.96□□□□□ -1.13
PTCH1Q13635 AL049779.3-201ENST00000557141 606 ntBASIC7.96□□□□□ -1.13
PTCH1Q13635 MIR4646-201ENST00000580775 63 ntBASIC7.96□□□□□ -1.13
PTCH1Q13635 AC090403.1-204ENST00000582893 572 ntTSL 4 BASIC7.96□□□□□ -1.13
PTCH1Q13635 AP003175.1-201ENST00000641383 6658 ntBASIC7.96□□□□□ -1.13
PTCH1Q13635 IL16-204ENST00000394660 9616 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.96□□□□□ -1.13
PTCH1Q13635 ACACA-231ENST00000614428 9554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
PTCH1Q13635 TNKS-206ENST00000518281 3897 ntTSL 2 BASIC7.96□□□□□ -1.14
PTCH1Q13635 SH3D19-210ENST00000514152 5107 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.96□□□□□ -1.14
PTCH1Q13635 SIPA1L1-202ENST00000381232 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
PTCH1Q13635 RAPH1-209ENST00000439222 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
PTCH1Q13635 TXNRD1-205ENST00000503506 3930 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
PTCH1Q13635 OR2T7-201ENST00000641057 3463 ntAPPRIS P1 BASIC7.96□□□□□ -1.14
PTCH1Q13635 SLC7A6-209ENST00000566454 6308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
PTCH1Q13635 SUN3-203ENST00000412142 1448 ntTSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
PTCH1Q13635 MEPE-209ENST00000560249 2206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
PTCH1Q13635 ZNF418-212ENST00000616958 2212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
PTCH1Q13635 TOP2B-201ENST00000264331 5358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
PTCH1Q13635 USP9YP3-201ENST00000434481 1766 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
PTCH1Q13635 NELL2-201ENST00000333837 2943 ntTSL 2 BASIC7.96□□□□□ -1.14
PTCH1Q13635 LUZP2-201ENST00000336930 3553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
PTCH1Q13635 PCDH15-231ENST00000617271 6425 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
PTCH1Q13635 GTDC1-201ENST00000241391 2356 ntTSL 2 BASIC7.95□□□□□ -1.14
PTCH1Q13635 OR5H1-201ENST00000354565 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.95□□□□□ -1.14
PTCH1Q13635 MIR133B-201ENST00000362210 119 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
PTCH1Q13635 MIR141-201ENST00000384975 95 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
PTCH1Q13635 RN7SKP151-201ENST00000410230 316 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
PTCH1Q13635 AC034228.3-201ENST00000446275 562 ntTSL 3 BASIC7.95□□□□□ -1.14
PTCH1Q13635 AC105021.1-201ENST00000455347 590 ntTSL 3 BASIC7.95□□□□□ -1.14
PTCH1Q13635 PHC3-208ENST00000481639 1075 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
PTCH1Q13635 LINC00518-204ENST00000491317 1228 ntTSL 2 BASIC7.95□□□□□ -1.14
PTCH1Q13635 LINC01619-209ENST00000552277 571 ntTSL 4 BASIC7.95□□□□□ -1.14
PTCH1Q13635 OR1F2P-201ENST00000570470 933 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
PTCH1Q13635 AC011824.2-202ENST00000578602 533 ntTSL 4 BASIC7.95□□□□□ -1.14
PTCH1Q13635 AC100827.5-201ENST00000615883 426 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
PTCH1Q13635 OR5D13-201ENST00000623930 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.95□□□□□ -1.14
PTCH1Q13635 SAMMSON-209ENST00000641222 1100 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
PTCH1Q13635 NDRG3-201ENST00000349004 2964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
PTCH1Q13635 NOSTRIN-207ENST00000445023 1569 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
PTCH1Q13635 SORBS2-230ENST00000448662 4356 ntTSL 2 BASIC7.95□□□□□ -1.14
PTCH1Q13635 MFSD8-219ENST00000641228 2559 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
PTCH1Q13635 FER1L6-201ENST00000522917 6051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
PTCH1Q13635 NLRP11-201ENST00000589093 3417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
PTCH1Q13635 MDM4-217ENST00000621032 5592 ntTSL 2 BASIC7.95□□□□□ -1.14
PTCH1Q13635 ANKRD12-203ENST00000400020 9115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
PTCH1Q13635 FAM160A1-203ENST00000505231 4156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
PTCH1Q13635 SEC31A-226ENST00000508479 3397 ntTSL 2 BASIC7.95□□□□□ -1.14
PTCH1Q13635 CDKL4-201ENST00000378803 1567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
PTCH1Q13635 PIH1D2-201ENST00000280350 1241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
PTCH1Q13635 PRB3-201ENST00000381842 1091 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
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